Molekulární marker
Molekulární marker (molekulární identifikační znak) je cíleně či náhodně vybraná informace o vzorku, nejčastěji biologickém materiálu, která byla získána prostřednictvím analýzy jeho molekul.
Příkladem molekulárního markeru může být náboj molekuly enzymu, pořadí nukleotidů v sekvenci DNA, či délka fragmentu DNA. Tyto znaky mohou být specifické na různých úrovních (pro konkrétní jedince, přes populace až po všechny organismy), mají proto všestranné využití zejména v lékařství a přírodních vědách. Na příklad specifické oblasti DNA se používají k diagnostice autosomální recesivní genetické poruchy cystické fibrózy[1], další diagnostické testy (např. pro komplexní neurodegenerativní onemocnění, Alzheimerovu chorobu), využívají i analýzu proteinů[2]. Dalším z uplatnění molekulárních markerů je zjištění příbuznosti (ať již pro forenzní, či vědecké účely).
Nejběžněji používané molekulární markery
- Izoenzymy - tedy enzymy mající stejnou funkci, ale jinou strukturu, lze vzájemně odlišit prostřednictvím gelové elektroforézy.
- Genetické (DNA) markery
- RFLP (Polymorfismus délky restrikčních fragmentů)
- analýza fragmentů DNA (založené na PCR)
- RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)
- AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism)
- ISSRs (Inter Simple Sequence Repeats)
- PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction – RFLP)
- mikrosatelity (Simple Sequence Repeats – SSRs)
- SCP (Single Strain Conformation Polymorphism)
- celogenomové markery (založené na sekvenaci DNA)
- SNP (Jednonukleotidový polymorfismus)
- HybSeq
- RADseq
Reference
- ↑ BRADLEY, Linda A.; JOHNSON, Dorene A.; CHAPARRO, Carlos A.; ROBERTSON, Nancy H.; FERRIE, Richard M. A Multiplex ARMS Test for 10 Cystic Fibrosis (CF) Mutations: Evaluation in a Prenatal CF Screening Program. Genetic Testing. Leden 1998, roč. 2, čís. 4, s. 337–341. DOI 10.1089/gte.1998.2.337. (anglicky)
- ↑ CHOE, Leila H.; DUTT, Michael J.; RELKIN, Norman; LEE, Kelvin H. Studies of potential cerebrospinal fluid molecular markers for Alzheimer's disease. Electrophoresis. Červen 2002, roč. 23, čís. 14, s. 2247–2251. DOI 10.1002/1522-2683(200207)23:14<2247::aid-elps2247>3.0.co;2-m. PMID 12210229. (anglicky)
Externí odkazy
- Virtual Learning Environment (Institute of Lifelong Learning, University of Delhi) - přehled metod (anglicky)
- Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin - výukové materiály Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy
- Izolace DNA a genetické markery - wikiskripta
- Aplikace molekulární biologie v lesnictví - molekulární markery
![]() | Tento článek je příliš stručný nebo postrádá důležité informace. Pomozte Wikipedii tím, že jej vhodně rozšíříte. Nevkládejte však bez oprávnění cizí texty. |