DNMT1

Infotaula de genDNMT1
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe RCSB
Llista de codis id de PDB

4YOC, 3EPZ, 3PTA, 3SWR, 4WXX

Identificadors
ÀliesDNMT1 (HUGO), ADCADN, AIM, CXXC9, DNMT, HSN1E, MCMT, m.HsaI, DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 1, DNA methyltransferase 1
IDs externesOMIM: 126375   MGI: 94912   HomoloGene: 124071   GeneCards: DNMT1   OMA: DNMT1 - orthologs
Localització del gen (humà)
Cromosoma 19 (humà)
Crom.Cromosoma 19 (humà)[1]
Cromosoma 19 (humà)
Localització genòmica per DNMT1
Localització genòmica per DNMT1
Banda19p13.2Inici10.133.342 bp[1]
Fi10.231.286 bp[1]
Localització del gen (ratolí)
Cromosoma 9 (ratolí)
Crom.Cromosoma 9 (ratolí)[2]
Cromosoma 9 (ratolí)
Localització genòmica per DNMT1
Localització genòmica per DNMT1
Banda9 A3|9 7.66 cMInici20.818.505 bp[2]
Fi20.871.184 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
HumàRatolí (ortòleg)
Més explicacions
  • oòcit Podeu corregir-lo

  • secondary oocyte Podeu traduir-lo

  • nervi sural Podeu corregir-lo

  • ventricular zone Podeu traduir-lo

  • eminència ganglionar Podeu corregir-lo

  • bone marrow cells Podeu traduir-lo

  • apèndix vermiforme

  • cerebellar hemisphere Podeu traduir-lo

  • right hemisphere of cerebellum Podeu traduir-lo

  • tendó d'Aquil·les
Més explicacions
Més dades d'expressió de referència
BioGPS
Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica
Funció molecular
  • methyltransferase activity Podeu traduir-lo
  • DNA binding Podeu traduir-lo
  • transferase activity Podeu traduir-lo
  • promoter-specific chromatin binding Podeu traduir-lo
  • methyl-CpG binding Podeu traduir-lo
  • zinc ion binding Podeu traduir-lo
  • DNA-methyltransferase activity Podeu traduir-lo
  • chromatin binding Podeu traduir-lo
  • metal ion binding Podeu traduir-lo
  • unió proteica 
  • RNA binding Podeu traduir-lo
  • DNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity Podeu traduir-lo
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Podeu traduir-lo
Component cel·lular
  • pericentric heterochromatin Podeu traduir-lo
  • replication fork Podeu traduir-lo
  • nucleoplasma 
  • Heterocromatina 
  • nucli cel·lular 
Procés biològic
  • C-5 metalització de citosina Podeu corregir-lo
  • regulació de la transcripció, modelat amb ADN Podeu corregir-lo
  • maintenance of DNA methylation Podeu traduir-lo
  • positive regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly Podeu traduir-lo
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II Podeu traduir-lo
  • transcripció, plantilla d'ADN Podeu corregir-lo
  • metilació 
  • Metilació de l'ADN 
  • positive regulation of gene expression Podeu traduir-lo
  • negative regulation of gene expression, epigenetic Podeu traduir-lo
  • positive regulation of histone H3-K4 methylation Podeu traduir-lo
  • regulation of cell population proliferation Podeu traduir-lo
  • negative regulation of histone H3-K9 methylation Podeu traduir-lo
  • cellular response to amino acid stimulus Podeu traduir-lo
  • regulació de l'expressió gènica 
  • Ras protein signal transduction Podeu traduir-lo
  • negative regulation of transcription, DNA-templated Podeu traduir-lo
  • DNA methylation on cytosine Podeu traduir-lo
  • DNA methylation involved in embryo development Podeu traduir-lo
  • chromatin organization Podeu traduir-lo
  • DNA methylation on cytosine within a CG sequence Podeu traduir-lo
  • negative regulation of gene expression Podeu traduir-lo
  • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation Podeu traduir-lo
  • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell apoptotic process Podeu traduir-lo
  • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation involved in phenotypic switching Podeu traduir-lo
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

1786

13433

Ensembl

ENSG00000130816

ENSMUSG00000004099

UniProt

P26358

P13864

RefSeq (ARNm)

NM_001130823
NM_001379
NM_001318730
NM_001318731

NM_001199431
NM_001199432
NM_001199433
NM_010066
NM_001314011

RefSeq (proteïna)

NP_001124295
NP_001305659
NP_001305660
NP_001370

NP_001186360
NP_001186361
NP_001186362
NP_001300940
NP_034196

NP_001391614

Localització (UCSC)Chr 19: 10.13 – 10.23 MbChr 9: 20.82 – 20.87 Mb
Cerca a PubMed[3][4]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí

DNMT1 (o ADN (citosina-5)-metiltransferasa 1) és un enzim que en els éssers humans està codificat pel gen DNMT1.[5] És un enzim amb alta afinitat per les seqüències Hemimetilades i que té un paper molt important en el manteniment del patrons de metilació després del procés de replicació de l'ADN. També s'ha observat que pot metilar de novo residus no modificats.

Funció

El gen DNMT1 s'expressa en tots el teixits, encara que els nivells més alts de mRNA es troben als testicles, aquest fet es relaciona amb la seva funcionalitat ja que està implicat en l'establiment i la regulació de patrons de metilació de citosines. La metilació CpG del DNA es un via de modificació epigenètica molt important als processos embriogènics, impressió genètica i inactivació del cromosoma X.

Estructura del gen DNMT1

El gen DNMT1 se situa en el cromosoma 19, a la posició 13.2 i està constituït per 40 exons.[5][6]

D'aquest gen s'han detectat 25 polimorfismes de corresponents a un sol nucleòtid.[5]

El splicing alternatiu dona com a resultat múltiples variants de transcripció.

Patologia associada

Existeix una relació entre els patrons de metilació aberrants trobats en diversos teixits tumorals i mutacions en el gen sintetitzador d'aquest enzim. A més a més la variació en aquest gen s'ha associat amb la atàxia cerebel·losa, sordera, narcolepsia, neuropaties sensorials hereditàries de tipus IE.

Referències

  1. 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000130816 - Ensembl, May 2017
  2. 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000004099 – Ensembl, May 2017
  3. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. 5,0 5,1 5,2 «DNMT1 DNA methyltransferase 1 [Homo sapiens (human) - Gene - NCBI]». [Consulta: 7 novembre 2020].
  6. «UniProtKB - P26358 (DNMT1_HUMAN)» (en anglès). UniProt. [Consulta: 7 novembre 2020].