ARHGEF11

ARHGEF11
Наявні структури
PDBПошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1HTJ, 1XCG, 2DLS, 3KZ1, 3T06, 5E6P

Ідентифікатори
Символи ARHGEF11, GTRAP48, PDZ-RHOGEF, Rho guanine nucleotide exchange factor 11
Зовнішні ІД OMIM: 605708 MGI: 2441869 HomoloGene: 11409 GeneCards: ARHGEF11
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
guanyl-nucleotide exchange factor activity
G protein-coupled receptor binding

Клітинна компонента

цитоплазма
гіалоплазма
мембрана

Біологічний процес

G protein-coupled receptor signaling pathway
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
regulation of cell growth
Rho protein signal transduction
establishment of cell polarity
positive regulation of apoptotic process
regulation of Rho protein signal transduction
regulation of small GTPase mediated signal transduction
striated muscle contraction
actin cytoskeleton organization
GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9826
213498
Ensembl
ENSG00000132694
ENSMUSG00000041977
UniProt
O15085
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_014784
NM_198236
NM_001377418
NM_001377419
NM_001003912
NM_001360195
NM_001360197
RefSeq (білок)
NP_055599
NP_937879
NP_001364347
NP_001364348
н/д
Локус (UCSC) Хр. 1: 156.93 – 157.05 Mb Хр. 3: 87.52 – 87.65 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ARHGEF11 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 522 амінокислот, а молекулярна маса — 167 704[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSVRLPQSIDRLSSLSSLGDSAPERKSPSHHRQPSDASETTGLVQRCVII
QKDQHGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNGTMVTNS
SHLEVVKLIKSGAYVALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPS
PPPPPPLPPPQRITGPKPLQDPEVQKHATQILRNMLRQEEKELQDILPLY
GDTSQRPSEGRLSLDSQEGDSGLDSGTERFPSLSESLMNRNSVLSDPGLD
SPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPKPLIIGPEEDYDP
GYFNNESDIIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQ
QASPKDSRSLGKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRNSEDARGV
LCEAQEAAMPEIQEQIHDYRTKRTLGLGSLYGENDLLDLDGDPLRERQVA
EKQLAALGDILSKYEEDRSAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQ
SAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDALEDKKRNPILKYIGKPKSSSQST
FHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPGTQRLSTGSFPEDLLES
DSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATRLHQ
SASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDD
LGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHL
RTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLR
EEGPIIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKE
SRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGT
SEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASN
PLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQD
EKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSK
LGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPR
EPAQQGPTPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDP
EQEGSAEEEELGVLPCPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPGPLFMEGLADS
ALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDP
GSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQEDMGLCSLEHLPPRTRNSGIWES
PELDRNLAEDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPESGQSEPGPPEV
EGGTKATGNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEAPMSPPQPDSLPAGQTEPQPQL
QGGNDDPRRPSRSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELL
KSLGGESSGGTTPVGSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPC
PEDGSDAPLEDSTADAAASPGP

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Fukuhara S., Murga C., Zohar M., Igishi T., Gutkind J.S. (1999). A novel PDZ domain containing guanine nucleotide exchange factor links heterotrimeric G proteins to Rho. J. Biol. Chem. 274: 5868—5879. PMID 10026210 DOI:10.1074/jbc.274.9.5868
  • Driessens M.H.E., Olivo C., Nagata K., Inagaki M., Collard J.G. (2002). B plexins activate Rho through PDZ-RhoGEF. FEBS Lett. 529: 168—172. PMID 12372594 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03323-9
  • Perrot V., Vazquez-Prado J., Gutkind J.S. (2002). Plexin B regulates Rho through the guanine nucleotide exchange factors leukemia-associated Rho GEF (LARG) and PDZ-RhoGEF. J. Biol. Chem. 277: 43115—43120. PMID 12183458 DOI:10.1074/jbc.M206005200
  • Togashi H., Nagata K., Takagishi M., Saitoh N., Inagaki M. (2000). Functions of a rho-specific guanine nucleotide exchange factor in neurite retraction. Possible role of a proline-rich motif of KIAA0380 in localization. J. Biol. Chem. 275: 29570—29578. PMID 10900204 DOI:10.1074/jbc.M003726200
  • Lin M.Y., Lin Y.M., Kao T.C., Chuang H.H., Chen R.H. (2011). PDZ-RhoGEF ubiquitination by Cullin3-KLHL20 controls neurotrophin-induced neurite outgrowth. J. Cell Biol. 193: 985—994. PMID 21670212 DOI:10.1083/jcb.201103015

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14580 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, O15085 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.