AGBL4

Ідентифікатори

Символи

AGBL4, CCP6, ATP/GTP binding protein-like 4, ATP/GTP binding protein like 4, AGBL carboxypeptidase 4

Зовнішні ІД

OMIM: 616476 MGI: 1918244 HomoloGene: 84880 GeneCards: AGBL4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• carboxypeptidase activity • tubulin binding • zinc ion binding • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу • metallocarboxypeptidase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • ciliary basal body • Центріоль • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • цитоскелет
Біологічний процес	• C-terminal protein deglutamylation • protein side chain deglutamylation • протеоліз • protein deglutamylation • defense response to virus
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84871


78933

Ensembl


ENSG00000186094


ENSMUSG00000061298

UniProt


Q5VU57


Q09LZ8

RefSeq (мРНК)


NM_032785 NM_001323573 NM_001323574 NM_001323575


NM_001048189 NM_001284190 NM_030231

RefSeq (білок)


NP_001310502 NP_001310503 NP_001310504 NP_116174


NP_001041654 NP_001271119 NP_084507

Локус (UCSC)

Хр. 1: 48.53 – 50.02 Mb

Хр. 4: 110.25 – 111.52 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AGBL4 (англ. ATP/GTP binding protein like 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 503 амінокислот, а молекулярна маса — 58 230^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEGSQSAPE	AGNDMGNDDA	IGGNVSKYIV	LPTGYCGQPK	KGHLIFDACF
ESGNLGRVDQ	VSEFEYDLFI	RPDTCNPRFR	VWFNFTVENV	KESQRVIFNI
VNFSKTKSLY	RDGMAPMVKS	TSRPKWQRLP	PKNVYYYRCP	DHRKNYVMSF
AFCFDREEDI	YQFAYCYPYT	YTRFQHYLDS	LQKRNMDYFF	REQLGQSVQQ
RKLDLLTITS	PDNLREGAEQ	KVVFITGRVH	PGETPSSFVC	QGIIDFLVSQ
HPIACVLREY	LVFKIAPMLN	PDGVYLGNYR	CSLMGFDLNR	HWLDPSPWVH
PTLHGVKQLI	VQMYNDPKTS	LEFYIDIHAH	STMMNGFMYG	NIFEDEERFQ
RQAIFPKLLC	QNAEDFSYSS	TSFNRDAVKA	GTGRRFLGGL	LDHTSYCYTL
EVSFYSYIIS	GTTAAVPYTE	EAYMKLGRNV	ARTFLDYYRL	NPVVEKVAIP
MPRLRNKEIE	VQRRKEKSPP	YKHPLLRGPA	SNYPNSKGDK	KSSVNHKDPS
TPF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, карбоксипептидаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, апараті гольджі.

Література

Rodriguez de la Vega Otazo M., Lorenzo J., Tort O., Aviles F.X., Bautista J.M. (2013). Functional segregation and emerging role of cilia-related cytosolic carboxypeptidases (CCPs). FASEB J. 27: 424—431. PMID 23085998 DOI:10.1096/fj.12-209080

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25892 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q5VU57 (англ.) . Архів оригіналу за 25 грудня 2016. Процитовано 18 вересня 2017.