CLDN15 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CLDN15

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4P79

Ідентифікатори

Символи

CLDN15, claudin 15

Зовнішні ІД

OMIM: 615778 MGI: 1913103 HomoloGene: 8646 GeneCards: CLDN15

Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural molecule activity • identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • lateral plasma membrane • мембрана • bicellular tight junction
Біологічний процес	• calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules • ion transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


24146


60363

Ensembl


ENSG00000106404


ENSMUSG00000001739

UniProt


P56746


Q9Z0S5

RefSeq (мРНК)


NM_138429 NM_001185080 NM_014343


NM_021719

RefSeq (білок)


NP_001172009 NP_055158


NP_068365

Локус (UCSC)

Хр. 7: 101.23 – 101.24 Mb

Хр. 5: 137 – 137 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLDN15 (англ. Claudin 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 228 амінокислот, а молекулярна маса — 24 356^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSMAVETFGF	FMATVGLLML	GVTLPNSYWR	VSTVHGNVIT	TNTIFENLWF
SCATDSLGVY	NCWEFPSMLA	LSGYIQACRA	LMITAILLGF	LGLLLGIAGL
RCTNIGGLEL	SRKAKLAATA	GALHILAGIC	GMVAISWYAF	NITRDFFDPL
YPGTKYELGP	ALYLGWSASL	ISILGGLCLC	SACCCGSDED	PAASARRPYQ
APVSVMPVAT	SDQEGDSSFG	KYGRNAYV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

Colegio O.R., Van Itallie C.M., McCrea H.J., Rahner C., Anderson J.M. (2002). Claudins create charge-selective channels in the paracellular pathway between epithelial cells. Am. J. Physiol. 283: C142—C147. PMID 12055082 DOI:10.1152/ajpcell.00038.2002
Van Itallie C.M., Fanning A.S., Anderson J.M. (2003). Reversal of charge selectivity in cation or anion-selective epithelial lines by expression of different claudins. Am. J. Physiol. 285: F1078—F1084. PMID 13129853 DOI:10.1152/ajprenal.00116.2003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2036 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P56746 (англ.) . Архів оригіналу за 21 січня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.