FUT8

FUT8
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2DE0

Идентификаторы
ПсевдонимыFUT8, fucosyltransferase 8, CDGF, CDGF1
Внешние IDOMIM: 602589 MGI: 1858901 HomoloGene: 9650 GeneCards: FUT8
Расположение гена (человек)
14-я хромосома человека
Хр.14-я хромосома человека[1]
14-я хромосома человека
Расположение в геноме FUT8
Расположение в геноме FUT8
Локус14q23.3Начало65,410,592 bp[1]
Конец65,744,121 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
12-я хромосома мыши
Хр.12-я хромосома мыши[2]
12-я хромосома мыши
Расположение в геноме FUT8
Расположение в геноме FUT8
Локус12|12 C3Начало77,284,899 bp[2]
Конец77,523,112 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • trigeminal ganglion

  • inferior ganglion of vagus nerve

  • ventricular zone

  • C1 segment
Наибольшая экспрессия в
  • left colon

  • epithelium of stomach

  • crypt of lieberkuhn of small intestine

  • lobe of cerebellum

  • olfactory tubercle
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • трансферазная активность
  • glycosyltransferase activity
  • SH3 domain binding
  • glycoprotein 6-alpha-L-fucosyltransferase activity
  • alpha-(1->6)-fucosyltransferase activity
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • аппарат Гольджи
  • мембрана
  • Golgi membrane
  • Golgi cisterna membrane
  • экзосома
  • цитозоль
Биологический процесс
  • GDP-L-fucose metabolic process
  • regulation of cellular response to oxidative stress
  • N-glycan fucosylation
  • N-glycan processing
  • in utero embryonic development
  • respiratory gaseous exchange by respiratory system
  • protein glycosylation
  • oligosaccharide biosynthetic process
  • Регуляция экспрессии генов
  • integrin-mediated signaling pathway
  • protein N-linked glycosylation
  • transforming growth factor beta receptor signaling pathway
  • миграция клеток
  • L-fucose catabolic process
  • receptor metabolic process
  • protein N-linked glycosylation via asparagine
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

2530

53618

Ensembl

ENSG00000033170

ENSMUSG00000021065

UniProt

Q9BYC5

Q9WTS2

RefSeq (мРНК)
NM_004480
NM_178154
NM_178155
NM_178156
NM_178157

NM_001371533
NM_001371534
NM_001371536

NM_001252614
NM_001252615
NM_001252616
NM_016893

RefSeq (белок)
NP_004471
NP_835368
NP_835369
NP_001358462
NP_001358463

NP_001358465

NP_001239543
NP_001239544
NP_001239545
NP_058589

Локус (UCSC)Chr 14: 65.41 – 65.74 MbChr 12: 77.28 – 77.52 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Альфа-(1, 6)-фукозилтрансфераза, или фукозилтрансферза 8 (англ. Alpha-(1,6)-fucosyltransferase; Fucosyltransferase 8; КФ 2.4.1.68) — фермент трансфераза семейства гликозилтрансфераз 10 (фукозилтрансферазы), продукт гена человека FUT8[5][6]. Играет роль в гликозилировании белков.

Функции

Фермент катализирует добавление фукозы через альфа-1,6-гликозидную связь 1-го остатка N-ацетилглюкозамина, ближайшего к пептидной цепи N-гликана.

Структура и внутриклеточная локализация

FUT8 состоит из 575 аминокислот, молекулярная масса 66,5 кДа. Как и другие фукозилтрансферазы, локализован на мембранах транс-отдела аппарата Гольджи.

Экспрессия

Экспрессирован практически во всех тланях, наиболее высокий уровень экспрессии — в нервном сплетении corpus callosum мозга.

Патология

Мутации гена фукозилтрансферазы 8 могут приводить к заболеванию наследственное нарушение гликозилирования с дефектным фукозилированием (т. н. CDGF). В связи с множественными функциями гликозилирования белков заболевание характеризуется широким спектром клинических проявлений: дефектами в развитии нервной системы, психомоторная задержка, дисморфизмы, гипотония, нарушения свёртываемости крови и иммунодефицит. CDGF является аутосомальным рецессивным заболеванием.

См. также

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000033170 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021065 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Costache M., Apoil P.A., Cailleau A., Elmgren A., Larson G., Henry S., Blancher A., Iordachescu D., Oriol R., Mollicone R. Evolution of fucosyltransferase genes in vertebrates (англ.) // J Biol Chem : journal. — 1997. — December (vol. 272, no. 47). — P. 29721—29728. — doi:10.1074/jbc.272.47.29721. — PMID 9368041.
  6. Entrez Gene: FUT8 fucosyltransferase 8 (alpha (1,6) fucosyltransferase)  (неопр.).

Литература

  • Miyoshi E., Noda K., Yamaguchi Y. et al. The alpha1-6-fucosyltransferase gene and its biological significance. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 1473, no. 1. — P. 9—20. — doi:10.1016/s0304-4165(99)00166-x. — PMID 10580126.
  • Kalyanaraman V.S., Rodriguez V., Veronese F. et al. Characterization of the secreted, native gp120 and gp160 of the human immunodeficiency virus type 1. (англ.) // AIDS Res. Hum. Retroviruses[англ.] : journal. — 1990. — Vol. 6, no. 3. — P. 371—380. — doi:10.1089/aid.1990.6.371. — PMID 2187500.
  • Pal R., Hoke G.M., Sarngadharan M.G. Role of oligosaccharides in the processing and maturation of envelope glycoproteins of human immunodeficiency virus type 1. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1989. — Vol. 86, no. 9. — P. 3384—3388. — doi:10.1073/pnas.86.9.3384. — PMID 2541446. — PMC 287137.
  • Dewar R.L., Vasudevachari M.B., Natarajan V., Salzman N.P. Biosynthesis and processing of human immunodeficiency virus type 1 envelope glycoproteins: effects of monensin on glycosylation and transport. (англ.) // J. Virol.[англ.] : journal. — 1989. — Vol. 63, no. 6. — P. 2452—2456. — PMID 2542563. — PMC 250699.
  • Kozarsky K., Penman M., Basiripour L. et al. Glycosylation and processing of the human immunodeficiency virus type 1 envelope protein. (англ.) // J. Acquir. Immune Defic. Syndr.[англ.] : journal. — 1989. — Vol. 2, no. 2. — P. 163—169. — PMID 2649653.
  • Robinson W.E., Montefiori D.C., Mitchell W.M. Evidence that mannosyl residues are involved in human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) pathogenesis. (англ.) // AIDS Res. Hum. Retroviruses[англ.] : journal. — 1988. — Vol. 3, no. 3. — P. 265—282. — doi:10.1089/aid.1987.3.265. — PMID 2829950.
  • Andersson B., Wentland M.A., Ricafrente J.Y. et al. A "double adaptor" method for improved shotgun library construction. (англ.) // Anal. Biochem.[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 236, no. 1. — P. 107—113. — doi:10.1006/abio.1996.0138. — PMID 8619474.
  • Yu W., Andersson B., Worley K.C. et al. Large-scale concatenation cDNA sequencing. (англ.) // Genome Res. : journal. — 1997. — Vol. 7, no. 4. — P. 353—358. — doi:10.1101/gr.7.4.353. — PMID 9110174. — PMC 139146.
  • Yanagidani S., Uozumi N., Ihara Y. et al. Purification and cDNA cloning of GDP-L-Fuc:N-acetyl-beta-D-glucosaminide:alpha1-6 fucosyltransferase (alpha1-6 FucT) from human gastric cancer MKN45 cells. (англ.) // J. Biochem.[англ.] : journal. — 1997. — Vol. 121, no. 3. — P. 626—632. — doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021631. — PMID 9133635.
  • Yamaguchi Y., Fujii J., Inoue S. et al. Mapping of the alpha-1,6-fucosyltransferase gene, FUT8, to human chromosome 14q24.3. (англ.) // Cytogenetic and Genome Research[англ.] : journal. — Karger Publishers[англ.], 1999. — Vol. 84, no. 1—2. — P. 58—60. — doi:10.1159/000015215. — PMID 10343104.
  • Takahashi T., Ikeda Y., Tateishi A. et al. A sequence motif involved in the donor substrate binding by alpha1,6-fucosyltransferase: the role of the conserved arginine residues. (англ.) // Glycobiology : journal. — 2000. — Vol. 10, no. 5. — P. 503—510. — doi:10.1093/glycob/10.5.503. — PMID 10764839.
  • Yamaguchi Y., Ikeda Y., Takahashi T. et al. Genomic structure and promoter analysis of the human alpha1, 6-fucosyltransferase gene (FUT8). (англ.) // Glycobiology : journal. — 2000. — Vol. 10, no. 6. — P. 637—643. — doi:10.1093/glycob/10.6.637. — PMID 10814706.
  • Takahashi T., Ikeda Y., Miyoshi E. et al. alpha1,6fucosyltransferase is highly and specifically expressed in human ovarian serous adenocarcinomas. (англ.) // Int. J. Cancer[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 88, no. 6. — P. 914—919. — doi:10.1002/1097-0215(20001215)88:6<914::AID-IJC12>3.0.CO;2-1. — PMID 11093814.
  • Roos C., Kolmer M., Mattila P., Renkonen R. Composition of Drosophila melanogaster proteome involved in fucosylated glycan metabolism. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 5. — P. 3168—3175. — doi:10.1074/jbc.M107927200. — PMID 11698403.
  • Coullin P., Crooijmans R.P., Groenen M.A. et al. Assignment of FUT8 to chicken chromosome band 5q1.4 and to human chromosome 14q23.2→q24.1 by in situ hybridization. Conserved and compared synteny between human and chicken. (англ.) // Cytogenetic and Genome Research[англ.] : journal. — Karger Publishers[англ.], 2003. — Vol. 97, no. 3—4. — P. 234—238. — doi:10.1159/000066611. — PMID 12438718.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Martinez-Duncker I., Michalski J.C., Bauvy C. et al. Activity and tissue distribution of splice variants of alpha6-fucosyltransferase in human embryogenesis. (англ.) // Glycobiology : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 1. — P. 13—25. — doi:10.1093/glycob/cwh006. — PMID 14514715.
  • Ito Y., Miyauchi A., Yoshida H. et al. Expression of alpha1,6-fucosyltransferase (FUT8) in papillary carcinoma of the thyroid: its linkage to biological aggressiveness and anaplastic transformation. (англ.) // Cancer Lett.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 200, no. 2. — P. 167—172. — doi:10.1016/S0304-3835(03)00383-5. — PMID 14568171.