CASZ1

Ідентифікатори

Символи

CASZ1, CAS11, CST, SRG, ZNF693, dJ734G22.1, castor zinc finger 1

Зовнішні ІД

OMIM: 609895 MGI: 1196251 HomoloGene: 9824 GeneCards: CASZ1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • DNA binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of neuron differentiation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54897


69743

Ensembl


ENSG00000130940


ENSMUSG00000028977

UniProt


Q86V15


Q9CWL2

RefSeq (мРНК)


NM_001039183 NM_001079843 NM_017766


NM_001159344 NM_027195

RefSeq (білок)


NP_001073312 NP_060236


NP_001152816 NP_081471

Локус (UCSC)

Хр. 1: 10.64 – 10.8 Mb

Хр. 4: 148.89 – 149.04 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CASZ1 (англ. Castor zinc finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 759 амінокислот, а молекулярна маса — 190 069^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDLGTAEGTR	CTDPPAGKPA	MAPKRKGGLK	LNAICAKLSR	QVVVEKRADA
GSHTEGSPSQ	PRDQERSGPE	SGAARAPRSE	EDKRRAVIEK	WVNGEYSEEP
APTPVLGRIA	REGLELPPEG	VYMVQPQGCS	DEEDHAEEPS	KDGGALEEKD
SDGAASKEDS	GPSTRQASGE	ASSLRDYAAS	TMTEFLGMFG	YDDQNTRDEL
ARKISFEKLH	AGSTPEAATS	SMLPTSEDTL	SKRARFSKYE	EYIRKLKAGE
QLSWPAPSTK	TEERVGKEVV	GTLPGLRLPS	STAHLETKAT	ILPLPSHSSV
QMQNLVARAS	KYDFFIQKLK	TGENLRPQNG	STYKKPSKYD	LENVKYLHLF
KPGEGSPDMG	GAIAFKTGKV	GRPSKYDVRG	IQKPGPAKVP	PTPSLAPAPL
ASVPSAPSAP	GPGPEPPASL	SFNTPEYLKS	TFSKTDSITT	GTVSTVKNGL
PTDKPAVTED	VNIYQKYIAR	FSGSQHCGHI	HCAYQYREHY	HCLDPECNYQ
RFTSKQDVIR	HYNMHKKRDN	SLQHGFMRFS	PLDDCSVYYH	GCHLNGKSTH
YHCMQVGCNK	VYTSTSDVMT	HENFHKKNTQ	LINDGFQRFR	ATEDCGTADC
QFYGQKTTHF	HCRRPGCTFT	FKNKCDIEKH	KSYHIKDDAY	AKDGFKKFYK
YEECKYEGCV	YSKATNHFHC	IRAGCGFTFT	STSQMTSHKR	KHERRHIRSS
GALGLPPSLL	GAKDTEHEES	SNDDLVDFSA	LSSKNSSLSA	SPTSQQSSAS
LAAATAATEA	GPSATKPPNS	KISGLLPQGL	PGSIPLALAL	SNSGLPTPTP
YFPILAGRGS	TSLPVGTPSL	LGAVSSGSAA	SATPDTPTLV	ASGAGDSAPV
AAASVPAPPA	SIMERISASK	GLISPMMARL	AAAALKPSAT	FDPGSGQQVT
PARFPPAQVK	PEPGESTGAP	GPHEASQDRS	LDLTVKEPSN	ESNGHAVPAN
SSLLSSLMNK	MSQGNPGLGS	LLNIKAEAEG	SPAAEPSPFL	GKAVKALVQE
KLAEPWKVYL	RRFGTKDFCD	GQCDFLHKAH	FHCVVEECGA	LFSTLDGAIK
HANFHFRTEG	GAAKGNTEAA	FPASAAETKP	PMAPSSPPVP	PVTTATVSSL
EGPAPSPASV	PSTPTLLAWK	QLASTIPQMP	QIPASVPHLP	ASPLATTSLE
NAKPQVKPGF	LQFQENDPCL	ATDCKYANKF	HFHCLFGNCK	YVCKTSGKAE
SHCLDHINPN	NNLVNVRDQF	AYYSLQCLCP	NQHCEFRMRG	HYHCLRTGCY
FVTNITTKLP	WHIKKHEKAE	RRAANGFKYF	TKREECGRLG	CKYNQVNSHF
HCIREGCQFS	FLLKHQMTSH	ARKHMRRMLG	KNFDRVPPSQ	GPPGLMDAET
DECMDYTGCS	PGAMSSESST	MDRSCSSTPV	GNESTAAGNT	ISMPTASGAK
KRFWIIEDMS	PFGKRRKTAS	SRKMLDEGMM	LEGFRRFDLY	EDCKDAACQF
SLKVTHYHCT	RENCGYKFCG	RTHMYKHAQH	HDRVDNLVLD	DFKRFKASLS
CHFADCPFSG	TSTHFHCLRC	RFRCTDSTKV	TAHRKHHGKQ	DVISAAGFCQ
FSSSADCAVP	DCKYKLKCSH	FHCTFPGCRH	TVVGMSQMDS	HKRKHEKQER
GEPAAEGPAP	GPPISLDGSL	SLGAEPGSLL	FLQSAAAGLG	LALGDAGDPG
PPDAAAPGPR	EGAAAAAAAA	GESSQEDEEE	ELELPEEEAE	DDEDEDDDED
DDDEDDDEDD	DDEDLRTDSE	ESLPEAAAEA	AGAGARTPAL	AALAALGAPG
PAPTAASSP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Liu Z., Yang X., Tan F., Cullion K., Thiele C.J. (2006). Molecular cloning and characterization of human Castor, a novel human gene upregulated during cell differentiation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 344: 834—844. PMID 16631614 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.03.207
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26002 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q86V15 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.