Компонент системи комплементу 1s

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1ELV, 1NZI, 4J1Y, 4LMF, 4LOR, 4LOS, 4LOT

Ідентифікатори

Символи

C1S, EDSPD2, complement C1s

Зовнішні ІД

OMIM: 120580 MGI: 3644269 HomoloGene: 1314 GeneCards: C1S

шифр КФ

3.4.21.42

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • GO:0070122 peptidase activity • serine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • serine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• blood microparticle • екзосома • extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• протеоліз • complement activation, classical pathway • процес імунної системи • вроджений імунітет • complement activation, lectin pathway • complement activation • regulation of complement activation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


716


317677

Ensembl


ENSG00000182326


ENSMUSG00000079343

UniProt


P09871


Q8CFG8

RefSeq (мРНК)


NM_001734 NM_201442 NM_001346850


NM_173864

RefSeq (білок)


NP_001333779 NP_001725 NP_958850


NP_776289

Локус (UCSC)

Хр. 12: 6.99 – 7.07 Mb

Хр. 6: 124.6 – 124.61 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Компонент системи комплементу 1s (англ. Complement C1s) – білок, який кодується геном C1S, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 688 амінокислот, а молекулярна маса — 76 684^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWCIVLFSLL	AWVYAEPTMY	GEILSPNYPQ	AYPSEVEKSW	DIEVPEGYGI
HLYFTHLDIE	LSENCAYDSV	QIISGDTEEG	RLCGQRSSNN	PHSPIVEEFQ
VPYNKLQVIF	KSDFSNEERF	TGFAAYYVAT	DINECTDFVD	VPCSHFCNNF
IGGYFCSCPP	EYFLHDDMKN	CGVNCSGDVF	TALIGEIASP	NYPKPYPENS
RCEYQIRLEK	GFQVVVTLRR	EDFDVEAADS	AGNCLDSLVF	VAGDRQFGPY
CGHGFPGPLN	IETKSNALDI	IFQTDLTGQK	KGWKLRYHGD	PMPCPKEDTP
NSVWEPAKAK	YVFRDVVQIT	CLDGFEVVEG	RVGATSFYST	CQSNGKWSNS
KLKCQPVDCG	IPESIENGKV	EDPESTLFGS	VIRYTCEEPY	YYMENGGGGE
YHCAGNGSWV	NEVLGPELPK	CVPVCGVPRE	PFEEKQRIIG	GSDADIKNFP
WQVFFDNPWA	GGALINEYWV	LTAAHVVEGN	REPTMYVGST	SVQTSRLAKS
KMLTPEHVFI	HPGWKLLEVP	EGRTNFDNDI	ALVRLKDPVK	MGPTVSPICL
PGTSSDYNLM	DGDLGLISGW	GRTEKRDRAV	RLKAARLPVA	PLRKCKEVKV
EKPTADAEAY	VFTPNMICAG	GEKGMDSCKG	DSGGAFAVQD	PNDKTKFYAA
GLVSWGPQCG	TYGLYTRVKN	YVDWIMKTMQ	ENSTPRED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, шлях активації комплементу. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію.

Література

McKinnon C.M., Carter P.E., Smyth S.J., Dunbar B., Fothergill J.E. (1987). Molecular cloning of cDNA for human complement component C1s. The complete amino acid sequence. Eur. J. Biochem. 169: 547—553. PMID 3500856 DOI:10.1111/j.1432-1033.1987.tb13644.x
Tosi M., Duponchel C., Meo T., Julier C. (1987). Complete cDNA sequence of human complement Cls and close physical linkage of the homologous genes Cls and Clr. Biochemistry. 26: 8516—8524. PMID 2831944 DOI:10.1021/bi00400a004
Kusumoto H., Hirosawa S., Salier J.-P., Hagen F.S., Kurachi K. (1988). Human genes for complement components C1r and C1s in a close tail-to-tail arrangement. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 7307—7311. PMID 2459702 DOI:10.1073/pnas.85.19.7307
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tosi M., Duponchel C., Meo T., Couture-Tosi E. (1989). Complement genes C1r and C1s feature an intronless serine protease domain closely related to haptoglobin. J. Mol. Biol. 208: 709—714. PMID 2553984 DOI:10.1016/0022-2836(89)90161-7
Spycher S.E., Nick H., Rickli E.E. (1986). Human complement component C1s. Partial sequence determination of the heavy chain and identification of the peptide bond cleaved during activation. Eur. J. Biochem. 156: 49—57. PMID 3007145 DOI:10.1111/j.1432-1033.1986.tb09546.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1247 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
↑ UniProt, P09871 (англ.) . Архів оригіналу за 25 Серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.