BAZ2A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4LZ2, 4Q6F, 4QBM, 4QF2, 5AGQ

Ідентифікатори

Символи

BAZ2A, TIP5, WALp3, bromodomain adjacent to zinc finger domain 2A

Зовнішні ІД

OMIM: 605682 MGI: 2151152 HomoloGene: 8393 GeneCards: BAZ2A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001187 RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0031493 histone binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor binding • lysine-acetylated histone binding • RNA binding
Клітинна компонента	• rDNA heterochromatin • chromatin silencing complex • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма • nuclear speck
Біологічний процес	• ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Метилювання ДНК • rDNA heterochromatin assembly • histone deacetylation • RNA polymerase I preinitiation complex assembly • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11176


116848

Ensembl


ENSG00000076108


ENSMUSG00000040054

UniProt


Q9UIF9


Q91YE5

RefSeq (мРНК)


NM_001300905 NM_013449 NM_001351156


NM_054078

RefSeq (білок)


NP_001287834 NP_038477 NP_001338085


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 12: 56.6 – 56.64 Mb

Хр. 10: 127.93 – 127.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BAZ2A (англ. Bromodomain adjacent to zinc finger domain 2A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 905 амінокислот, а молекулярна маса — 211 198^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEMEANDHFN	FTGLPPAPAA	SGLKPSPSSG	EGLYTNGSPM	NFPQQGKSLN
GDVNVNGLST	VSHTTTSGIL	NSAPHSSSTS	HLHHPSVAYD	CLWNYSQYPS
ANPGSNLKDP	PLLSQFSGGQ	YPLNGILGGS	RQPSSPSHNT	NLRAGSQEFW
ANGTQSPMGL	NFDSQELYDS	FPDQNFEVMP	NGPPSFFTSP	QTSPMLGSSI
QTFAPSQEVG	SGIHPDEAAE	KEMTSVVAEN	GTGLVGSLEL	EEEQPELKMC
GYNGSVPSVE	SLHQEVSVLV	PDPTVSCLDD	PSHLPDQLED	TPILSEDSLE
PFNSLAPEPV	SGGLYGIDDT	ELMGAEDKLP	LEDSPVISAL	DCPSLNNATA
FSLLADDSQT	STSIFASPTS	PPVLGESVLQ	DNSFDLNNGS	DAEQEEMETQ
SSDFPPSLTQ	PAPDQSSTIQ	LHPATSPAVS	PTTSPAVSLV	VSPAASPEIS
PEVCPAASTV	VSPAVFSVVS	PASSAVLPAV	SLEVPLTASV	TSPKASPVTS
PAAAFPTASP	ANKDVSSFLE	TTADVEEITG	EGLTASGSGD	VMRRRIATPE
EVRLPLQHGW	RREVRIKKGS	HRWQGETWYY	GPCGKRMKQF	PEVIKYLSRN
VVHSVRREHF	SFSPRMPVGD	FFEERDTPEG	LQWVQLSAEE	IPSRIQAITG
KRGRPRNTEK	AKTKEVPKVK	RGRGRPPKVK	ITELLNKTDN	RPLKKLEAQE
TLNEEDKAKI	AKSKKKMRQK	VQRGECQTTI	QGQARNKRKQ	ETKSLKQKEA
KKKSKAEKEK	GKTKQEKLKE	KVKREKKEKV	KMKEKEEVTK	AKPACKADKT
LATQRRLEER	QRQQMILEEM	KKPTEDMCLT	DHQPLPDFSR	VPGLTLPSGA
FSDCLTIVEF	LHSFGKVLGF	DPAKDVPSLG	VLQEGLLCQG	DSLGEVQDLL
VRLLKAALHD	PGFPSYCQSL	KILGEKVSEI	PLTRDNVSEI	LRCFLMAYGV
EPALCDRLRT	QPFQAQPPQQ	KAAVLAFLVH	ELNGSTLIIN	EIDKTLESMS
SYRKNKWIVE	GRLRRLKTVL	AKRTGRSEVE	MEGPEECLGR	RRSSRIMEET
SGMEEEEEEE	SIAAVPGRRG	RRDGEVDATA	SSIPELERQI	EKLSKRQLFF
RKKLLHSSQM	LRAVSLGQDR	YRRRYWVLPY	LAGIFVEGTE	GNLVPEEVIK
KETDSLKVAA	HASLNPALFS	MKMELAGSNT	TASSPARARG	RPRKTKPGSM
QPRHLKSPVR	GQDSEQPQAQ	LQPEAQLHAP	AQPQPQLQLQ	LQSHKGFLEQ
EGSPLSLGQS	QHDLSQSAFL	SWLSQTQSHS	SLLSSSVLTP	DSSPGKLDPA
PSQPPEEPEP	DEAESSPDPQ	ALWFNISAQM	PCNAAPTPPP	AVSEDQPTPS
PQQLASSKPM	NRPSAANPCS	PVQFSSTPLA	GLAPKRRAGD	PGEMPQSPTG
LGQPKRRGRP	PSKFFKQMEQ	RYLTQLTAQP	VPPEMCSGWW	WIRDPEMLDA
MLKALHPRGI	REKALHKHLN	KHRDFLQEVC	LRPSADPIFE	PRQLPAFQEG
IMSWSPKEKT	YETDLAVLQW	VEELEQRVIM	SDLQIRGWTC	PSPDSTREDL
AYCEHLSDSQ	EDITWRGRGR	EGLAPQRKTT	NPLDLAVMRL	AALEQNVERR
YLREPLWPTH	EVVLEKALLS	TPNGAPEGTT	TEISYEITPR	IRVWRQTLER
CRSAAQVCLC	LGQLERSIAW	EKSVNKVTCL	VCRKGDNDEF	LLLCDGCDRG
CHIYCHRPKM	EAVPEGDWFC	TVCLAQQVEG	EFTQKPGFPK	RGQKRKSGYS
LNFSEGDGRR	RRVLLRGRES	PAAGPRYSEE	GLSPSKRRRL	SMRNHHSDLT
FCEIILMEME	SHDAAWPFLE	PVNPRLVSGY	RRIIKNPMDF	STMRERLLRG
GYTSSEEFAA	DALLVFDNCQ	TFNEDDSEVG	KAGHIMRRFF	ESRWEEFYQG
KQANL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Jones M.H., Hamana N., Nezu J., Shimane M. (2000). A novel family of bromodomain genes. Genomics. 63: 40—45. PMID 10662543 DOI:10.1006/geno.1999.6071
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:962 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UIF9 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.