VCAM-1

VCAM1
사용 가능한 구조
PDB동원체 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록

1IJ9, 1VCA, 1VSC

식별자
다른 이름VCAM1, CD106, INCAM-100, vascular cell adhesion molecule 1
외부 IDOMIM: 192225 MGI: 98926 HomoloGene: 838 GeneCards: VCAM1
유전자 위치 (인간)
1번 염색체
염색체1번 염색체[1]
1번 염색체
VCAM1의 유전자 위치
VCAM1의 유전자 위치
자리1p21.2시작100,719,742 bp[1]
100,739,045 bp[1]
유전자 위치 ()
3번 염색체 (쥐)
염색체3번 염색체 (쥐)[2]
3번 염색체 (쥐)
VCAM1의 유전자 위치
VCAM1의 유전자 위치
자리3 G1|3 50.17 cM시작115,903,598 bp[2]
115,923,337 bp[2]
RNA 발현 패턴
Bgee
인간(동원체)
최상위 발현
  • cartilage tissue

  • 해면뼈

  • 벽가슴막

  • tendon of biceps brachii

  • 대정맥

  • 비장

  • 사구체

  • metanephric glomerulus

  • synovial joint

  • kidney tubule
최상위 발현
  • stroma of bone marrow

  • 비장

  • dermis

  • Epithelium of choroid plexus

  • tibiofemoral joint

  • choroid plexus of fourth ventricle

  • left lung lobe

  • 심방

  • 태아

  • 가슴샘
추가 참조 발현 데이터
BioGPS
추가 참조 발현 데이터
유전자 온톨로지
분자 함수
  • primary amine oxidase activity
  • integrin binding
  • cell adhesion molecule binding
세포 성분
  • integral component of membrane
  • 골지체
  • alpha9-beta1 integrin-vascular cell adhesion molecule-1 complex
  • 세포막
  • filopodium
  • 세포막
  • apical part of cell
  • microvillus
  • 세포 표면
  • early endosome
  • 소포체
  • podosome
  • sarcolemma
  • 엑소좀
  • external side of plasma membrane
  • 세포 바깥쪽
  • integral component of plasma membrane
생물학적 과정
  • leukocyte cell-cell adhesion
  • response to ionizing radiation
  • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
  • response to hypoxia
  • response to nutrient
  • interferon-gamma-mediated signaling pathway
  • cellular response to tumor necrosis factor
  • response to nicotine
  • 노화
  • response to zinc ion
  • extracellular matrix organization
  • amine metabolic process
  • response to lipopolysaccharide
  • 세포 접착
  • acute inflammatory response
  • positive regulation of T cell proliferation
  • membrane to membrane docking
  • regulation of immune response
  • leukocyte tethering or rolling
  • cell chemotaxis
  • B cell differentiation
  • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus
  • cell-matrix adhesion
  • viral process
  • response to ethanol
  • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source
  • chronic inflammatory response
  • cell-cell adhesion
  • cytokine-mediated signaling pathway
  • heterotypic cell-cell adhesion
  • innervation
  • cardiac neuron differentiation
  • cell-cell adhesion in response to extracellular stimulus
  • cellular response to amyloid-beta
출처: Amigo / QuickGO
동원체
인간
앙트레

7412

22329

앙상블

ENSG00000162692

ENSMUSG00000027962

유니프롯

P19320

P29533

RefSeq (mRNA)

NM_080682
NM_001078
NM_001199834

NM_011693

RefSeq(단백질)

NP_001069
NP_001186763
NP_542413

NP_035823

위치(UCSC)Chr 1: 100.72 – 100.74 MbChr 3: 115.9 – 115.92 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집쥐 보기/편집

VCAM-1(Vascular cell adhesion protein 1, vascular cell adhesion molecule 1, 혈관 세포 접착 분자 1) 또는 분화 클러스터 106(CD106)으로도 알려진 혈관 세포 접착 단백질 1은 인간에서 VCAM1 유전자에 의해 인코딩되는 단백질이다. VCAM-1은 세포 접착 분자로 기능한다.

구조

VCAM-1은 항체와 T 세포 수용체를 포함한 단백질 슈퍼패밀리인 면역글로불린 슈퍼패밀리의 구성원이다. VCAM-1 유전자는 6개 또는 7개의 면역글로불린 도메인을 포함하고 있으며, 내피 세포가 사이토카인에 의해 자극된 후에만 대혈관과 소혈관 모두에서 발현된다. 이는 대안적으로 인간의 서로 다른 이소형을 암호화하는 두 개의 알려진 RNA 전사체로 연결된다. 유전자 산물은 Ig 수퍼패밀리의 구성원인 I형 막 단백질인 세포 표면 시알로당단백질이다.

각주

  1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162692 - 앙상블, May 2017
  2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027962 - 앙상블, May 2017
  3. “Human PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》. 
  4. “Mouse PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》. 

외부 링크

  • 의학주제표목 (MeSH)의 VCAM-1
  • 모든 구조 정보의 개요는 유니프롯PDB로 볼 수 있습니다: P19320 (Vascular cell adhesion protein 1) - PDBe-KB.
  • v
  • t
  • e
칼슘 비의존적
면역글로불린
슈퍼패밀리
세포 접착 분자
  • N-CAM (미엘린 단백질 제로)
  • ICAM (ICAM-1, ICAM5)
  • VCAM-1
  • PE-CAM
  • L1 패밀리
    • L1-CAM
    • NRCAM
    • NFASC
    • CHL1
  • 넥틴
    • PVRL1
    • PVRL2
    • PVRL3
    • CADM1
    • CADM3
    • CD155
인테그린
  • LFA-1 (CD11a+CD18)
  • 인테그린 알파X베타2 (CD11c+CD18)
  • 대식세포-1 항원 (CD11b+CD18)
  • VLA-4 (CD49d+CD29)
  • 당단백질 IIb/IIIa (ITGA2B+ITGB3)
칼슘 의존적
카드헤린
고전적
  • CDH1
  • CDH2
  • CDH3
데스모솜
  • 데스모글레인 (DSG1, DSG2, DSG3, DSG4)
  • 데스모콜린 (DSC1, DSC2, DSC3)
프로토카드헤린
  • PCDH1
  • PCDH15
  • PCDH19
비전통적인/비그룹화된
  • T-카드헤린
  • CDH4
  • CDH5
  • CDH6
  • CDH8
  • CDH11
  • CDH12
  • CDH15
  • CDH16
  • CDH17
  • CDH9
  • CDH10
셀렉틴
  • E-셀렉틴
  • L-셀렉틴
  • P-셀렉틴
기타
  • 암태아성 항원
  • CD22
  • CD24
  • CD44
  • CD146
  • CD164