PLXNA2

PLXNA2
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

3Q3J

Идентификаторы
ПсевдонимыPLXNA2, OCT, PLXN2, plexin A2
Внешние IDOMIM: 601054 MGI: 107684 HomoloGene: 56427 GeneCards: PLXNA2
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме PLXNA2
Расположение в геноме PLXNA2
Локус1q32.2Начало208,022,242 bp[1]
Конец208,244,384 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме PLXNA2
Расположение в геноме PLXNA2
Локус1|1 H6Начало194,300,526 bp[2]
Конец194,499,177 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • body of pancreas

  • upper lobe of left lung

  • right hemisphere of cerebellum
Наибольшая экспрессия в
  • medial ganglionic eminence

  • olfactory tubercle

  • lateral septal nucleus
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • связывание с белками плазмы
  • semaphorin receptor activity
  • связывание похожих белков
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • клеточная мембрана
  • semaphorin receptor complex
  • мембрана
  • часть клеточной мембраны
Биологический процесс
  • somitogenesis
  • cell surface receptor signaling pathway
  • regulation of axon extension involved in axon guidance
  • cerebellar granule cell precursor tangential migration
  • branchiomotor neuron axon guidance
  • limb bud formation
  • развитие нервной трубки
  • semaphorin-plexin signaling pathway
  • передача сигнала
  • pharyngeal system development
  • centrosome localization
  • regulation of cell migration
  • negative regulation of cell adhesion
  • regulation of cell shape
  • regulation of GTPase activity
  • positive regulation of axonogenesis
  • semaphorin-plexin signaling pathway involved in axon guidance
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

5362

18845

Ensembl

ENSG00000076356

ENSMUSG00000026640

UniProt

O75051

P70207

RefSeq (мРНК)

NM_025179

NM_008882

RefSeq (белок)

NP_079455

NP_032908

Локус (UCSC)Chr 1: 208.02 – 208.24 MbChr 1: 194.3 – 194.5 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

PLXNA2 — ген, кодирующий плексин A2, рецептор семафоринов. До создания в 1999 году общей классификации плексинов[5] носил название OCT, обусловленное принадлежностью к SEX-семейству белков, поименованных по начальным буквам римских цифр: SEX (плексин A3), OCT, NOV (плексин A1), SEP (плексин B1) и содержащих в своей структуре SEX-домен[6]. За исключением SEP, пик экспрессии которого наблюдается в почках, белки SEX-семейства экспрессированы преимущественно в мозгу.

Взаимодействие семафоринов с другими белками, плексином A2 и нейропилином 2, создаёт условия, при которых моторные нейроны спинного мозга способны выпускать свои аксоны на периферию, но не могут сами выбраться за его пределы. Bron et al., 2007.[7]

Взаимодействуя с семафорином Sema6A, плексин 2A[уточнить] может регулировать переход гранулярных клеток мозжечка у мыши от тангенциальной к радиальной миграции в период развития мозга[8].

Несколько исследований говорят о возможной связи гена с развитием шизофрении, однако результаты разнятся[9]. Отмечена ассоциация полиморфизмов гена с проявлением тревоги, как у мышей, так и у людей[10].

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000076356 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026640 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Tamagnone L., Artigiani S., Chen H., He Z., Ming G.I., Song H., Chedotal A., Winberg M.L., Goodman C.S., Poo M., Tessier-Lavigne M., Comoglio P.M. Plexins are a large family of receptors for transmembrane, secreted, and GPI-anchored semaphorins in vertebrates (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1999. — October (vol. 99, no. 1). — P. 71—80. — PMID 10520995.
  6. ↑ Maestrini E., Tamagnone L., Longati P., Cremona O., Gulisano M., Bione S., Tamanini F., Neel B.G., Toniolo D., Comoglio P.M. A family of transmembrane proteins with homology to the MET-hepatocyte growth factor receptor (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — January (vol. 93, no. 2). — P. 674—678. — PMID 8570614. — PMC 40111.
  7. ↑ Bron R., Vermeren M., Kokot N., Andrews W., Little G.E., Mitchell K.J., Cohen J. Boundary cap cells constrain spinal motor neuron somal migration at motor exit points by a semaphorin-plexin mechanism (англ.) // Neural Dev : journal. — 2007. — Vol. 2. — P. 21. — doi:10.1186/1749-8104-2-21. — PMID 17971221. — PMC 2131750.
  8. ↑ Renaud J., Kerjan G., Sumita I., Zagar Y., Georget V., Kim D., Fouquet C., Suda K., Sanbo M., Suto F., Ackerman S.L., Mitchell K.J., Fujisawa H., Chédotal A. Plexin-A2 and its ligand, Sema6A, control nucleus-centrosome coupling in migrating granule cells (англ.) // Nature Neuroscience : journal. — 2008. — April (vol. 11, no. 4). — P. 440—449. — doi:10.1038/nn2064. — PMID 18327254.
  9. ↑ Gene Overview of All Published Schizophrenia-Association Studies for PLXNA2 Архивировано 21 февраля 2009 года. — база данных SZGene, сайт Schizophrenia Research Forum.
  10. ↑ Wray N.R., James M.R., Mah S.P., Nelson M., Andrews G., Sullivan P.F., Montgomery G.W., Birley A.J., Braun A., Martin N.G. Anxiety and comorbid measures associated with PLXNA2 (англ.) // Arch. Gen. Psychiatry[англ.] : journal. — 2007. — March (vol. 64, no. 3). — P. 318—326. — doi:10.1001/archpsyc.64.3.318. — PMID 17339520. Архивировано 30 сентября 2011 года.