Trifunkcioni purinski biosintetički protein adenozin-3

edit
Fosforibozilglicinamid formiltransferaza‎‎, fosforibozilglicinamid sintetaza, fosforibozilaminoimidazol sintetaza

PDB prikaz baziran na 1rbm.
Dostupne strukture
1MEJ, 1MEN, 1MEO, 1NJS, 1RBM, 1RBQ, 1RBY, 1RBZ, 1RC0, 1RC1, 1ZLX, 1ZLY, 2QK4, 2V9Y
Identifikatori
SimboliGART; AIRS; GARS; GARTF; PAIS; PGFT; PRGS
Vanjski IDOMIM: 138440 MGI: 95654 HomoloGene: 637 GeneCards: GART Gene
EC broj6.3.3.1, 6.3.4.13 2.1.2.2, 6.3.3.1, 6.3.4.13
Ontologija gena
Molekularna funkcija aktivnost fosforibozilamin-glicinske ligaze
aktivnost fosforibozilformilglicinamidinske ciklo-ligaze
aktivnost fosforibozilglicinamidne formiltransferaze
ATP vezivanje
Celularna komponenta citozol
Biološki proces purinski nukleobazni metabolički proces
'de novo' IMP biosintetički proces
purinski nukleobazni biosintetički proces
Ortolozi
VrstaČovekMiš
Entrez261814450
EnsemblENSG00000159131ENSMUSG00000022962
UniProtP22102Q64737
RefSeq (mRNA)NM_000819NM_010256
RefSeq (protein)NP_000810NP_034386
Lokacija (UCSC)Chr 21:
34.88 - 34.92 Mb
Chr 16:
91.62 - 91.65 Mb
PubMed pretraga[1][2]

Trifunkcioni purinski biosintetički protein adenozin-3 je enzim koji je kod ljudi kodiran GART genom.[1]

Ovaj protein je trofunkcionalni polipeptid. On deluje kao fosforibozilglicinamid formiltransferaza (EC 6.3.4.13), fosforibozilglicinamidna sintetaza (EC 6.3.3.1), fosforibozilaminoimidazolna sintetaza (EC 2.1.2.2), koji je neophodan za de novo purinsku biosintezu.

Reference

  1. Gnirke A, Barnes TS, Patterson D, Schild D, Featherstone T, Olson MV (July 1991). „Cloning and in vivo expression of the human GART gene using yeast artificial chromosomes”. EMBO J. 10 (7): 1629–34. PMC 452831. PMID 2050105. 

Literatura

  • Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, et al. (2000). „The DNA sequence of human chromosome 21.”. Nature 405 (6784): 311–9. DOI:10.1038/35012518. PMID 10830953. 
  • Banerjee D, Nandagopal K (2007). „Potential interaction between the GARS-AIRS-GART Gene and CP2/LBP-1c/LSF transcription factor in Down syndrome-related Alzheimer disease.”. Cell. Mol. Neurobiol. 27 (8): 1117–26. DOI:10.1007/s10571-007-9217-2. PMID 17902044. 
  • Dahms TE, Sainz G, Giroux EL, et al. (2005). „The apo and ternary complex structures of a chemotherapeutic target: human glycinamide ribonucleotide transformylase.”. Biochemistry 44 (29): 9841–50. DOI:10.1021/bi050307g. PMID 16026156. 
  • Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). „Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes.”. Genome Res. 16 (1): 55–65. DOI:10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560. 
  • Dagle JM, Lepp NT, Cooper ME, et al. (2009). „Determination of genetic predisposition to patent ductus arteriosus in preterm infants.”. Pediatrics 123 (4): 1116–23. DOI:10.1542/peds.2008-0313. PMC 2734952. PMID 19336370. 
  • Franke B, Vermeulen SH, Steegers-Theunissen RP, et al. (2009). „An association study of 45 folate-related genes in spina bifida: Involvement of cubilin (CUBN) and tRNA aspartic acid methyltransferase 1 (TRDMT1).”. Birth Defects Res. Part A Clin. Mol. Teratol. 85 (3): 216–26. DOI:10.1002/bdra.20556. PMID 19161160. 
  • Barbe L, Lundberg E, Oksvold P, et al. (2008). „Toward a confocal subcellular atlas of the human proteome.”. Mol. Cell Proteomics 7 (3): 499–508. DOI:10.1074/mcp.M700325-MCP200. PMID 18029348. 
  • Zhang Y, Desharnais J, Marsilje TH, et al. (2003). „Rational design, synthesis, evaluation, and crystal structure of a potent inhibitor of human GAR Tfase: 10-(trifluoroacetyl)-5,10-dideazaacyclic-5,6,7,8-tetrahydrofolic acid.”. Biochemistry 42 (20): 6043–56. DOI:10.1021/bi034219c. PMID 12755606. 
  • Brodsky G, Barnes T, Bleskan J, et al. (1997). „The human GARS-AIRS-GART gene encodes two proteins which are differentially expressed during human brain development and temporally overexpressed in cerebellum of individuals with Down syndrome.”. Hum. Mol. Genet. 6 (12): 2043–50. DOI:10.1093/hmg/6.12.2043. PMID 9328467. 
  • Kan JL, Moran RG (1997). „Intronic polyadenylation in the human glycinamide ribonucleotide formyltransferase gene.”. Nucleic Acids Res. 25 (15): 3118–23. DOI:10.1093/nar/25.15.3118. PMC 146841. PMID 9224613. 
  • Gomez HL, Santillana SL, Vallejos CS, et al. (2006). „A phase II trial of pemetrexed in advanced breast cancer: clinical response and association with molecular target expression.”. Clin. Cancer Res. 12 (3 Pt 1): 832–8. DOI:10.1158/1078-0432.CCR-05-0295. PMID 16467096. 
  • Zhang Y, Desharnais J, Greasley SE, et al. (2002). „Crystal structures of human GAR Tfase at low and high pH and with substrate beta-GAR.”. Biochemistry 41 (48): 14206–15. DOI:10.1021/bi020522m. PMID 12450384. 
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). „The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).”. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334. 
  • Manieri W, Moore ME, Soellner MB, et al. (2007). „Human glycinamide ribonucleotide transformylase: active site mutants as mechanistic probes.”. Biochemistry 46 (1): 156–63. DOI:10.1021/bi0619270. PMID 17198385. 
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). „Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932. 
  • Rush J, Moritz A, Lee KA, et al. (2005). „Immunoaffinity profiling of tyrosine phosphorylation in cancer cells.”. Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. DOI:10.1038/nbt1046. PMID 15592455. 
  • Zalkin H, Dixon JE (1992). „De novo purine nucleotide biosynthesis.”. Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 42: 259–87. PMID 1574589. 
  • Vieira AR, McHenry TG, Daack-Hirsch S, et al. (2008). „Candidate gene/loci studies in cleft lip/palate and dental anomalies finds novel susceptibility genes for clefts.”. Genet. Med. 10 (9): 668–74. DOI:10.1097/GIM.0b013e3181833793. PMC 2734954. PMID 18978678. 
  • Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). „Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry.”. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. DOI:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931. 
  • Banerjee D, Nandagopal K (2009). „Phylogenetic analysis and in silico characterization of the GARS-AIRS-GART gene which codes for a tri-functional enzyme protein involved in de novo purine biosynthesis.”. Mol. Biotechnol. 42 (3): 306–19. DOI:10.1007/s12033-009-9160-1. PMID 19301155. 

Povezano

Spoljašnje veze

  • MeSH Phosphoribosylglycinamide+formyltransferase
  • p
  • r
  • u
PDB Galerija
1rbm: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom
1rbm: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom  
2qk4: Ljudska glicinamidna ribonukleotidna sintetaza
2qk4: Ljudska glicinamidna ribonukleotidna sintetaza  
1rbz: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom
1rbz: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom  
1zlx: Apo struktura ljudske glicinamidne ribonukleotidne transformilaze
1zlx: Apo struktura ljudske glicinamidne ribonukleotidne transformilaze  
1meo: Ljudska glicinamidna ribonukleotidna transformilaza pri pH 4.2
1meo: Ljudska glicinamidna ribonukleotidna transformilaza pri pH 4.2  
1rc1: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom
1rc1: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom  
1zly: Struktura ljudske glicinamidne ribonukleotidne transformilaze u kompleksu sa alfa,beta-N-(hidroksiacetil)-D-ribofuranozilaminom i 10-formil-5,8,dideazafolatom
1zly: Struktura ljudske glicinamidne ribonukleotidne transformilaze u kompleksu sa alfa,beta-N-(hidroksiacetil)-D-ribofuranozilaminom i 10-formil-5,8,dideazafolatom  
1men: Struktura kompleksa ljudke GAR Tfaze i supstrata beta-GAR
1men: Struktura kompleksa ljudke GAR Tfaze i supstrata beta-GAR  
1mej: Domen ljudske glicinamidne ribonukleotidne transformilaze na pH 8.5
1mej: Domen ljudske glicinamidne ribonukleotidne transformilaze na pH 8.5  
1rbq: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom
1rbq: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom  
1rc0: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom
1rc0: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom  
2v9y: Ljudska aminoimidazolna ribonukleotidna sintetaza
2v9y: Ljudska aminoimidazolna ribonukleotidna sintetaza  
1rby: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom
1rby: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom  
1njs: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom
1njs: Struktura ljudskog GAR Tfaznog kompleksa sa poliglutamatnom 10-(trifluoroacetil)-5,10-dideazaacikličnom-5,6,7,8-tetrahidrofolnom kiselinom