RNF12 |
---|
|
|
---|
Àlies | RLIM (HUGO), NY-REN-43, RNF12, ring finger protein, LIM domain interacting, MRX61, TOKAS |
---|
Identif. externs | OMIM 300379 MGI 1342291 HomoloGene: 7920 GeneCards: RLIM OMA: RLIM - orthologs |
---|
Localització del gen (humà) |
---|
![Cromosoma X (humà)](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/18/Ideogram_human_chromosome_X.svg/300px-Ideogram_human_chromosome_X.svg.png) | Crom. | Cromosoma X (humà)[1] |
---|
| Banda | Xq13.2 | Inici | 74.582.976 bp[1] |
---|
Fi | 74.614.624 bp[1] |
---|
|
Localització del gen (ratolí) |
---|
![Cromosoma X (ratolí)](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/59/Ideogram_house_mouse_chromosome_X.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_X.svg.png) | Crom. | Cromosoma X (ratolí)[2] |
---|
| Banda | X 46.42 cM|X D | Inici | 103.000.769 bp[2] |
---|
Fi | 103.024.890 bp[2] |
---|
|
Patró d'expressió d'ARN |
---|
Bgee | humà | ratolí (ortòleg) |
---|
Més explicacions | - middle temporal gyrus
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- cartilage tissue
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- tendó d'Aquil·les
- Brodmann area 46
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- Gir postcentral
- internal globus pallidus
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- entorhinal cortex
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- Brodmann area 23
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- tendon of biceps brachii
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- Pars compacta
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
|
| | Més dades d'expressió de referència |
|
---|
BioGPS | |
---|
|
Ontologia genètica |
---|
Funció molecular | - transcription corepressor activity
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - metal ion binding
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - transferase activity
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - ubiquitin-protein transferase activity
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - ubiquitin protein ligase activity
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - unió proteica
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f6/Wiki_article_small_light.svg/10px-Wiki_article_small_light.svg.png) | Component cel·lular | - transcription repressor complex
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - nucli cel·lular
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f6/Wiki_article_small_light.svg/10px-Wiki_article_small_light.svg.png) - citosol
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f6/Wiki_article_small_light.svg/10px-Wiki_article_small_light.svg.png) - nucleoplasma
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f6/Wiki_article_small_light.svg/10px-Wiki_article_small_light.svg.png) | Procés biològic | - negative regulation of transcription, DNA-templated
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - transcripció, plantilla d'ADN
![Podeu corregir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/32/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg/10px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg.png) - protein ubiquitination
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - protein polyubiquitination
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - regulació de la transcripció, modelat amb ADN
![Podeu corregir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/32/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg/10px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg.png) - negative regulation of transcription by RNA polymerase II
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - ubiquitin-dependent protein catabolic process
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - random inactivation of X chromosome
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - regulation of dosage compensation by inactivation of X chromosome
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) | Fonts:Amigo / QuickGO |
|
|
Wikidata |
Veure/Editar Humà | Veure/Editar Ratolí |
|
La lligasa RLIM de proteïna-ubiqüitina E3 (en anglès: E3 ubiquitin-protein ligase RLIM) és un enzim que en humans està codificat pel gen RLIM.[5][6]
La proteïna codificada per aquest gen és un dit de zinc RING-H2. Segons han observat els científics, es tracta d'una lligasa d'ubiqüitina que té com a diana el domini d'unió LIM 1 (LDB1/CLIM), i provoca una degradació proteasòmica de LDB1. Tant RLIM com LDB1 són co-repressors de LHX1/LIM-1, un factor de transcripció homeodomini. S'han descrit variants transcripcionals per splicing alternatiu que codifiquen per la mateixa proteïna.[6]
Rnf12 té un paper important al procés de la inactivació del cromosoma X, i està regulat negativament per factors de pluripotència en cèl·lules mare embrionàries. [7]
Interaccions
S'ha demostrat la interacció de RNF12 amb receptor d'estrogen alfa.[8]
Referències
- ↑ 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000131263 - Ensembl, May 2017
- ↑ 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000056537 – Ensembl, May 2017
- ↑ «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ↑ «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ↑ Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jager D, Jager E, Knuth A, Chen YT, Old LJ «Antigens recognized by autologous antibody in patients with renal-cell carcinoma». Int J Cancer, 83, 4, Novembre 1999, pàg. 456–464. DOI: 10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5. PMID: 10508479.
- ↑ 6,0 6,1 «Entrez Gene: RNF12 ring finger protein 12».
- ↑ Navarro, P.; Moffat, M.; Mullin, N.P.; Chambers, I. «The X-inactivation trans-activator Rnf12 is negatively regulated by pluripotency factors in embryonic stem cells». Hum Genet, 130, 2, 2011, pàg. 255-64. DOI: 10.1007/s00439-011-0998-5 [Consulta: 2 agost 2013].
- ↑ Johnsen, Steven A; Güngör Cenap, Prenzel Tanja, Riethdorf Sabine, Riethdorf Lutz, Taniguchi-Ishigaki Naoko, Rau Thomas, Tursun Baris, Furlow J David, Sauter Guido, Scheffner Martin, Pantel Klaus, Gannon Frank, Bach Ingolf «Regulation of estrogen-dependent transcription by the LIM cofactors CLIM and RLIM in breast cancer». Cancer Res. [United States], 69, 1, Gener 2009, pàg. 128–136. DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-08-1630. PMC: 2713826. PMID: 19117995.
Bibliografia
- Rual JF; Hirozane-Kishikawa, Tomoko; Dricot, Amélie; Li, Ning; Berriz, Gabriel F.; Gibbons, Francis D.; Dreze, Matija; Venkatesan K; Hao T; 3 «Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network». Nature, 437, 7062, 2005, pàg. 1173–1178. DOI: 10.1038/nature04209. PMID: 16189514.
- Ota T; Otsuki, Tetsuji; Sugiyama, Tomoyasu; Irie, Ryotaro; Wakamatsu, Ai; Hayashi, Koji; Sato, Hiroyuki; Suzuki Y; Nishikawa T; 3 «Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs». Nat. Genet., 36, 1, 2004, pàg. 40–45. DOI: 10.1038/ng1285. PMID: 14702039.
- Hiratani I; Ohmori, SY; Taira, M; Yamamoto N; Mochizuki T; 3 «Selective degradation of excess Ldb1 by Rnf12/RLIM confers proper Ldb1 expression levels and Xlim-1/Ldb1 stoichiometry in Xenopus organizer functions». Development, 130, 17, 2003, pàg. 4161–4175. DOI: 10.1242/dev.00621. PMID: 12874135.
- Strausberg RL; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, GD; Feingold EA; Grouse LH; 3 «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 99, 26, 2003, pàg. 16899–16903. DOI: 10.1073/pnas.242603899. PMC: 139241. PMID: 12477932.
- Ostendorff HP; Schlüter, Anne; Bossenz, Michael; Scheffner, Martin; Bach, Ingolf; Peirano RI; Peters MA; 3 «Ubiquitination-dependent cofactor exchange on LIM homeodomain transcription factors». Nature, 416, 6876, 2002, pàg. 99–103. DOI: 10.1038/416099a. PMID: 11882901.
- Ostendorff HP; Copeland, NG; Gilbert, DJ; Jenkins, NA; Lichter, P; Bach, I; Bossenz M; Mincheva A; 3 «Functional characterization of the gene encoding RLIM, the correpressor of LIM homeodomain factors». Genomics, 69, 1, 2001, pàg. 120–130. DOI: 10.1006/geno.2000.6311. PMID: 11013082.
- Bach I; Rodriguez-Esteban, Concepción; Carrière, Catherine; Bhushan, Anil; Krones, Anna; Rose, David W.; Glass, Christopher K.; Rodriguez-Esteban C; Carrière C; 3 «RLIM inhibits functional activity of LIM homeodomain transcription factors via recruitment of the histone deacetylase complex». Nat. Genet., 22, 4, 1999, pàg. 394–399. DOI: 10.1038/11970. PMID: 10431247.