ERCC1

Infotaula de genERCC1
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe RCSB
Llista de codis id de PDB

1Z00, 2A1I, 2A1J, 2JNW, 2JPD, 2MUT

Identificadors
ÀliesERCC1, COFS4, RAD10, UV20, excision repair cross-complementation group 1, ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit
IDs externesOMIM: 126380   MGI: 95412   HomoloGene: 1501   GeneCards: ERCC1   OMA: ERCC1 - orthologs
Localització del gen (humà)
Cromosoma 19 (humà)
Crom.Cromosoma 19 (humà)[1]
Cromosoma 19 (humà)
Localització genòmica per ERCC1
Localització genòmica per ERCC1
Banda19q13.32Inici45.407.333 bp[1]
Fi45.478.828 bp[1]
Localització del gen (ratolí)
Cromosoma 7 (ratolí)
Crom.Cromosoma 7 (ratolí)[2]
Cromosoma 7 (ratolí)
Localització genòmica per ERCC1
Localització genòmica per ERCC1
Banda7 A3|7 9.6 cMInici19.078.703 bp[2]
Fi19.090.449 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
HumàRatolí (ortòleg)
Més explicacions
  • apex of heart Podeu traduir-lo

  • paròtide

  • right auricle Podeu traduir-lo

  • ventricle esquerre

  • eminència ganglionar Podeu corregir-lo

  • left ovary Podeu traduir-lo

  • ventricular zone Podeu traduir-lo

  • muscle of thigh Podeu traduir-lo

  • right ovary Podeu traduir-lo

  • stromal cell of endometrium Podeu traduir-lo
Més explicacions
Més dades d'expressió de referència
BioGPS


Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica
Funció molecular
  • protein domain specific binding Podeu traduir-lo
  • single-stranded DNA binding Podeu traduir-lo
  • damaged DNA binding Podeu traduir-lo
  • single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity Podeu traduir-lo
  • protein C-terminus binding Podeu traduir-lo
  • unió proteica 
  • TFIID-class transcription factor complex binding Podeu traduir-lo
  • nuclease activity Podeu traduir-lo
  • endonuclease activity Podeu traduir-lo
  • activitat hidrolasa Podeu corregir-lo
  • 3' overhang single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity Podeu traduir-lo
  • DNA binding Podeu traduir-lo
Component cel·lular
  • ERCC4-ERCC1 complex Podeu traduir-lo
  • transcription factor TFIID complex Podeu traduir-lo
  • nucleoplasma 
  • nucleotide-excision repair factor 1 complex Podeu traduir-lo
  • nucleotide-excision repair complex Podeu traduir-lo
  • nucli cel·lular 
  • citoplasma 
  • citosol 
Procés biològic
  • germ cell development Podeu traduir-lo
  • DNA recombination Podeu traduir-lo
  • male gonad development Podeu traduir-lo
  • interstrand cross-link repair Podeu traduir-lo
  • positive regulation of t-circle formation Podeu traduir-lo
  • cell development Podeu traduir-lo
  • response to nutrient Podeu traduir-lo
  • multicellular organism growth Podeu traduir-lo
  • embryonic organ development Podeu traduir-lo
  • post-embryonic hemopoiesis Podeu traduir-lo
  • syncytium formation Podeu traduir-lo
  • response to oxidative stress Podeu traduir-lo
  • chromosome organization Podeu traduir-lo
  • pyrimidine dimer repair by nucleotide-excision repair Podeu traduir-lo
  • ovogènesi 
  • cellular response to DNA damage stimulus Podeu traduir-lo
  • global genome nucleotide-excision repair Podeu traduir-lo
  • canvi de classe d'immunoglobulina 
  • espermatogènesi 
  • multicellular organism aging Podeu traduir-lo
  • UV protection Podeu traduir-lo
  • t-circle formation Podeu traduir-lo
  • negative regulation of telomere maintenance Podeu traduir-lo
  • transcription-coupled nucleotide-excision repair Podeu traduir-lo
  • mitotic recombination Podeu traduir-lo
  • proliferació cel·lular 
  • nucleotide-excision repair, DNA incision Podeu traduir-lo
  • response to X-ray Podeu traduir-lo
  • response to sucrose Podeu traduir-lo
  • Reparació per excisió de nucleòtid 
  • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization Podeu traduir-lo
  • double-strand break repair Podeu traduir-lo
  • reparació de l'ADN 
  • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion Podeu traduir-lo
  • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion Podeu traduir-lo
  • meiotic mismatch repair Podeu traduir-lo
  • double-strand break repair via nonhomologous end joining Podeu traduir-lo
  • UV-damage excision repair Podeu traduir-lo
  • negative regulation of protection from non-homologous end joining at telomere Podeu traduir-lo
  • telomeric DNA-containing double minutes formation Podeu traduir-lo
  • response to immobilization stress Podeu traduir-lo
  • response to cadmium ion Podeu traduir-lo
  • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis Podeu traduir-lo
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

2067

13870

Ensembl

ENSG00000012061

ENSMUSG00000003549

UniProt

P07992

P07903

RefSeq (ARNm)

NM_001166049
NM_001983
NM_202001

NM_001127324
NM_007948

RefSeq (proteïna)
NP_001159521
NP_001974
NP_973730
NP_001356337
NP_001356338

NP_001356339
NP_001356340
NP_001356341
NP_001356342
NP_001356343
NP_001356344
NP_001356345
NP_001356346
NP_001356347
NP_001356348

NP_001120796
NP_031974

Localització (UCSC)Chr 19: 45.41 – 45.48 MbChr 7: 19.08 – 19.09 Mb
Cerca a PubMed[3][4]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí
Infotaula de proteïnaERCC1
Substànciagen Modifica el valor a Wikidata
Identificadors
SímbolERCC1
HUGO3433
Entrez2067
OMIM126380
RefSeqNM_001983
P07992
PDB1z00

La proteïna de reparació per escissió del grup de complementació creuada 1, també coneguda com a ERCC1 (de l'anglès, Excision-Repair, Complementing Defective, in Chinese Hamter, 1)

Bibliografia

  • Olaussen KA, Mountzios G, Soria JC «ERCC1 as a risk stratifier in platinum-based chemotherapy for nonsmall-cell lung cancer.». Current opinion in pulmonary medicine, 13, 4, 2007, pàg. 284-9. DOI: 10.1097/MCP.0b013e32816b5c63. PMID: 17534174.
  • van Duin M, de Wit J, Odijk H, 'et al.' «Molecular characterization of the human excision repair gene ERCC-1: cDNA cloning and amino acid homology with the yeast DNA repair gene RAD10.». Cell, 44, 6, 1986, pàg. 913-23. PMID: 2420469.
  • van Duin M, van Den Tol J, Hoeijmakers JH, 'et al.' «Conserved pattern of antisense overlapping transcription in the homologous human ERCC-1 and yeast RAD10 DNA repair gene regions.». Mol. Cell. Biol., 9, 4, 1989, pàg. 1794-8. PMID: 2471070.
  • Hoeijmakers JH «Characterization of genes and proteins involved in excision repair of human cells.». J. Cell Sci. Suppl., 6, 1987, pàg. 111-25. PMID: 2821019.
  • Hoeijmakers JH, van Duin M, Westerveld A, 'et al.' «Identification of DNA repair genes in the human genome.». Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol., 51 Pt 1, 1987, pàg. 91-101. PMID: 3034490.
  • van Duin M, van den Tol J, Warmerdam P, 'et al.' «Evolution and mutagenesis of the mammalian excision repair gene ERCC-1.». Nucleic Acids Res., 16, 12, 1988, pàg. 5305-22. PMID: 3290851.
  • Westerveld A, Hoeijmakers JH, van Duin M, 'et al.' «Molecular cloning of a human DNA repair gene.». Nature, 310, 5976, 1984, pàg. 425-9. PMID: 6462228.
  • Nagai A, Saijo M, Kuraoka I, 'et al.' «Enhancement of damage-specific DNA binding of XPA by interaction with the ERCC1 DNA repair protein.». Biochem. Biophys. Res. Commun., 211, 3, 1995, pàg. 960-6. PMID: 7598728.
  • Li L, Elledge SJ, Peterson CA, 'et al.' «Specific association between the human DNA repair proteins XPA and ERCC1.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 91, 11, 1994, pàg. 5012-6. PMID: 8197174.
  • Park CH, Sancar A «Formation of a ternary complex by human XPA, ERCC1, and ERCC4(XPF) excision repair proteins.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 91, 11, 1994, pàg. 5017-21. PMID: 8197175.
  • McWhir J, Selfridge J, Harrison DJ, 'et al.' «Mice with DNA repair gene (ERCC-1) deficiency have elevated levels of p53, liver nuclear abnormalities and die before weaning.». Nat. Genet., 5, 3, 1994, pàg. 217-24. DOI: 10.1038/ng1193-217. PMID: 8275084.
  • Trask B, Fertitta A, Christensen M, 'et al.' «Fluorescence in situ hybridization mapping of human chromosome 19: cytogenetic band location of 540 cosmids and 70 genes or DNA markers.». Genomics, 15, 1, 1993, pàg. 133-45. PMID: 8432525.
  • Yu JJ, Mu C, Lee KB, 'et al.' «A nucleotide polymorphism in ERCC1 in human ovarian cancer cell lines and tumor tissues.». Mutat. Res., 382, 1-2, 1997, pàg. 13-20. PMID: 9360634.
  • Hayashi T, Takao M, Tanaka K, Yasui A «ERCC1 mutations in UV-sensitive Chinese hamster ovary (CHO) cell lines.». Mutat. Res., 407, 3, 1998, pàg. 269-76. PMID: 9653453.
  • de Laat WL, Sijbers AM, Odijk H, 'et al.' «Mapping of interaction domains between human repair proteins ERCC1 and XPF.». Nucleic Acids Res., 26, 18, 1998, pàg. 4146-52. PMID: 9722633.
  • Lin YW, Kubota M, Koishi S, 'et al.' «Analysis of mutations at the DNA repair genes in acute childhood leukaemia.». Br. J. Haematol., 103, 2, 1998, pàg. 462-6. PMID: 9827920.
  • Houtsmuller AB, Rademakers S, Nigg AL, 'et al.' «Action of DNA repair endonuclease ERCC1/XPF in living cells.». Science, 284, 5416, 1999, pàg. 958-61. PMID: 10320375.
  • Cheng L, Guan Y, Li L, 'et al.' «Expression in normal human tissues of five nucleotide excision repair genes measured simultaneously by multiplex reverse transcription-polymerase chain reaction.». Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev., 8, 9, 1999, pàg. 801-7. PMID: 10498399.
  • Yu JJ, Thornton K, Guo Y, 'et al.' «An ERCC1 splicing variant involving the 5'-UTR of the mRNA may have a transcriptional modulatory function.». Oncogene, 20, 52, 2002, pàg. 7694-8. DOI: 10.1038/sj.onc.1204977. PMID: 11753647.
  • Li QQ, Yunmbam MK, Zhong X, 'et al.' «Lactacystin enhances cisplatin sensitivity in resistant human ovarian cancer cell lines via inhibition of DNA repair and ERCC-1 expression.». Cell. Mol. Biol. (Noisy-le-grand), 47 Online Pub, 2002, pàg. OL61-72. PMID: 11936875.
  1. 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000012061 - Ensembl, May 2017
  2. 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000003549 – Ensembl, May 2017
  3. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.