Dictyostelium
Bu sayfa hızlı silinmeye adaydır! | |
![]() | Bu sayfa, Vikipedi'nin hızlı silme politikası gereğince silinmesi için etiketlenmiştir ve bir hizmetli tarafından incelemeyi beklemektedir. Sayfanın silinmemesi gerektiğini düşünüyorsanız, gerekçenizi tartışma sayfasında belirtiniz ya da silinmeyi gerektiren durumu ortadan kaldıracak şekilde sayfayı düzenleyiniz. Sağdaki "Göster" düğmesine tıklayarak hızlı silme koşullarına göz atabilirsiniz (Lütfen bu metni sadece gerekli kuralları hatırlamak için kullanın, VP:HS sayfasındaki kuralları bildiğinizden emin olun. İlgili kriterin aşağıdaki kısaltmalar dışında ek şartları olabilir.) G1: Anlamsız karakter dizisi — G2: Deneme — G3: Vandalizm — G4: Önceden silinmiş metin — G6: Kullanıcı talebi — G7: Silinmiş sayfanın tartışması — G8: Temizlik amacıyla — G9: Telif — G10: Saldırı — G11: Reklam — G12: İlgisiz tartışma M1: Taslak kriterlerini sağlamayan madde — M2: Farklı bir dildeki madde — M3: İçeriksiz madde — M4: Başka bir Wikimedia projesine aktarılan madde — M6: Kayda değer olmayan konulu madde — M8: Düzen ve ansiklopediklik açısından uygunsuz madde — M9: Makine çevirisiyle oluşturulmuş madde Y1: Boşa yönlendirme — Y2: Kötü yönlendirme — Y3: Farklı isim alanları arasında yönlendirme D1: Çift kopya dosya — D2: Bozuk/boş dosya — D3: Uygunsuz lisanslı dosya — D6: Adil kullanımı hatalı belirtilmiş dosya — D8: Ansiklopedik açıdan değersiz dosya - D9: Kullanışsız dosya - D10: Vektörel dosya - D11: Şüpheli dosya - D12: Tanımlanamayan dosya - D13: İçeriği kaynaklandırılamayan dosya K1: Boş kategori — K2: Yeniden isimlendirme kategorisi — K3: Şablon kategorisi KS2: Var olmayan kullanıcı — KS3: Adil kullanım galerisi — KS4: İlgisiz kullanıcı sayfası Ş1: Kışkırtıcı/bölücü şablon — Ş2: Kullanılmayan şablon P1: Madde olarak silinebilecek portal — P2: Kriterleri sağlamayan portal Hizmetliler için: Lütfen sayfanın geçmişini incelemeden silme işlemini gerçekleştirmeyiniz. |
Gerekçe: | Madde 9: Niteliksiz makine çevirisiyle oluşturulmuş madde |
İsteyen: | Bu sayfa üzerindeki en son değişiklik, 3 saniye önce YBot (katkılar | kayıtlar) tarafından gerçekleştirildi. |
Dictyostelium | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Dictyostelium meyve veren gövdeler | |||||||||||||
Biyolojik sınıflandırma ![]() | |||||||||||||
| |||||||||||||
Tip tür | |||||||||||||
Dictyostelium mucoroides Brefeld 1869 | |||||||||||||
Sinonimler | |||||||||||||
|
![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bb/Dictyostelium.jpg/220px-Dictyostelium.jpg)
![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/a/a8/Contractile_vacuole_in_Dictyostelium.jpg)
Dictyostelium, tek ve çok hücreli ökaryotik, fagotrofik bakteri yiyenlerden oluşan bir cins'tir. Her ne kadar Protista olup mantar olmasalar da "balçık küfleri" olarak adlandırılır. Çoğu kara ekosisteminde toprağın normal ve bol bulunan bileşeni mikroflora olarak bulunur ve topraktaki dengeli bakteri nüfusunun korunmasında önemli rol oynar.[1][2]
Dictyostelium cinsi, hücresel balçık küfleri veya sosyal amip denilen Dictyosteliida takımındandır. Sırayla Mycetozoa alt filumundandır.
Takım üyelerinin hem tek hücrelilik hem de çok hücrelilik özellikleri olduğu için biyolojide teorik olarak çok ilgi duyulan Protistalardır. Bağımsız fazlarındaki tek tek hücreler, organik döküntülerde veya nemli topraklarda ve mağaralarda yaygındır. Bu aşamada amiptirler.
Genellikle amip hücreleri ayrı ayrı büyür ve bağımsız olarak dolaşarak bakterilerle beslenir. Ancak açlığın ardından çok hücreli yapılar oluşturmak için etkileşime girerler. Yaklaşık 100.000 hücreye kadar olan gruplar, siklik AMP (cAMP) veya glorin gibi kemo-çekici maddeleri serbest bırakarak birbirlerine sinyal verirler. Daha sonra hücre dışı matrisle çevrelenen bir bütün oluşturmak için kemotaksis ile birleşirler.
Birleşmiş küme, hücrelerin ayrı ayrı nihai yapının farklı bileşenlerine farklılaştığı, meyve veren bir gövde oluşturur.[3]
Bazı türlerde tüm küme sonunda meyve veren gövdeyi oluşturmadan önce sürü veya "sümüklüböcek" denen bir yapıyı oluşturarak toplu hareket edebilir.
Diferansiyel hücre sınıflandırması, model oluşumu, uyaranın neden olduğu gen ifadesi ve hücre tipi düzenleme gibi temel gelişim süreçleri Dictyostelium ve metazoanlar için ortaktır.
Keşif
1869'da Brefeld tarafından keşfedilmesinden önce hücresel cıvık küfün eskiden mantar olduğu düşünülüyordu. Bazı yönlerden mantarlara benzeseler de Protista krallığındandırlar.[4]
Tek tek hücreler, hareketleri ve beslenmeleri açısından küçük amiplere benzer ve bu nedenle miksamoebae denilir. Tür üzerinde en çok çalışılanı Dictyostelium discoideum'dur.
Özellikler
Bu haploid (tek kromozomlu) sosyal amip, yaşamının büyük bir bölümünde bitkisel bir döngüden geçip topraktaki bakterileri besler ve periyodik olarak mitotik olarak bölünür. Yiyecek kıt olduğunda ya cinsel döngü ya da sosyal döngü başlar. Sosyal döngü altında binlerce amip cAMP'ye yanıt olarak toplanır ve ışığa doğru hareket eden hareketli sümüklüböceğimsi bir yapı oluşturur. Sonuçta bu sümüklüböceğimsi yapı, hücrelerin yaklaşık %20'sinin öldüğü ve kalan hücrelerin sporlanma ve dağılım için daha iyi bir yere kaldırmak üzere meyve veren bir gövde oluşturur. Heterotalik veya homotallik suşlar, bakteriyel besin kaynakları açısından aç bırakıldıklarında ve karanlık, nemli koşullara maruz kaldıklarında, bir diploid zigot oluşumuyla sonuçlanan cinsel gelişime uğrayabilirler.[5] Heterotalik çiftleşme en iyi D. discoideum'da ve homotalik çiftleşme en iyi Dictyostelium mucoroides'de (DM7 suşu) incelenmiştir. Heterotallik cinsel döngüde, amipler cAMP ve cinsiyet feromonlarına yanıt olarak toplanır ve zıt çiftleşme tipindeki iki hücre birleşir ve ardından çekilen diğer hücreleri tüketmeye başlar. Av hücrelerinin bir kısmı tüketilmeden önce tüm grubun etrafında bir selüloz duvarı oluşturur. Yamyamlık tamamlandığında, dev diploid hücre sonunda yeniden birleşme ve mayoz bölünmeye uğrayan[6] ve yüzlerce yeniden birleşeni yumurtadan çıkaran dayanıklı bir makrokist olur.[7][8]
D. mucoroides (DM7) homotalik çiftleşmede hücreler etilen tarafından cinsel gelişime yönlendirilir.[5] Bilim insanları ayrıca kolektif hücre göçünün, çok hücreli aşamalarda cAMP salınımları olmadan da gerçekleşebileceğini buldular ve bu ilginç doğa olayını yorumlamak için yeni modeller önerildi.[9]
Sosyal özellikler
Profesör John Tyler Bonner (1920-2019) tüm hayatını cıvık mantarları araştırmak için harcamış ve 1940'larda yaşam döngüsünü göstermek için bir dizi büyüleyici film yapmış ve çoğunlukla D. discoideum üzerinde çalışmıştır. Videolardaki zeka, tekil hücrelerin ayrıldıktan sonra hücresel kütle halinde yeniden gruplanmasıyla gözlemlenir gibi görünür. Hızlandırılmış film izleyicileri büyüledi. Gerçekten de Bonner konferanslar verirken filmin "her zaman gösteriyi çaldığını" belirtti.[10] Videosu YouTube'dan izlenebilir.[11]
Organizmalar bir araya geldiğinde kitle genetik olarak farklı hücrelerden oluşur. Doğal seçilim yoluyla, hangi organizmanın genetik bilgisinin gelecek nesillerde bulunacağı belirlenir. Çatışma, kimera sporlarında genetik olarak farklı iki klonun eşit olmayan temsilleri, göç eden kimeralarda görülen işlevsellik azalması ve diğerlerini genetik bilgi çıktısını durdurmaya zorlayan hücrelerden yapılmış gibi görünen, zehire benzer, farklılaşma uyarıcı faktör (DIF) sistemi ile kanıtlanır.[12]
Türler
Dictyosteliumun taksonomisi karmaşıktır. Ayrıca yaşam döngüsü aşamalarındaki farklı formlar ve benzer Polysphondylium türleri nedeniyle de karıştırılır. Aşağıda bazı örnekleri verilmiştir.[13]
- Dictyostelium annularibasimum Li, Liu & Zhao 2016
- Dictyostelium arabicum Hagiwara 1991
- Dictyostelium barbarae Stephenson et al. 2019
- Dictyostelium culliculosum Li & He 2008
- Dictyostelium dichotomum Vadell & Cavender 2007
- Dictyostelium germanicum Cavender et al. 1995
- Dictyostelium globisporum Li & Liu 2011
- Dictyostelium insulinativitatis Stephenson et al. 2019
- Dictyostelium irregularis Olive et al. 1967
- Dictyostelium magnum Hagiw. 1983
- Dictyostelium microsorocarpum Li & He 2010
- Dictyostelium roseum van Tieghem 1880
- Dictyostelium vermiformum Vadell & Cavender 2007
- Dictyostelium ammophilum Romeralo et al. 2010 ex Baldauf, Sheikh & Thulin 2017
- Dictyostelium aureocephalum Hagiwara 1991
- Dictyostelium aureum Olive 1901
- Dictyostelium austroandinum Vadell et al. 2011
- Dictyostelium barbibulus Perrigo & Romeralo 2013
- Dictyostelium brefeldianum Hagiw. 1984
- Dictyostelium brevicaule Olive 1901
- Dictyostelium brunneum Kawabe 1982
- Dictyostelium capitatum Hagiwara 1983
- Dictyostelium chordatum Vadell et al. 2011
- Dictyostelium citrinum Vadell et al. 1995
- Dictyostelium clavatum Hagiwara 1992
- Dictyostelium crassicaule Hagiwara 1984
- Dictyostelium dimigraformum Cavender 1970
- Dictyostelium discoideum Raper 1935[14]
- Dictyostelium firmibasis Hagiwara 1971
- Dictyostelium gargantuum Vadell et al. 2011
- Dictyostelium giganteum Singh 1947
- Dictyostelium implicatum Hagiwara 1984
- Dictyostelium intermedium Cavender 1976
- Dictyostelium leptosomopsis Vadell et al. 2011
- Dictyostelium leptosomum Cavender et al. 2002
- Dictyostelium longosporum Hagiwara 1983
- Dictyostelium macrocephalum Hagiwara 1985
- Dictyostelium medium Hagiwara 1992
- Dictyostelium mucoroides Brefeld 1869
- Dictyostelium pseudobrefeldianum Hagiwara 1996
- Dictyostelium purpureum Olive 1901
- Dictyostelium quercibrachium Cavender et al. 2002
- Dictyostelium robustum Hagiwara 1996
- Dictyostelium rosarium Raper & Cavender 1968
- Dictyostelium septentrionale Cavender 1978
- Dictyostelium sphaerocephalum (Oudem. 1885) Saccardo, Marchal & Marchal 1885
- Dictyostelium valdivianum Vadell et al. 2011
Kaynakça
- ^ Landolt. C. (2006) Dictyostelid Cellular Slime Molds from Caves. Journal of Cave and Karst studies v. 68 no. 1 pp. 22-26.
- ^ Pears, Catherine J.; Gross, Julian D. (1 Mart 2021). "Microbe Profile: Dictyostelium discoideum: model system for development, chemotaxis and biomedical research". Microbiology (İngilizce). 167 (3). doi:10.1099/mic.0.001040. ISSN 1350-0872. PMID 33646931. 14 Haziran 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 27 Aralık 2023.
- ^ "About Dictyostelium". dictybase.org. 16 Ekim 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 27 Aralık 2023.
- ^ Kessin, R (2001). 0-521-58364-0.
- ^ a b O'Day DH, Keszei A (May 2012). "Signalling and sex in the social amoebozoans". Biol Rev Camb Philos Soc. 87 (2): 313-29. doi:10.1111/j.1469-185X.2011.00200.x. PMID 21929567.
- ^ Macinnes MA, Francis D. Meiosis in Dictyostelium mucoroides. Nature. 1974 Sep 27;251(5473):321-4. doi: 10.1038/251321a0. PMID 4473717
- ^ "Dictyostelium". www.ruf.rice.edu. 31 Ağustos 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 27 Aralık 2023.
- ^ "dictyBase Home". dictybase.org. 8 Eylül 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 27 Aralık 2023.
- ^ Ueda, Masahiro; Masato Yasui; Morimoto, Yusuke V.; Hashimura, Hidenori (24 Ocak 2019). "Collective cell migration of Dictyostelium without cAMP oscillations at multicellular stages". Communications Biology (İngilizce). 2 (1): 34. doi:10.1038/s42003-018-0273-6. ISSN 2399-3642. PMC 6345914 $2. PMID 30701199.
- ^ "The Embryo Project Encyclopedia". 14 Mart 2012 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 16 Temmuz 2011.
- ^ Archived at Ghostarchive and the Wayback Machine: Princeton University (22 Ocak 2010). "John Bonner's slime mold movies". 25 Aralık 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi – YouTube vasıtasıyla.
- ^ Strassmann, Joan E.; Queller, David C. (May 2011). "How social evolution theory impacts our understanding of development in the social amoeba Dictyostelium". Development, Growth & Differentiation. 53 (4): 597-607. doi:10.1111/j.1440-169X.2011.01272.x. ISSN 1440-169X. PMID 21585362.
- ^ Sheikh, Sanea; Thulin, Mats; Cavender, James C; Escalante, Ricardo; Kawakami, Shin-ichi; Lado, Carlos; Landolt, John; Nanjundiah, Vidyanand; Queller, David; Strassmann, Joan; Spiegel, Frederick W.; Stephenson, Steve; Vadell, Eduardo M; Baldauf, Sandra (24 Kasım 2017). "A New Classification of the Dictyostelids". Protists. 169 (1): 1-28. doi:10.1016/j.protis.2017.11.001. PMID 29367151.
- ^ Raper, K.B. (1935). "Dictyostelium discoideum, a new species of slime mold from decaying forest leaves". Journal of Agricultural Research. 50: 135-147. 8 Aralık 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 8 Aralık 2017.