Ras superfamilija
H-Ras struktura PDB 121p. Površina je obojena po stepenu konzervacije: zlatno - najočuvaniji deo. | |||||||||
Identifikatori | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Simbol | Ras | ||||||||
Pfam | PF00071 | ||||||||
InterPro | IPR013753 | ||||||||
PROSITE | PDOC00017 | ||||||||
SCOP | 5p21 | ||||||||
Superfamilija | 5p21 | ||||||||
OPM protein | 1uad | ||||||||
CDD | cd00882 | ||||||||
|
Ras superfamilija je proteinska superfamilija malih GTPaza, koje su međusobno srodne u izvesnoj meri sa Ras potfamilijom. Ključni ljudski članovi su KRAS, NRAS, i HRAS.
Postoji više od sto proteina u Ras superfamiliji.[1] Ras superfamilija se deli u osam glavnih familija na osnovu strukture, sekvence i funkcije: Ras, Rad, Rab, Rap, Ran, Ro, Rheb, Rit, i Arf. Miro je nedavni dodatak superfamiliji.
Svaka potfamilija ima zajednički osnovni G domen, koji omogućava esencijalne funkcije GTPaze i nukleotidne razmene.
Okružujuća sekvenca pomaže u određivanju funkcionalne specifičnosti malih GTPaza, na primer umetnuta petlja koja je uobičajena kod Ro potfamilije, specifično doprinosi vezivanju za efektorske proteine poput IQGAP-a i WASP-a.
Ras familija je generalno odgovorna za ćelijsku proliferaciju, Ro za ćelijsku morfologiju, Ran za nuklearni transport, a Rab i Arf za vezikularni transport[2].
Potfamilije i članovi
Sledeća lista sadrži ljudske proteine koji pripadaju Ras superfamiliji:[1]
Potfamilija | Funkcija | Članovi |
---|---|---|
Ras | ćelijska proliferacija [2] | DIRAS1; DIRAS2; DIRAS3; ERAS; GEM; HRAS; KRAS; MRAS; NKIRAS1; NKIRAS2; NRAS; RALA; RALB; RAP1A; RAP1B; RAP2A; RAP2B; RAP2C; RASD1; RASD2; RASL10A; RASL10B; RASL11A; RASL11B; RASL12; REM1; REM2; RERG; RERGL; RRAD; RRAS; RRAS2 |
Ro | citoskeletalna dinamika/morfologija[2] | RHOA; RHOB; RHOBTB1; RHOBTB2; RHOBTB3; RHOC; RHOD; RHOF; RHOG; RHOH; RHOJ; RHOQ; RHOU; RHOV; RND1; RND2; RND3; RAC1; RAC2; RAC3; CDC42 |
Rab | membranska razmena | RAB1A; RAB1B; RAB2; RAB3A; RAB3B; RAB3C; RAB3D; RAB4A; RAB4B; RAB5A; RAB5B; RAB5C; RAB6A; RAB6B; RAB6C; RAB7A; RAB7B; RAB7L1; RAB8A; RAB8B; RAB9; RAB9B; RABL2A; RABL2B; RABL4; RAB10; RAB11A; RAB11B; RAB12; RAB13; RAB14; RAB15; RAB17; RAB18; RAB19; RAB20; RAB21; RAB22A; RAB23; RAB24; RAB25; RAB26; RAB27A; RAB27B; RAB28; RAB2B; RAB30; RAB31; RAB32; RAB33A; RAB33B; RAB34; RAB35; RAB36; RAB37; RAB38; RAB39; RAB39B; RAB40A; RAB40AL; RAB40B; RAB40C; RAB41; RAB42; RAB43 |
Rap | Ćelijska adhezija | RAP1A; RAP1B; RAP2A; RAP2B; RAP2C |
Arf | vesicular transport[2] | ARF1; ARF3; ARF4; ARF5; ARF6; ARL1; ARL2; ARL3; ARL4; ARL5; ARL5C; ARL6; ARL7; ARL8; ARL9; ARL10A; ARL10B; ARL10C; ARL11; ARL13A; ARL13B; ARL14; ARL15; ARL16; ARL17; TRIM23, ARL4D; ARFRP1; ARL13B |
Ran | nukleusni transport | RAN |
Rheb | mTOR put | RHEB; RHEBL1 |
RGK | RRAD; GEM; REM; REM2 | |
Rit | RIT1; RIT2 | |
Miro | mitochondrial transport | RHOT1; RHOT2 |
Neklasifikovani:
- ARHGAP5
- DNAJC27
- GRLF1
- RASEF
Reference
- ↑ 1,0 1,1 Wennerberg K, Rossman KL, Der CJ (March 2005). „The Ras superfamily at a glance”. J. Cell. Sci. 118 (Pt 5): 843–6. DOI:10.1242/jcs.01660. PMID 15731001.
- ↑ 2,0 2,1 2,2 2,3 Munemitsu S, Innis M, Clark R, McCormick F, Ullrich A, Polakis P. (1990). „Molecular cloning and experssion of a G25K cDNA, the human homolog of the yeast cell cycle gene CDC42”. Mol Cell Biol 10 (11): 5977–82. ISSN 0270-7306. PMC 361395. PMID 2122236.
Povezano
- p
- r
- u
3.6.3 |
| ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
3.6.4 |
3.6.5.1: Heterotrimerni G protein | |
---|---|
3.6.5.2: Male GTPaze > Ras superfamilija | |
3.6.5.3: Protein-sintetišuće GTPaze | Prokariotski (IF-2, EF-Tu, EF-G) • Eukariotski |
3.6.5.5-6: Polimerizacioni motori |