CABIN1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CABIN1, CAIN, PPP3IN, KB-318B8.7, calcineurin binding protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604251 MGI: 1298375 HomoloGene: 49307 GeneCards: CABIN1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein phosphatase inhibitor activity • nucleosome binding |
---|
Клітинна компонента | • aggresome • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • cell surface receptor signaling pathway • negative regulation of phosphoprotein phosphatase activity • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000099991 ENSG00000281670 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001199281 NM_001201429 NM_012295 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001186210 NP_001188358 NP_036427 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 24.01 – 24.18 Mb | Хр. 10: 75.48 – 75.6 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CABIN1 (англ. Calcineurin binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 220 амінокислот, а молекулярна маса — 246 352[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MIRIAALNAS | | STIEDDHEGS | | FKSHKTQTKE | | AQEAEAFALY | | HKALDLQKHD |
RFEESAKAYH | | ELLEASLLRE | | AVSSGDEKEG | | LKHPGLILKY | | STYKNLAQLA |
AQREDLETAM | | EFYLEAVMLD | | STDVNLWYKI | | GHVALRLIRI | | PLARHAFEEG |
LRCNPDHWPC | | LDNLITVLYT | | LSDYTTCLYF | | ICKALEKDCR | | YSKGLVLKEK |
IFEEQPCLRK | | DSLRMFLKCD | | MSIHDVSVSA | | AETQAIVDEA | | LGLRKKRQAL |
IVREKEPDLK | | LVQPIPFFTW | | KCLGESLLAM | | YNHLTTCEPP | | RPSLGKRIDL |
SDYQDPSQPL | | ESSMVVTPVN | | VIQPSTVSTN | | PAVAVAEPVV | | SYTSVATTSF |
PLHSPGLLET | | GAPVGDISGG | | DKSKKGVKRK | | KISEESGETA | | KRRSARVRNT |
KCKKEEKVDF | | QELLMKFLPS | | RLRKLDPEEE | | DDSFNNYEVQ | | SEAKLESFPS |
IGPQRLSFDS | | ATFMESEKQD | | VHEFLLENLT | | NGGILELMMR | | YLKAMGHKFL |
VRWPPGLAEV | | VLSVYHSWRR | | HSTSLPNPLL | | RDCSNKHIKD | | MMLMSLSCME |
LQLDQWLLTK | | GRSSAVSPRN | | CPAGMVNGRF | | GPDFPGTHCL | | GDLLQLSFAS |
SQRDLFEDGW | | LEFVVRVYWL | | KARFLALQGD | | MEQALENYDI | | CTEMLQSSTA |
IQVEAGAERR | | DIVIRLPNLH | | NDSVVSLEEI | | DKNLKSLERC | | QSLEEIQRLY |
EAGDYKAVVH | | LLRPTLCTSG | | FDRAKHLEFM | | TSIPERPAQL | | LLLQDSLLRL |
KDYRQCFECS | | DVALNEAVQQ | | MVNSGEAAAK | | EEWVATVTQL | | LMGIEQALSA |
DSSGSILKVS | | SSTTGLVRLT | | NNLIQVIDCS | | MAVQEEAKEP | | HVSSVLPWII |
LHRIIWQEED | | TFHSLCHQQQ | | LQNPAEEGMS | | ETPMLPSSLM | | LLNTAHEYLG |
RRSWCCNSDG | | ALLRFYVRVL | | QKELAASTSE | | DTHPYKEELE | | TALEQCFYCL |
YSFPSKKSKA | | RYLEEHSAQQ | | VDLIWEDALF | | MFEYFKPKTL | | PEFDSYKTST |
VSADLANLLK | | RIATIVPRTE | | RPALSLDKVS | | AYIEGTSTEV | | PCLPEGADPS |
PPVVNELYYL | | LADYHFKNKE | | QSKAIKFYMH | | DICICPNRFD | | SWAGMALARA |
SRIQDKLNSN | | ELKSDGPIWK | | HATPVLNCFR | | RALEIDSSNL | | SLWIEYGTMS |
YALHSFASRQ | | LKQWRGELPP | | ELVQQMEGRR | | DSMLETAKHC | | FTSAARCEGD |
GDEEEWLIHY | | MLGKVAEKQQ | | QPPTVYLLHY | | RQAGHYLHEE | | AARYPKKIHY |
HNPPELAMEA | | LEVYFRLHAS | | ILKLLGKPDS | | GVGAEVLVNF | | MKEAAEGPFA |
RGEEKNTPKA | | SEKEKACLVD | | EDSHSSAGTL | | PGPGASLPSS | | SGPGLTSPPY |
TATPIDHDYV | | KCKKPHQQAT | | PDDRSQDSTA | | VALSDSSSTQ | | DFFNEPTSLL |
EGSRKSYTEK | | RLPILSSQAG | | ATGKDLQGAT | | EERGKNEESL | | ESTEGFRAAE |
QGVQKPAAET | | PASACIPGKP | | SASTPTLWDG | | KKRGDLPGEP | | VAFPQGLPAG |
AEEQRQFLTE | | QCIASFRLCL | | SRFPQHYKSL | | YRLAFLYTYS | | KTHRNLQWAR |
DVLLGSSIPW | | QQLQHMPAQG | | LFCERNKTNF | | FNGIWRIPVD | | EIDRPGSFAW |
HMNRSIVLLL | | KVLAQLRDHS | | TLLKVSSMLQ | | RTPDQGKKYL | | RDADRQVLAQ |
RAFILTVKVL | | EDTLSELAEG | | SERPGPKVCG | | LPGARMTTDV | | SHKASPEDGQ |
EGLPQPKKPP | | LADGSGPGPE | | PGGKVGLLNH | | RPVAMDAGDS | | ADQSGERKDK |
ESPRAGPTEP | | MDTSEATVCH | | SDLERTPPLL | | PGRPARDRGP | | ESRPTELSLE |
ELSISARQQP | | TPLTPAQPAP | | APAPATTTGT | | RAGGHPEEPL | | SRLSRKRKLL |
EDTESGKTLL | | LDAYRVWQQG | | QKGVAYDLGR | | VERIMSETYM | | LIKQVDEEAA |
LEQAVKFCQV | | HLGAAAQRQA | | SGDTPTTPKH | | PKDSRENFFP | | VTVVPTAPDP |
VPADSVQRPS | | DAHTKPRPAL | | AAATTIITCP | | PSASASTLDQ | | SKDPGPPRPH |
RPEATPSMAS | | LGPEGEELAR | | VAEGTSFPPQ | | EPRHSPQVKM | | APTSSPAEPH |
CWPAEAALGT | | GAEPTCSQEG | | KLRPEPRRDG | | EAQEAASETQ | | PLSSPPTAAS |
SKAPSSGSAQ | | PPEGHPGKPE | | PSRAKSRPLP | | NMPKLVIPSA | | ATKFPPEITV |
TPPTPTLLSP | | KGSISEETKQ | | KLKSAILSAQ | | SAANVRKESL | | CQPALEVLET |
SSQESSLESE | | TDEDDDYMDI |
Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tagami H., Ray-Gallet D., Almouzni G., Nakatani Y. (2004). Histone H3.1 and H3.3 complexes mediate nucleosome assembly pathways dependent or independent of DNA synthesis. Cell. 116: 51—61. PMID 14718166 DOI:10.1016/S0092-8674(03)01064-X
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24187 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y6J0 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |