Gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza

edit
Gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza

GAPDH sa NAD+ i Pi vezanim za aktivno mesto. PDB prikaz baziran na 2CZC.
Dostupne strukture
1U8F, 1ZNQ, 3GPD
Identifikatori
SimboliGAPDH; G3PD; GAPD
Vanjski IDOMIM: 138400 MGI: 3646088 HomoloGene: 107053 GeneCards: GAPDH Gene
EC broj1.2.1.12
Ontologija gena
Molekularna funkcija aktivnost gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza (NAD+) (fosforilacija)
proteinsko vezivanje
Celularna komponenta jedro
citoplazma
lipidna čestica
citosol
Biološki proces organizacija mikrotubularnog citoskeletona
karbohidratni metabolički proces
glukozni metabolički proces
Pregled RNK izražavanja
podaci
Ortolozi
VrstaČovekMiš
Entrez2597100043349
EnsemblENSG00000111640ENSMUSG00000078370
UniProtP04406P16858
RefSeq (mRNA)NM_001256799.1NM_008084
RefSeq (protein)NP_001243728.1NP_001074766
Lokacija (UCSC)Chr 12:
6.64 - 6.65 Mb
Chr 12:
71.02 - 71.02 Mb
PubMed pretraga[1][2]

Gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza (GAPDH, G3PDH) (EC 1.2.1.12) je enzim sa masom od ~37 kDa, koji katalizuje šesti korak glikolize i stoga doprinosi procesu razlaganja glukoze radi oslobađanja energije. GAPDH učestvuje u nekoliko nemetaboličkih procesa, uključujući aktivaciju transkripcije, inicijaciju apoptoze,[1] i druge.

Metabolička funkcija

Gliceraldehid 3-fosfat dehidrogenaza (GAPDH) katalizuje konverziju gliceraldehid 3-fosfata do D-glicerat 1,3-bisfosfata.

Reakcija

gliceraldehid 3-fosfat gliceraldehid fosfat dehidrogenaza D-glicerat 1,3-bisfosfat
 
NAD+ + Pi NADH + H+
NAD+ + Pi NADH + H+
 
 

Jedinjenje C00118 u KEGG bazi podataka metaboličkig puteva. Enzim 1.2.1.12 u KEGG bazi podataka metaboličkig puteva. Reakcija R01063 u KEGG Metabolički Put bazi podataka. Jedinjenje C00236 u KEGG bazi podataka metaboličkig puteva.

Reference

  1. A. Tarze, A. Deniaud, M. Le Bras, E. Maillier, D. Molle, N. Larochette, N. Zamzami, G. Jan, G. Kroemer, and C. Brenner (2007). „GAPDH, a novel regulator of the pro-apoptotic mitochondrial membrane permeabilization”. Oncogene 26 (18): 2606–2620. DOI:10.1038/sj.onc.1210074. PMID 17072346. 

Literatura

  • Nicholas C. Price, Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third izd.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X. 
  • Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 izd.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036. 
  • Branden C, Tooze J.. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN: 0-8153-2305-0. 
  • Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 izd.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097. 
  • Robert A. Copeland (2013). Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists (2nd izd.). Wiley-Interscience. ISBN 111848813X. 
  • Gerhard Michal, Dietmar Schomburg (2012). Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (2nd izd.). Wiley. ISBN 0470146842. 
  • Donald Voet, Judith G. Voet (2005). Biochemistry (3 izd.). Wiley. ISBN 978-0-471-19350-0. 
  • Stryer, Lubert; Berg, Jeremy Mark; Tymoczko, John L. (2002). Biochemistry, Fifth Edition & Lecture Notebook. San Francisco: W. H. Freeman. 
  • Diagram of the GAPDH reaction mechanism from Lodish MCB at NCBI bookshelf
  • Similar diagram from Alberts The Cell at NCBI bookshelf
  • p
  • r
  • u
PDB Galerija
1j0x: Krostalna struktura gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaze (GAPDH) iz mišiča zeca
1j0x: Krostalna struktura gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaze (GAPDH) iz mišiča zeca  
1u8f: Krostalna struktura ljudske materične gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaze na 1,75 A
1u8f: Krostalna struktura ljudske materične gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaze na 1,75 A  
1znq: Krostalna struktura ljudske jetrene GAPDH
1znq: Krostalna struktura ljudske jetrene GAPDH  
  • p
  • r
  • u
Teme
Tipovi
EC1 Oksidoreduktaze/spisak  • EC2 Transferaze/spisak  • EC3 Hidrolaze/spisak  • EC4 Lijaze/spisak  • EC5 Izomeraze/spisak  • EC6 Ligaze/spisak
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6