Chromobacterium violaceum
Chromobacterium violaceum | |
---|---|
![]() | |
C. violaceum'un kan ağarı plağı kültürü, Görsel: CDC | |
Bilimsel sınıflandırma | |
Alem: | Bakteri |
Şube: | Pseudomonadota |
Sınıf: | Betaproteobacteria |
Takım: | Neisseriales |
Familya: | Chromobacteriaceae |
Cins: | Chromobacterium |
Tür: | C. violaceum |
İkili ad | |
Chromobacterium violaceum (Schröter 1872) |
Chromobacterium violaceum gram negatif, fakültatif anaerobik, spor oluşturmayan bir kokobasil bakteridir. C. violaceum, kokobasil kutbunda yer alan bir kamçı yardımıyla hareket edebilir, genellikle bir veya iki tane yatay kamçı da bulunur.[1] Bu bakteri, dünyadaki tropikal ve subtropikal bölgelerin normal su ve toprak floralarının bir parçasıdır. Bakteri, violacein adında kolon kanseri ve diğer kanserlerin tedavisi için kullanışlı olabilen bir doğal antibiyotik üretir.[2] Bakteri, besinli ağarda kolayca büyür, (violacein üretiminden dolayı) koyu mor metalik parıltıya sahip kendine özgü düz basit konveks koloniler oluşturur;[3] bakterinin bu pigmenti üretmeyen bazı suşları da bildirilmiştir.[4] Bakteri, katran toplarını parçalayabilir.[5]
Biyokimya
C. violaceum glikoz, trehaloz, N-asetilglukozamin (NAG) ve glukonat fermente edebilir ancak L-arabinoz, D-galaktoz veya D-maltoz fermente edemez.[1] Bakteri, katalaz ve oksidaz ile pozitif reaksiyon verir. Bakteriyel izolatlar, çok sayıda vakada bir grup antibiyotiğe karşı yüksek oranda direnç gösterir.[6]
Tıbbi önemi
C. violaceum, insanlarda enfeksiyona nadiren neden olur ancak insanlara bulaştığı zaman deri lezyonlarına, sepsise ve ölümcül olabilen karaciğer apselerine neden olur.[7] Literatüre geçen ilk insan Chromobacterium violaceum vakası, 1927'de Malezya'da bildirilmiştir;[1] bu tarihten sonra sadece 150 vaka bildirilmiştir.[8] Günümüzde şu ana kadar Arjantin, Avustralya, Brezilya, Kanada, Küba, Hindistan, Japonya, Nijerya, Singapur, Sri Lanka, Tayvan, ABD ve Vietnam'dan vakalar bildirilmiştir. Bakterinin vücuda en yaygın giriş şekli, yaralı derinin bakteriyi içeren toprak veya suyla temasıdır.[1][9] Hastalık, genellikle bakterinin vücuda girdiği bölgede cildin sınırlı bir enfeksiyonu şeklinde başlar, nekrotizan metastatik lezyonlara ve daha sonra çok sayıda karaciğer, akciğer, dalak, deri, lenf nodu veya beyin apsesine ilerler; ölümcül olabilen çoklu organ yetmezliğiyle sonuçlanan ileri düzey septisemiye neden olur.[10] Diğer bildirilen patolojik tıbbi durumlar arasında kronik granülomatozis, osteomiyelit, selülit (deri altı enfeksiyonu), diyare (ishal), septik spondilit, periorbital ve oküler enfeksiyon bulunur.[1][11][12][13][14] Tanı koyarken dikkatli olunması gerekir çünkü çok sayıda tanımlama yöntemi, Burkholderia psuedomallei'yi C. violaceum olarak yanlış tanımlar;[15][16] bu iki bakteri kolaylıkla ayırt edilebilir çünkü B. psuedomallei büyük büzüşük koloniler oluştururken C. violaceum kendine özel bir mor pigment oluşturur.
C. violaceum, birkaç tane doğal antibiyotik üretir:
- Aztrenoam, Psuedomonas aeruginosa'yı da içeren gram negatif aerobik bakterilere karşı etkili bir monobaktam antibiyotiğidir. Bu antibiyotik, Azactam adıyla satılmaktadır.
- Violacein, amiplere ve tripanozomalara karşı etkilidir.
- Aerocyanidine, gram pozitif organizmalara karşı etkilidir.
- Aerocavin, gram pozitif ve gram negatif organizmalara karşı etkilidir.
C. violaceum, jibonlarda bir enfeksiyon nedeni olarak tanımlanmaktadır.[17]
Tedavi
C. violaceum enfeksiyonları nadir olduğu için bu enfeksiyona yönelik farklı tedavileri inceleyen klinik deneyler yapılmamaktadır. C. violaceum enfeksiyonlarını başarıyla tedavi etmede kullanılan antibiyotikler arasında pefloksasin,[4] siprofloksasin, amikasin[1] ve kotrimoksazol[18] bulunur. Laboratuvarda (in vitro) etkili olduğu gözüken diğer antibiyotikler arasında kloramfenikol ve tetrasiklin bulunur.[19] Teorik nedenlerden dolayı bakterinin penisilinlere, sefalosporinlere veya aztrenoamlara duyarlı olmadığı düşünülmektedir ancak meropenem veya imipenem gibi karbapenemler işe yarayabilir.[20] Bakterinin birinci nesil sefalosporinlere dirençli olduğu bildirilmekle birlikte daha yeni sefalosporinlere karşı duyarlılığı değişkenlik gösterir.[21]
Genom
Bakterinin tüm genomu sıralanmış ve sonuçlar 2003'te yayınlanmıştır. C. violaceum türü ATCC 12472 suşunda 64.83% guanin-sitozin (G + C) baz çifti oranına ve 4431 açık okuma çerçevesine (ORF) sahip 4.751.080 baz çifti bulunur.
Kaynakça
- ^ a b c d e f Ray, P; Sharma, J; Marak, SK; Singhi, S; Taneja, N; Garg, RK (2004). "Chromobacterium violaceum septicaemia from North India". Indian J Med Res. 120 (6): 523-6. PMID 15654137.
- ^ Kodach, LL; Bos, CL; Durán, N; Peppelenbosch, MP; Ferreira, CV; Hardwick, JC (2006). "Violacein synergistically increases 5-fluorouracil cytotoxicity, induces apoptosis and inhibits Akt-mediated signal transduction in human colorectal cancer cells". Carcinogenesis. 27 (3): 508-16. doi:10.1093/carcin/bgi307
. PMID 16344270.
- ^ Brazilian National Genome Project Consortium (2003). "The complete genome sequence of Chromobacterium violaceum reveals remarkable and exploitable bacterial adaptability". Proc Natl Acad Sci USA. 100 (20): 11660-5. Bibcode:2003PNAS..10011660.. doi:10.1073/pnas.1832124100
. PMC 208814 $2. PMID 14500782.
- ^ a b Lee, J; Kim, JS; Nahm, CH; Choi, JW; Kim, J; Pai, SH; Moon, KH; Lee, K; Chong, Y (1999). "Two Cases of Chromobacterium violaceum Infection after Injury in a Subtropical Region". J Clin Microbiol. 37 (6): 2068-2070. doi:10.1128/JCM.37.6.2068-2070.1999. PMC 85035 $2. PMID 10325383.
- ^ Itah, A. Y.; Essien, J. P. (2005). "Growth Profile and Hydrocarbonoclastic Potential of Microorganisms Isolated from Tarballs in the Bight of Bonny, Nigeria". World Journal of Microbiology and Biotechnology. 21 (6–7): 1317-22. doi:10.1007/s11274-004-6694-z.
- ^ de Siqueira IC, Dias J, Ruf H, Ramos EA, Maciel EA, Rolim A, Labur L, Vasconcelos L, Silvany C (2005). "Chromobacterium violaceum in siblings, Brazil". Emerging Infect. Dis. 11 (9): 1443-5. doi:10.3201/eid1109.050278. PMC 3310629 $2. PMID 16229777.
- ^ Sneath, PH; Whelan, JP; Bhagwan Singh, R; Edwards, D (1953). "Fatal infection by Chromobacterium violaceum". Lancet. 265 (6780): 276-7. doi:10.1016/S0140-6736(53)91132-5. PMID 13085740.
- ^ M Ravish Kumar. (2012). "Chromobacterium violaceum: A rare bacterium isolated from a wound over the scalp". Int J Appl Basic Med Res. 2 (1): 70-2. doi:10.4103/2229-516X.96814. PMC 3657989 $2. PMID 23776815.
- ^ Duran, N; Menck, FM (2001). "Chromobacterium violaceum: A review of pharmacological and industrial perspectives". Crit Rev Microbiol. 27 (3): 201-22. doi:10.1080/20014091096747. PMID 11596879.
- ^ Slesak, G; Douangdala, P; Inthalad, S; Silisouk, J; Voungsouath, M; Sengduangphachanh, A (2009). "Fatal Chromobacterium violaceum septicaemia in northern Laos, a modified oxidase test and post-mortem forensic family G6PD analysis". Ann Clin Microbiol Antimicrob. 8: 24. doi:10.1186/1476-0711-8-24. PMC 2725030 $2. PMID 19640274.
- ^ Dutta, S; Dutta, SK (2003). "Multidrug resistant chromobacterium violaceum: An unusual bacterium causing long standing wound abscess". Indian J Med Microbiol. 21 (3): 217-8. doi:10.1016/S0255-0857(21)03082-6. PMID 17643028. 13 Aralık 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 6 Mart 2015.
- ^ Chou, YL; Yang ., PY; Huang, CC; Leu, HS; Tsao, TC (2000). "Fatal and non-fatal chromobacterial septicemia: report of two cases". Chang Gung Med J. 23 (8): 492-7. PMID 11039252.
- ^ Shao, PL; Hsueh, PR; Chang, YC; Lu, CY; Lee, PY; Lee, CY; Huang, LM (2002). "Chromobacterium violaceum infection in children: a case of fatal septicemia with nasopharyngeal abscess and literature review". Pediatr Infect Dis J. 21 (7): 707-9. doi:10.1097/00006454-200207000-00022. PMID 12237610.
- ^ Chen, CH; Lin, LC; Liu, CE; Young, TG (2003). "Chromobacterium violaceum bacteremia: a case report". J Microbiol Immunol Infect. 36 (2): 141-4. PMID 12886967.
- ^ Inglis, TJ; Chiang, D; Lee, GS; Chor-Kiang, L (1998). "Potential misidentification of Burkholderia pseudomallei by API 20NE". Pathology. 30 (1): 62-64. doi:10.1080/00313029800169685. PMID 9534210.
- ^ Lowe, P; Engler, C; Norton, R (2002). "Comparison of Automated and Nonautomated Systems for Identification of Burkholderia pseudomallei". J Clin Microbiol. 40 (12): 4625-7. doi:10.1128/JCM.40.12.4625-4627.2002. PMC 154629 $2. PMID 12454163.
- ^ Groves, MG; Strauss, JM; Abbas, J; Davis, CE (1969). "Natural infections of gibbons with a bacterium producing violet pigment (Chromobacterium violaceum)". J Infect Dis. 120 (5): 605-610. doi:10.1093/infdis/120.5.605. PMID 5388196.
- ^ Moore, C; Lane, J; Stephens, J (2001). "Successful treatment of an infant with Chromobacterium violaceum sepsis". Clin Infect Dis. 32 (6): E107-10. doi:10.1086/319356
. PMID 11247733.
- ^ Martinez, R; Velludo, MA; Santos, VR; Dinamarco, PV (2000). "Chromobacterium violaceum infection in Brazil. A case report". Rev Inst Med Trop Sao Paulo. 42 (2): 111-3. doi:10.1590/s0036-46652000000200008
. PMID 10810326.
- ^ Midani, S; Rathore, M (1998). "Chromobacterium violaceum infection". South Med J. 91 (5): 464-466. doi:10.1097/00007611-199805000-00011. PMID 9598856.
- ^ Howard, AJ; Ison, CA (1996). "Haemophilus, Gardnerella and other bacilli". Collee, JG; Fraser; Marmion, BP; Simmons, A (Ed.). Mackie and McCartney Practical Medical Microbiology (İngilizce) (14.14editör2-ad=AG bas.). New York: Churchill Livingstone. ss. 329-41.
Dış bağlantılar
- Chromobacterium violaceum 14 Şubat 2023 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi. at the NCBI Taxonomy Browser
- Type strain of Chromobacterium violaceum 31 Temmuz 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi. at BacDive, the Bacterial Diversity Metadatabase