CDKN1B |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
2AST, 1H27, 1JSU |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | CDKN1B, CDKN4, KIP1, MEN1B, MEN4, P27KIP1, cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, cyclin dependent kinase inhibitor 1B |
---|
Внешние ID | OMIM: 600778 MGI: 104565 HomoloGene: 2999 GeneCards: CDKN1B |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
| Хр. | 6-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 6 G1|6 65.77 cM | Начало | 134,897,364 bp[2] |
---|
Конец | 134,902,476 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - ventricular zone
- lateral nuclear group of thalamus
- parietal pleura
- germinal epithelium
|
| Наибольшая экспрессия в | - lobe of cerebellum
- cumulus cell
- ventricular zone
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - связывание с белками плазмы
- protein phosphatase binding
- cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
- protein kinase inhibitor activity
- protein kinase binding
- cyclin binding
- cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity
- Hsp70 protein binding
- protein-containing complex binding
- chaperone binding
| Компонент клетки | - цитоплазма
- цитозоль
- эндосома
- нуклеоплазма
- Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex
- клеточное ядро
- intracellular membrane-bounded organelle
- protein-containing complex
| Биологический процесс | - Notch signaling pathway
- regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
- DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest
- response to estradiol
- positive regulation of cell death
- response to hypoxia
- response to amino acid
- response to cadmium ion
- positive regulation of protein catabolic process
- response to organic cyclic compound
- cellular response to lithium ion
- cellular response to organic cyclic compound
- response to peptide hormone
- смерть клетки
- негативная регуляция апоптоза
- слух
- response to glucose
- potassium ion transport
- regulation of cell population proliferation
- negative regulation of cell growth
- negative regulation of epithelial cell proliferation involved in prostate gland development
- позитивная регуляция пролиферации клеток
- positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
- negative regulation of epithelial cell proliferation
- positive regulation of microtubule polymerization
- inner ear development
- cellular response to antibiotic
- клеточный цикл
- negative regulation of phosphorylation
- negative regulation of transcription, DNA-templated
- autophagic cell death
- негативная регуляция пролиферации клеток
- negative regulation of mitotic cell cycle
- negative regulation of kinase activity
- positive regulation of cell cycle
- negative regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation
- Плацентация
- regulation of exit from mitosis
- regulation of lens fiber cell differentiation
- negative regulation of cyclin-dependent protein kinase activity
- negative regulation of cell cycle
- negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
- G1/S transition of mitotic cell cycle
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 12: 12.69 – 12.72 Mb | Chr 6: 134.9 – 134.9 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
CDKN1B (англ. cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, p27, Kip1) — ингибитор циклин-зависимой киназы 1B, продукт гена CDKN1B человека, член семейства белков Cip/Kip. Этот белок регулирует течение клеточного цикла, отвечает за его остановку в G1-фазе. CDKN1B подавляет активность комплексов циклин А/циклин-зависимая киназа 2 и циклин Е/циклин-зависимая киназа 2. Также он способен связываться с комплексами циклин типа D/циклин-зависимая киназа 4 и положительно или отрицательно регулировать их активность в зависимости от статуса фосфорилирования или стехиометрии комплекса[5].
Распространение и внутриклеточная локализация
CDKN1B, был обнаружен во всех тканях, которые были протестированы. Количество мРНК CDKN1B постоянно на всех стадиях клеточного цикла, и регуляция количества белка и его активности происходит на уровне трансляции, контроля стабильности и посттрансляционных модификаций[6].
CDKN1B — ядерно-цитоплазматический белок, его внутриклеточная локализация регулируется посттрансляционными модификациями. Свои ингибиторные функции он выполняет в ядре, после его перемещения в цитоплазму становится возможным дальнейшее продвижение клетки по циклу. Нарушение баланса между количеством ядерного и цитоплазматического CDKN1B обнаруживается в некоторых злокачественных опухолях[6].
Роль в развитии заболеваний
В соответствии с его ролью в регуляции пролиферации клеток, CDKN1B является антионкобелком, а кодирующий его ген — геном-супрессором опухолей. Супрессорная роль CDKN1B означает, что инактивирующие мутации в этом гене сопровождаются формированием опухолей.
Мутации в гене CDKN1B обуславливают предрасположенность к развитию множественных опухолей эндокринных желёз у человека и крыс[7]. Это заболевание, описанное на примере одной семьи, получило название множественной эндокринной неоплазии IV типа.
Была установлена связь между определёнными аллельными вариантами гена CDKN1B и предрасположенностью к раку предстательной железы. Один из вариантов однонуклеотидного полиморфизма являются замены 326T/G (V109G). Показано, что гомозиготность по варианту 326T ассоциированна с повышенным риском развития распространённой карциномы простаты. Другим примером является полиморфизм −79C/T, при этом наличие в генотипе человека аллели C сопряжено с повышенным риском развития рака простаты и других органов[8].
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000111276 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000003031 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ CDKN1B в базе данных UniProt (неопр.). Дата обращения: 12 ноября 2013. Архивировано 25 сентября 2017 года.
- ↑ 1 2 Mitrea D. M., Yoon M. K., Ou L., Kriwacki R. W. Disorder-function relationships for the cell cycle regulatory proteins p21 and p27 // Biol Chem. — 2012. — Т. 393, вып. 4. — С. 259—274. — doi:10.1515/hsz-2011-0254. — PMID 23029651.
- ↑ Pellegata N. S., Quintanilla-Martinez L., Siggelkow H., Samson E., Bink K., Höfler H., Fend F., Graw J., Atkinson M. J. Germ-line mutations in p27Kip1 cause a multiple endocrine neoplasia syndrome in rats and humans // Proc Natl Acad Sci U S A. — 2006. — Т. 103, вып. 42. — С. 15558—15563. — PMID 17030811. Архивировано 25 мая 2021 года.
- ↑ Chang B. L., Zheng S. L., Isaacs S. D., Wiley K. E., Turner A., Li G., Walsh P. C., Meyers D. A., Isaacs W. B., Xu J. A polymorphism in the CDKN1B gene is associated with increased risk of hereditary prostate cancer // Cancer Res. — 2004. — Т. 64, вып. 6. — С. 1997—1999. — PMID 15026335. Архивировано 11 июля 2015 года.
|
---|
Фазы | | |
---|
Регуляторы | |
---|