AMBRA1

AMBRA1
Ідентифікатори
Символи AMBRA1, DCAF3, WDR94, autophagy and beclin 1 regulator 1
Зовнішні ІД OMIM: 611359 MGI: 2443564 HomoloGene: 18204 GeneCards: AMBRA1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• ubiquitin protein ligase binding
• GTPase binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• autophagosome
• мітохондріальна зовнішня мембрана
• phagocytic vesicle
• мітохондрія
• perinuclear region of cytoplasm
• GO:0035085 Аксонема
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• гіалоплазма

Біологічний процес

• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
• диференціація клітин
• нейробіологія розвитку
• positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity
• автофагія
• multicellular organism development
• neural tube development
• macroautophagy
• negative regulation of cell population proliferation
• cellular response to starvation
• positive regulation of autophagy
• negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process
• response to nutrient levels
• autophagosome assembly
• autophagy of mitochondrion
• mitophagy
• response to mitochondrial depolarisation

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
55626
228361
Ensembl
ENSG00000110497
ENSMUSG00000040506
UniProt
Q9C0C7
A2AH22
RefSeq (мРНК)
NM_001267782
NM_001267783
NM_001300731
NM_017749
NM_001367468
NM_001367469
NM_001367470
NM_001367471
NM_001387011
NM_001080754
NM_172669
RefSeq (білок)
NP_001254711
NP_001254712
NP_001287660
NP_060219
NP_001354397
NP_001354398
NP_001354399
NP_001354400
NP_001074223
NP_766257
Локус (UCSC) Хр. 11: 46.4 – 46.59 Mb Хр. 2: 91.56 – 91.75 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

AMBRA1 (англ. Autophagy and beclin 1 regulator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 298 амінокислот, а молекулярна маса — 142 507[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKVVPEKNAVRILWGRERGARAMGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELP
DSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVNHNIYITEVKTGKCVHSLIGHRRTPWC
VTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPTAQ
LLLIATANEIHFWDWSRREPFAVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIV
NPSNQQGDDEPEIPIDGTELSHYRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSR
SSGIQVGEQSTVQDSATPSPPPPPPQPSTERPRTSAYIRLRQRVSYPTAE
CCQHLGILCLCSRCSGTRVPSLLPHQDSVPPASARATTPSFSFVQTEPFH
PPEQASSTQQDQGLLNRPSAFSTVQSSTAGNTLRNLSLGPTRRSLGGPLS
SHPSRYHREIAPGLTGSEWTRTVLSLNSRSEAESMPPPRTSASSVSLLSV
LRQQEGGSQASVYTSATEGRGFPASGLATESDGGNGSSQNNSGSIRHELQ
CDLRRFFLEYDRLQELDQSLSGEAPQTQQAQEMLNNNIESERPGPSHQPT
PHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERTTPNYSSGEASSSW
QVPSSFESVPSSGSQLPPLERTEGQTPSSSRLELSSSASPQEERTVGVAF
NQETGHWERIYTQSSRSGTVSQEALHQDMPEESSEEDSLRRRLLESSLIS
LSRYDGAGSREHPIYPDPARLSPAAYYAQRMIQYLSRRDSIRQRSMRYQQ
NRLRSSTSSSSSDNQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPS
LGRFVPRRFLLPEYLPYAGIFHERGQPGLATHSSVNRVLAGAVIGDGQSA
VASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQNCKIYNDASCDISAD
GQLLAAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLS
PMGRYVMVGLASRRILLHPSTEHMVAQVFRLQQAHGGETSMRRVFNVLYP
MPADQRRHVSINSARWLPEPGLGLAYGTNKGDLVICRPEALNSGVEYYWD
QLNETVFTVHSNSRSSERPGTSRATWRTDRDMGLMNAIGLQPRNPATSVT
SQGTQTLALQLQNAETQTEREVPEPGTAASGPGEGEGSEYGASGEDALSR
IQRLMAEGGMTAVVQREQSTTMASMGGFGNNIIVSHRIHRSSQTGTEPGA
AHTSSPQPSTSRGLLPEAGQLAERGLSPRTASWDQPGTPGREPTQPTLPS
SSPVPIPVSLPSAEGPTLHCELTNNNHLLDGGSSRGDAAGPRGEPRNR

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг, метилювання. Локалізований у цитоплазматичних везикулах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25990 (англ.) . Архів оригіналу за 13 жовтня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q9C0C7 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.