CAPN2

CAPN2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1KFU, 1KFX, 2NQA

Ідентифікатори
Символи CAPN2, CANP2, CANPL2, CANPml, mCANP, calpain 2
Зовнішні ІД OMIM: 114230 MGI: 88264 HomoloGene: 1326 GeneCards: CAPN2
Онтологія гена
Молекулярна функція

• calcium ion binding
• cysteine-type peptidase activity
• зв'язування з іоном металу
• cytoskeletal protein binding
• GO:0070122 peptidase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• protein heterodimerization activity
• hydrolase activity
• calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity
• enzyme binding

Клітинна компонента

• комплекс Ґольджі
• Псевдоподія
• мембрана
• focal adhesion
• perinuclear endoplasmic reticulum
• внутрішньоклітинний
• дендрит (нейробіологія)
• ендоплазматичний ретикулум
• cortical actin cytoskeleton
• membrane raft
• Хроматин
• лізосома
• екзосома
• клітинне ядро
• гіалоплазма
• цитоплазма
• клітинна мембрана
• мітохондріальний міжмембранний простір
• external side of plasma membrane
• cell projection
• neuronal cell body

Біологічний процес

• response to hypoxia
• protein autoprocessing
• протеоліз
• cellular response to amino acid stimulus
• myoblast fusion
• proteolysis involved in cellular protein catabolic process
• regulation of cytoskeleton organization
• blastocyst development
• extracellular matrix disassembly
• жіноча вагітність
• positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process
• regulation of interleukin-6 production
• cellular response to interferon-beta
• response to hydrogen peroxide
• behavioral response to pain
• cellular response to lipopolysaccharide
• positive regulation of neuron death
• positive regulation of myoblast fusion
• positive regulation of phosphatidylcholine biosynthetic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
824
12334
Ensembl
ENSG00000162909
ENSMUSG00000026509
UniProt
P17655
O08529
RefSeq (мРНК)
NM_001146068
NM_001748
NM_009794
RefSeq (білок)
NP_001139540
NP_001739
NP_033924
Локус (UCSC) Хр. 1: 223.7 – 223.78 Mb Хр. 1: 182.29 – 182.35 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CAPN2 (англ. Calpain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 700 амінокислот, а молекулярна маса — 79 995[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHDRAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPS
FPAIPSALGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQG
ALGDCWLLAAIASLTLNEEILARVVPLNQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWV
EVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGAT
TEGFEDFTGGIAEWYELKKPPPNLFKIIQKALQKGSLLGCSIDITSAADS
EAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGRWNDN
CPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLTS
DTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEED
GESGCTFLVGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSK
NFFLTNRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIR
VFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDISEDDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISA
FELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSDGSGKLGLKEFYIL
WTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIVARF
ADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

  • Ye Z., Connor J.R. (2000). cDNA cloning by amplification of circularized first strand cDNAs reveals non-IRE-regulated iron-responsive mRNAs. Biochem. Biophys. Res. Commun. 275: 223—227. PMID 10944468 DOI:10.1006/bbrc.2000.3282
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Sanchez-Sanchez F., Martinez-Redondo F., Aroca-Aguilar J.D., Coca-Prados M., Escribano J. (2007). Characterization of the intracellular proteolytic cleavage of myocilin and identification of calpain II as a myocilin-processing protease. J. Biol. Chem. 282: 27810—27824. PMID 17650508 DOI:10.1074/jbc.M609608200
  • Hata A., Ohno S., Akita Y., Suzuki K. (1989). Tandemly reiterated negative enhancer-like elements regulate transcription of a human gene for the large subunit of calcium-dependent protease. J. Biol. Chem. 264: 6404—6411. PMID 2539381

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1479 (англ.) . Архів оригіналу за 23 квітня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, P17655 (англ.) . Архів оригіналу за 14 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.