Basonucline 2

BNC2
Identifiants
AliasesBNC2
IDs externesOMIM: 608669 MGI: 2443805 HomoloGene: 18243 GeneCards: BNC2
Position du gène (Homme)
Chromosome 9 humain
Chr.Chromosome 9 humain[1]
Chromosome 9 humain
Localisation génomique pour BNC2
Localisation génomique pour BNC2
Locus9p22.3-p22.2Début16,409,503 bp[1]
Fin16,870,843 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 4 (souris)
Chr.Chromosome 4 (souris)[2]
Chromosome 4 (souris)
Localisation génomique pour BNC2
Localisation génomique pour BNC2
Locus4|4 C3- C4Début84,193,332 bp[2]
Fin84,593,512 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • germinal epithelium

  • nerf sural

  • parietal pleura

  • epithelium of colon

  • follicule pileux

  • buccal mucosa cell

  • left ovary

  • right ovary

  • Myomètre

  • testicule
Fortement exprimé dans
  • zygote

  • ovocyte

  • secondary oocyte

  • primary oocyte

  • crête génitale

  • canal déférent

  • nerf ischiatique

  • lumbar spinal ganglion

  • main

  • Ganglion de Gasser
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison ion métal
  • liaison ADN
  • Fixation d'acide nucléique
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Composant cellulaire
  • noyau
  • nucléoplasme
  • membrane plasmique
  • cytosol
Processus biologique
  • tongue development
  • endochondral bone growth
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • mesenchyme development
  • roof of mouth development
  • transcription, DNA-templated
  • regulation of transcription by RNA polymerase II
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

54796

242509

Ensembl

ENSG00000173068

ENSMUSG00000028487

UniProt

Q6ZN30
Q06HC2

Q8BMQ3

RefSeq (mRNA)

NM_017637
NM_001317939
NM_001317940

NM_172870
NM_001369081
NM_001369082
NM_001369083
NM_001369084

RefSeq (protéine)

NP_001304868
NP_001304869
NP_060107

NP_766458
NP_001356010
NP_001356011
NP_001356012
NP_001356013

Localisation (UCSC)Chr 9: 16.41 – 16.87 MbChr 4: 84.19 – 84.59 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

La basonucline 2 est une protéine à doigt de zinc encodée chez l'humain par le gène BNC2[5],[6].

Ce gène BNC2, hérité de l'Homme de Néandertal, a contribué à l'adaptation des populations européennes aux climats froids en influençant la pigmentation de la peau[7],[8].

Voir aussi

Notes et références

  • (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Zinc finger protein basonuclin-2 » (voir la liste des auteurs).
  1. ↑ a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000173068 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028487 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. ↑ « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. ↑ Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, Otsuki T, Sugiyama T, Irie R, Wakamatsu A, Hayashi K, Sato H, Nagai K, Kimura K, Makita H, Sekine M, Obayashi M, Nishi T, Shibahara T, Tanaka T, Ishii S, Yamamoto J, Saito K, Kawai Y, Isono Y, Nakamura Y, Nagahari K, Murakami K, Yasuda T, Iwayanagi T, Wagatsuma M, Shiratori A, Sudo H, Hosoiri T, Kaku Y, Kodaira H, Kondo H, Sugawara M, Takahashi M, Kanda K, Yokoi T, Furuya T, Kikkawa E, Omura Y, Abe K, Kamihara K, Katsuta N, Sato K, Tanikawa M, Yamazaki M, Ninomiya K, Ishibashi T, Yamashita H, Murakawa K, Fujimori K, Tanai H, Kimata M, Watanabe M, Hiraoka S, Chiba Y, Ishida S, Ono Y, Takiguchi S, Watanabe S, Yosida M, Hotuta T, Kusano J, Kanehori K, Takahashi-Fujii A, Hara H, Tanase TO, Nomura Y, Togiya S, Komai F, Hara R, Takeuchi K, Arita M, Imose N, Musashino K, Yuuki H, Oshima A, Sasaki N, Aotsuka S, Yoshikawa Y, Matsunawa H, Ichihara T, Shiohata N, Sano S, Moriya S, Momiyama H, Satoh N, Takami S, Terashima Y, Suzuki O, Nakagawa S, Senoh A, Mizoguchi H, Goto Y, Shimizu F, Wakebe H, Hishigaki H, Watanabe T, Sugiyama A, Takemoto M, Kawakami B, Yamazaki M, Watanabe K, Kumagai A, Itakura S, Fukuzumi Y, Fujimori Y, Komiyama M, Tashiro H, Tanigami A, Fujiwara T, Ono T, Yamada K, Fujii Y, Ozaki K, Hirao M, Ohmori Y, Kawabata A, Hikiji T, Kobatake N, Inagaki H, Ikema Y, Okamoto S, Okitani R, Kawakami T, Noguchi S, Itoh T, Shigeta K, Senba T, Matsumura K, Nakajima Y, Mizuno T, Morinaga M, Sasaki M, Togashi T, Oyama M, Hata H, Watanabe M, Komatsu T, Mizushima-Sugano J, Satoh T, Shirai Y, Takahashi Y, Nakagawa K, Okumura K, Nagase T, Nomura N, Kikuchi H, Masuho Y, Yamashita R, Nakai K, Yada T, Nakamura Y, Ohara O, Isogai T, Sugano S, « Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs », Nature Genetics, vol. 36, no 1,‎ , p. 40–5 (PMID 14702039, DOI 10.1038/ng1285)
  6. ↑ « Entrez Gene: BNC2 basonuclin 2 »
  7. ↑ Jacobs LC, Wollstein A, Lao O, Hofman A, Klaver CC, Uitterlinden AG, Nijsten T, Kayser M, Liu F, « Comprehensive candidate gene study highlights UGT1A and BNC2 as new genes determining continuous skin color variation in Europeans », Human Genetics, vol. 132, no 2,‎ , p. 147–58 (PMID 23052946, DOI 10.1007/s00439-012-1232-9)
  8. ↑ Vattathil S, Akey JM, « Small Amounts of Archaic Admixture Provide Big Insights into Human History », Cell, vol. 163, no 2,‎ , p. 281–4 (PMID 26451479, DOI 10.1016/j.cell.2015.09.042)
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