DNK polimeraza II

DNK polimeraza II
Identifikatori
Organizam Escherichia coli
(str. K-12 substr. MG1655)
Simbol polB
Entrez 944779
PDB 3K5M
RefSeq (Prot) NP_414602.1
UniProt P21189
Other data
EC broj 2.7.7.7
Hromozom genome: 0.06 - 0.07 Mb

DNK polimeraza II (DNK Pol II ili Pol II) je prokariotska DNK polimeraza. Smatra se da ona učestvuje u popravci DNK.[1]

Ovaj enzim je težak 90 kDa i kodiran je polB genom. DNK Pol II može da sintetiše nove DNK baze sa prosečnom brzinom od 40 do 50 nukleotida/sekundi Vrste kojima nedostaje ovaj gen manifestuju defektivan rast ili replikaciju. Sinteza Pol II se indukuje tokom stacionarne faze ćelijskog rasta. Ti he faza u kojoj dolazi do malo rasta i replikacije DNK.

Pol II se razlikuje od Pol I po tome što nema 5'->3' eksonukleazno dejstvo, i ne može da koristi dupleksni šablon.

Vidi još

Reference

  1. ^ Banach-Orlowska M, Fijalkowska IJ, Schaaper RM, Jonczyk P (2005). „DNA polymerase II as a fidelity factor in chromosomal DNA synthesis in Escherichia coli”. Mol. Microbiol. 58 (1): 61—70. PMID 16164549. doi:10.1111/j.1365-2958.2005.04805.x. 
  • п
  • р
  • у
Transferaze: fosfor-sadržavajuće grupe (EC 2.7)
2.7.1-2.7.4:
fosfotransferaze/kinaze
(PO4)
2.7.1: OH akceptor
2.7.2: COOH akceptor
2.7.3: N akceptor
2.7.4: PO4 akceptor
2.7.6: difosfotransferaze
(P2O7)2.7.7: nukleotidiltransferaza
(PO4-nukleozid)
Polimeraza
DNK polimeraza
  • DNK-usmerena DNK polimeraza: DNK polimeraza I
  • DNA polimeraza II
  • DNA polimeraza III holoenzim

RNK-usmerena DNA polimeraza: Reverzna transkriptaza (Telomeraza)

DNK nukleotidileksotransferaza/Terminalna deoksinukleotidil transferaza

RNK nukleotidiltransferaza
Fosforolitička
3' do 5' eksoribonukleaza
Uridililtransferaza
Guanililtransferaza
Druge
2.7.8: razno
Fosfatidiltransferaze
Glikozil-1-fosfotransferaza
  • N-acetilglukozamin-1-fosfat transferaza
2.7.10-2.7.13: proteinske kinaze
(PO4; proteinski akceptor)
2.7.10: proteinske-tirozinske
  • vidi tirozinske kinaze
2.7.11: proteinske-serin/treonin
  • vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.12: dualna specifičnost
  • vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.13: protein-histidinske
  • Protein-histidinske pros-kinaze
  • Proteinske-histidinske tele-kinaze
  • Histidinske kinaze
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • p
  • r
  • u
Separacija
i inicijacija
Prokariotska
(inicijacija)
Eukariotska
(priprema u
G1 fazi)
Oba
Replikacija
Prokariotska
(elongacija)
Eukariotska
(sinteza u
S fazi)
Oba
Kretanje: Procesivnost · DNK ligaza
Terminacija
B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr) · tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts) · tltn (risu, pttl, nexn) · dnab, rnab/runp · stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)