ABCA1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ABCA1, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 1, Abca1, ABC-1, Abc1, ABC1, CERP, HDLDT1, TGD, ATP binding cassette subfamily A member 1, HDLCQTL13, HPALP1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600046 MGI: 99607 HomoloGene: 21130 GeneCards: ABCA1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
короткозорість, метаболічні захворювання, lipid metabolism disorder, ішемічна хвороба серця, Tangier disease[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
probucol, probucol[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ATPase-coupled transmembrane transporter activity • apolipoprotein binding • nucleotide binding • ATPase binding • apolipoprotein A-I receptor activity • anion transmembrane transporter activity • phospholipid transporter activity • cholesterol binding • small GTPase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin binding • signaling receptor binding • phospholipid binding • ATP binding • GO:0017127 cholesterol transfer activity • phosphatidylserine floppase activity • ATPase activity • phosphatidylcholine floppase activity • apolipoprotein A-I binding • high-density lipoprotein particle binding • lipid transporter activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • клітинна мембрана • endocytic vesicle • integral component of plasma membrane • cell surface • phagocytic vesicle • high-density lipoprotein particle • perinuclear region of cytoplasm • membrane raft • external side of plasma membrane • endoplasmic reticulum membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • ендосома |
---|
Біологічний процес | • G protein-coupled receptor signaling pathway • cellular response to retinoic acid • phospholipid homeostasis • steroid metabolic process • platelet dense granule organization • regulation of Cdc42 protein signal transduction • response to nutrient • lipid metabolism • phospholipid efflux • phospholipid transport • cholesterol transport • response to laminar fluid shear stress • peptide secretion • cholesterol metabolic process • cellular response to cholesterol • negative regulation of cholesterol storage • endosomal transport • phagocytosis, engulfment • anion transmembrane transport • intracellular cholesterol transport • cholesterol efflux • protein lipidation • lipoprotein biosynthetic process • lysosome organization • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation • reverse cholesterol transport • apolipoprotein A-I-mediated signaling pathway • positive regulation of cholesterol efflux • phospholipid translocation • regulation of high-density lipoprotein particle assembly • трансмембранний транспорт • cholesterol homeostasis • regulation of lipid metabolic process • high-density lipoprotein particle assembly • lipoprotein metabolic process • adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus • lipid transport • positive regulation of high-density lipoprotein particle assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2c/PBB_GE_ABCA1_216066_at_fs.png/250px-PBB_GE_ABCA1_216066_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a4/PBB_GE_ABCA1_203504_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ABCA1_203504_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 104.78 – 104.93 Mb | Хр. 4: 53.03 – 53.16 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ABCA1 (англ. ATP binding cassette subfamily A member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 261 амінокислот, а молекулярна маса — 254 302[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MACWPQLRLL | | LWKNLTFRRR | | QTCQLLLEVA | | WPLFIFLILI | | SVRLSYPPYE |
QHECHFPNKA | | MPSAGTLPWV | | QGIICNANNP | | CFRYPTPGEA | | PGVVGNFNKS |
IVARLFSDAR | | RLLLYSQKDT | | SMKDMRKVLR | | TLQQIKKSSS | | NLKLQDFLVD |
NETFSGFLYH | | NLSLPKSTVD | | KMLRADVILH | | KVFLQGYQLH | | LTSLCNGSKS |
EEMIQLGDQE | | VSELCGLPRE | | KLAAAERVLR | | SNMDILKPIL | | RTLNSTSPFP |
SKELAEATKT | | LLHSLGTLAQ | | ELFSMRSWSD | | MRQEVMFLTN | | VNSSSSSTQI |
YQAVSRIVCG | | HPEGGGLKIK | | SLNWYEDNNY | | KALFGGNGTE | | EDAETFYDNS |
TTPYCNDLMK | | NLESSPLSRI | | IWKALKPLLV | | GKILYTPDTP | | ATRQVMAEVN |
KTFQELAVFH | | DLEGMWEELS | | PKIWTFMENS | | QEMDLVRMLL | | DSRDNDHFWE |
QQLDGLDWTA | | QDIVAFLAKH | | PEDVQSSNGS | | VYTWREAFNE | | TNQAIRTISR |
FMECVNLNKL | | EPIATEVWLI | | NKSMELLDER | | KFWAGIVFTG | | ITPGSIELPH |
HVKYKIRMDI | | DNVERTNKIK | | DGYWDPGPRA | | DPFEDMRYVW | | GGFAYLQDVV |
EQAIIRVLTG | | TEKKTGVYMQ | | QMPYPCYVDD | | IFLRVMSRSM | | PLFMTLAWIY |
SVAVIIKGIV | | YEKEARLKET | | MRIMGLDNSI | | LWFSWFISSL | | IPLLVSAGLL |
VVILKLGNLL | | PYSDPSVVFV | | FLSVFAVVTI | | LQCFLISTLF | | SRANLAAACG |
GIIYFTLYLP | | YVLCVAWQDY | | VGFTLKIFAS | | LLSPVAFGFG | | CEYFALFEEQ |
GIGVQWDNLF | | ESPVEEDGFN | | LTTSVSMMLF | | DTFLYGVMTW | | YIEAVFPGQY |
GIPRPWYFPC | | TKSYWFGEES | | DEKSHPGSNQ | | KRISEICMEE | | EPTHLKLGVS |
IQNLVKVYRD | | GMKVAVDGLA | | LNFYEGQITS | | FLGHNGAGKT | | TTMSILTGLF |
PPTSGTAYIL | | GKDIRSEMST | | IRQNLGVCPQ | | HNVLFDMLTV | | EEHIWFYARL |
KGLSEKHVKA | | EMEQMALDVG | | LPSSKLKSKT | | SQLSGGMQRK | | LSVALAFVGG |
SKVVILDEPT | | AGVDPYSRRG | | IWELLLKYRQ | | GRTIILSTHH | | MDEADVLGDR |
IAIISHGKLC | | CVGSSLFLKN | | QLGTGYYLTL | | VKKDVESSLS | | SCRNSSSTVS |
YLKKEDSVSQ | | SSSDAGLGSD | | HESDTLTIDV | | SAISNLIRKH | | VSEARLVEDI |
GHELTYVLPY | | EAAKEGAFVE | | LFHEIDDRLS | | DLGISSYGIS | | ETTLEEIFLK |
VAEESGVDAE | | TSDGTLPARR | | NRRAFGDKQS | | CLRPFTEDDA | | ADPNDSDIDP |
ESRETDLLSG | | MDGKGSYQVK | | GWKLTQQQFV | | ALLWKRLLIA | | RRSRKGFFAQ |
IVLPAVFVCI | | ALVFSLIVPP | | FGKYPSLELQ | | PWMYNEQYTF | | VSNDAPEDTG |
TLELLNALTK | | DPGFGTRCME | | GNPIPDTPCQ | | AGEEEWTTAP | | VPQTIMDLFQ |
NGNWTMQNPS | | PACQCSSDKI | | KKMLPVCPPG | | AGGLPPPQRK | | QNTADILQDL |
TGRNISDYLV | | KTYVQIIAKS | | LKNKIWVNEF | | RYGGFSLGVS | | NTQALPPSQE |
VNDAIKQMKK | | HLKLAKDSSA | | DRFLNSLGRF | | MTGLDTKNNV | | KVWFNNKGWH |
AISSFLNVIN | | NAILRANLQK | | GENPSHYGIT | | AFNHPLNLTK | | QQLSEVALMT |
TSVDVLVSIC | | VIFAMSFVPA | | SFVVFLIQER | | VSKAKHLQFI | | SGVKPVIYWL |
SNFVWDMCNY | | VVPATLVIII | | FICFQQKSYV | | SSTNLPVLAL | | LLLLYGWSIT |
PLMYPASFVF | | KIPSTAYVVL | | TSVNLFIGIN | | GSVATFVLEL | | FTDNKLNNIN |
DILKSVFLIF | | PHFCLGRGLI | | DMVKNQAMAD | | ALERFGENRF | | VSPLSWDLVG |
RNLFAMAVEG | | VVFFLITVLI | | QYRFFIRPRP | | VNAKLSPLND | | EDEDVRRERQ |
RILDGGGQND | | ILEIKELTKI | | YRRKRKPAVD | | RICVGIPPGE | | CFGLLGVNGA |
GKSSTFKMLT | | GDTTVTRGDA | | FLNKNSILSN | | IHEVHQNMGY | | CPQFDAITEL |
LTGREHVEFF | | ALLRGVPEKE | | VGKVGEWAIR | | KLGLVKYGEK | | YAGNYSGGNK |
RKLSTAMALI | | GGPPVVFLDE | | PTTGMDPKAR | | RFLWNCALSV | | VKEGRSVVLT |
SHSMEECEAL | | CTRMAIMVNG | | RFRCLGSVQH | | LKNRFGDGYT | | IVVRIAGSNP |
DLKPVQDFFG | | LAFPGSVLKE | | KHRNMLQYQL | | PSSLSSLARI | | FSILSQSKKR |
LHIEDYSVSQ | | TTLDQVFVNF | | AKDQSDDDHL | | KDLSLHKNQT | | VVDVAVLTSF |
LQDEKVKESY | | V |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, транспорт, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані.
Література
- Singaraja R.R., Brunham L.R., Visscher H., Kastelein J.J.P., Hayden M.R. (2003). Efflux and atherosclerosis: the clinical and biochemical impact of variations in the ABCA1 gene. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 23: 1322—1332. PMID 12763760 DOI:10.1161/01.ATV.0000078520.89539.77
- Hozoji M., Kimura Y., Kioka N., Ueda K. (2009). Formation of two intramolecular disulfide bonds is necessary for ApoA-I-dependent cholesterol efflux mediated by ABCA1. J. Biol. Chem. 284: 11293—11300. PMID 19258317 DOI:10.1074/jbc.M900580200
- Hong S.H., Rhyne J., Zeller K., Miller M. (2002). ABCA1(Alabama): a novel variant associated with HDL deficiency and premature coronary artery disease. Atherosclerosis. 164: 245—250. PMID 12204794 DOI:10.1016/S0021-9150(02)00106-5
- Hong S.H., Rhyne J., Zeller K., Miller M. (2002). Novel ABCA1 compound variant associated with HDL cholesterol deficiency. Biochim. Biophys. Acta. 1587: 60—64. PMID 12009425 DOI:10.1016/S0925-4439(02)00066-2
- Hong S.H., Rhyne J., Miller M. (2003). Novel polypyrimidine variation (IVS46: del T -39._.-46) in ABCA1 causes exon skipping and contributes to HDL cholesterol deficiency in a family with premature coronary disease. Circ. Res. 93: 1006—1012. PMID 14576201 DOI:10.1161/01.RES.0000102957.84247.8F
- Frikke-Schmidt R., Nordestgaard B.G., Jensen G.B., Tybjaerg-Hansen A. (2004). Genetic variation in ABC transporter A1 contributes to HDL cholesterol in the general population. J. Clin. Invest. 114: 1343—1353. PMID 15520867 DOI:10.1172/JCI200420361
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ABCA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з ABCA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O95477 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |