APP

APP
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1AAP, 1AMB, 1AMC, 1AML, 1BA4, 1BA6, 1BJB, 1BJC, 1BRC, 1CA0, 1HZ3, 1IYT, 1MWP, 1OWT, 1QCM, 1QWP, 1QXC, 1QYT, 1TAW, 1TKN, 1X11, 1Z0Q, 1ZJD, 2BEG, 2BP4, 2FJZ, 2FK1, 2FK2, 2FK3, 2FKL, 2FMA, 2G47, 2IPU, 2LFM, 2LLM, 2LMN, 2LMO, 2LMP, 2LMQ, 2LOH, 2LP1, 2OTK, 2R0W, 2WK3, 2Y29, 2Y2A, 2Y3J, 2Y3K, 2Y3L, 3AYU, 3DXC, 3DXD, 3DXE, 3GCI, 3IFL, 3IFN, 3IFO, 3IFP, 3JTI, 3KTM, 3L33, 3L81, 3MOQ, 3NYL, 3SV1, 3U0T, 3UMH, 3UMI, 3UMK, 4HIX, 1ZE7, 1ZE9, 2LNQ, 2LZ3, 2LZ4, 2M4J, 2M9R, 2M9S, 2MGT, 2MJ1, 2MPZ, 2MVX, 2MXU, 3BAE, 3BKJ, 3JQ5, 3JQL, 3MXC, 3NYJ, 3OVJ, 3OW9, 4JFN, 4M1C, 4MDR, 4NGE, 4OJF, 4ONF, 4ONG, 4PQD, 4PWQ, 4MVI, 4MVK, 4MVL, 4XXD, 5CSZ, 5AMB, 5AEF, 5AM8, 5BUO, 5HOY, 5HOW, 5HOX, 5KK3, 5C67, 2NAO

Ідентифікатори
Символи APP, AAA, ABETA, ABPP, AD1, APPI, CTFgamma, CVAP, PN-II, PN2, amyloid beta precursor protein, preA4, alpha-sAPP
Зовнішні ІД OMIM: 104760 MGI: 88059 HomoloGene: 56379 GeneCards: APP
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера[1]
Реагує на сполуку
aducanumab[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• heparin binding
• signaling receptor binding
• acetylcholine receptor binding
• зв'язування з іоном металу
• enzyme binding
• peptidase activator activity
• peptidase inhibitor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• DNA binding
• growth factor receptor binding
• PTB domain binding
• serine-type endopeptidase inhibitor activity
• identical protein binding
• transition metal ion binding
• signaling receptor activator activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• ендосома
• гіалоплазма
• trans-Golgi network membrane
• мембрана
• cell-cell junction
• синапс
• extracellular region
• ciliary rootlet
• spindle midzone
• neuron projection
• rough endoplasmic reticulum
• dendritic spine
• endosome lumen
• dendritic shaft
• cell surface
• terminal bouton
• membrane raft
• екзосома
• integral component of membrane
• комплекс Ґольджі
• growth cone
• neuromuscular junction
• receptor complex
• клітинна мембрана
• apical part of cell
• astrocyte projection
• growth cone lamellipodium
• аксон
• nuclear envelope lumen
• clathrin-coated pit
• platelet alpha granule lumen
• integral component of plasma membrane
• main axon
• smooth endoplasmic reticulum
• COPII-coated ER to Golgi transport vesicle
• growth cone filopodium
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• міжклітинний простір
• Golgi lumen
• perinuclear region of cytoplasm
• early endosome
• endoplasmic reticulum lumen
• Golgi-associated vesicle
• cell projection
• перикаріон
• presynaptic active zone
• recycling endosome
• клітинне ядро
• Синаптичні бульбашки

Біологічний процес

• cellular response to nerve growth factor stimulus
• amyloid fibril formation
• negative regulation of neuron differentiation
• neuromuscular process controlling balance
• protein phosphorylation
• regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity
• cellular copper ion homeostasis
• neuron projection development
• cellular response to cAMP
• suckling behavior
• GO:0097285 апоптоз
• locomotory behavior
• adult locomotory behavior
• positive regulation of mitotic cell cycle
• axo-dendritic transport
• GO:0001306 response to oxidative stress
• mRNA polyadenylation
• collateral sprouting in absence of injury
• ionotropic glutamate receptor signaling pathway
• Сигнальний шлях Notch
• negative regulation of peptidase activity
• smooth endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis
• synaptic assembly at neuromuscular junction
• neuron remodeling
• dendrite development
• extracellular matrix organization
• cholesterol metabolic process
• поведінка в часі спарювання
• cellular response to norepinephrine stimulus
• нейробіологія розвитку
• адгезія клітин
• response to lead ion
• регуляція експресії генів
• positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle
• axon midline choice point recognition
• visual learning
• ендоцитоз
• аксоноґенеза
• regulation of multicellular organism growth
• platelet degranulation
• positive regulation of peptidase activity
• forebrain development
• regulation of protein binding
• regulation of translation
• regulation of synapse structure or activity
• GO:0006928 клітинний процес
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• negative regulation of endopeptidase activity
• response to yeast
• antibacterial humoral response
• antifungal humoral response
• вроджений імунітет
• GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium
• GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium
• neuron apoptotic process
• positive regulation of protein phosphorylation
• astrocyte activation involved in immune response
• G protein-coupled receptor signaling pathway
• learning or memory
• навчення
• negative regulation of cell population proliferation
• response to radiation
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• negative regulation of gene expression
• positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation
• microglia development
• regulation of Wnt signaling pathway
• positive regulation of protein binding
• tumor necrosis factor production
• positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation
• positive regulation of phosphorylation
• посттрансляційна модифікація
• positive regulation of JNK cascade
• astrocyte activation
• regulation of long-term neuronal synaptic plasticity
• regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
• synapse organization
• когнітивність
• positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• positive regulation of astrocyte activation
• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• cellular response to copper ion
• cellular response to manganese ion
• modulation of excitatory postsynaptic potential
• regulation of spontaneous synaptic transmission
• negative regulation of long-term synaptic potentiation
• positive regulation of long-term synaptic potentiation
• positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling
• positive regulation of amyloid-beta formation
• positive regulation of microglial cell activation
• cellular response to amyloid-beta
• negative regulation of low-density lipoprotein receptor activity
• regulation of presynapse assembly
• positive regulation of amyloid fibril formation
• neuron projection maintenance
• positive regulation of signaling receptor activity
• regulation of NMDA receptor activity
• positive regulation of T cell migration
• response to interleukin-1
• positive regulation of glycolytic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
351
11820
Ensembl
ENSG00000142192
ENSMUSG00000022892
UniProt
P05067
P12023
RefSeq (мРНК)
NM_201414
NM_000484
NM_001136016
NM_001136129
NM_001136130
NM_001136131
NM_001204301
NM_001204302
NM_001204303
NM_201413
NM_001385253
NM_001198823
NM_001198824
NM_001198825
NM_001198826
NM_007471
RefSeq (білок)
NP_000475
NP_001129488
NP_001129601
NP_001129602
NP_001129603
NP_001191230
NP_001191231
NP_001191232
NP_958816
NP_958817
NP_001185752
NP_001185753
NP_001185754
NP_001185755
NP_031497
Локус (UCSC) Хр. 21: 25.88 – 26.17 Mb Хр. 16: 84.75 – 84.97 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

APP (англ. Amyloid beta precursor protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 770 амінокислот, а молекулярна маса — 86 943[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLPGLALLLLAAWTARALEVPTDGNAGLLAEPQIAMFCGRLNMHMNVQNG
KWDSDPSGTKTCIDTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKR
GRKQCKTHPHFVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHW
HTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSAD
AEEDDSDVWWGGADTDYADGSEDKVVEVAEEEEVAEVEEEEADDDEDDED
GDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVREVCSEQAETGPC
RAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVCGSAMSQSLL
KTTQEPLARDPVKLPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEA
KHRERMSQVMREWEEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANER
QQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRA
EQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYERMNQSLSLLYN
VPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTET
KTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARPAADRGL
TTRPGSGLTNIKTEEISEVKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKG
AIIGLMVGGVVIATVIVITLVMLKKKQYTSIHHGVVEVDAAVTPEERHLS
KMQQNGYENPTYKFFEQMQN

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинна адгезія, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном міді, іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, з молекулою гепарину. Локалізований у мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани.

Література

  • Yoshikai S., Sasaki H., Doh-ura K., Furuya H., Sakaki Y. (1990). Genomic organization of the human amyloid beta-protein precursor gene. Gene. 87: 257—263. PMID 2110105 DOI:10.1016/0378-1119(90)90310-N
  • Yoshikai S., Sasaki H., Doh-ura K., Furuya H., Sakaki Y. (1991). Gene. 102: 291—292. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 1908403 DOI:10.1016/0378-1119(91)90093-Q
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Schon E.A., Mita S., Sadlock J., Herbert J. (1988). A cDNA specifying the human amyloid beta precursor protein (ABPP) encodes a 95-kDa polypeptide. Nucleic Acids Res. 16: 9351—9351. PMID 3140222 DOI:10.1093/nar/16.19.9351
  • La Fauci G., Lahiri D.K., Salton S.R., Robakis N.K. (1989). Characterization of the 5'-end region and the first two exons of the beta-protein precursor gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 159: 297—304. PMID 2538123 DOI:10.1016/0006-291X(89)92437-6
  • Kitaguchi N., Takahashi Y., Tokushima Y., Shiojiri S., Ito H. (1988). Novel precursor of Alzheimer's disease amyloid protein shows protease inhibitory activity. Nature. 331: 530—532. PMID 2893291 DOI:10.1038/331530a0

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з APP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з APP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:620 (англ.) . Архів оригіналу за 4 грудня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
  6. ↑ UniProt, P05067 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 21
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»