CLSTN1

Ідентифікатори

Символи

CLSTN1, ALC-ALPHA, CDHR12, CSTN1, PIK3CD, XB31alpha, alcalpha1, alcalpha2, CST-1, calsyntenin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 611321 MGI: 1929895 HomoloGene: 8814 GeneCards: CLSTN1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• X11-like protein binding • calcium ion binding • amyloid-beta binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinesin binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • postsynaptic membrane • комплекс Ґольджі • cell projection • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • синапс • extracellular region • cell surface • міжклітинні контакти • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • postsynaptic endosome • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic density membrane • integral component of spine apparatus membrane
Біологічний процес	• адгезія клітин • positive regulation of synaptic transmission • regulation of cell growth • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • positive regulation of synapse assembly • regulation of synapse maturation • neurotransmitter receptor transport to postsynaptic membrane • vesicle-mediated transport in synapse
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22883


65945

Ensembl


ENSG00000171603


ENSMUSG00000039953

UniProt


O94985


Q9EPL2

RefSeq (мРНК)


NM_014944 NM_001009566 NM_001302883


NM_001290989 NM_023051

RefSeq (білок)


NP_001009566 NP_001289812 NP_055759


NP_001277918 NP_075538

Локус (UCSC)

Хр. 1: 9.73 – 9.82 Mb

Хр. 4: 149.67 – 149.73 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLSTN1 (англ. Calsyntenin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 981 амінокислот, а молекулярна маса — 109 793^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLRRPAPALA	PAARLLLAGL	LCGGGVWAAR	VNKHKPWLEP	TYHGIVTEND
NTVLLDPPLI	ALDKDAPLRF	AESFEVTVTK	EGEICGFKIH	GQNVPFDAVV
VDKSTGEGVI	RSKEKLDCEL	QKDYSFTIQA	YDCGKGPDGT	NVKKSHKATV
HIQVNDVNEY	APVFKEKSYK	ATVIEGKQYD	SILRVEAVDA	DCSPQFSQIC
SYEIITPDVP	FTVDKDGYIK	NTEKLNYGKE	HQYKLTVTAY	DCGKKRATED
VLVKISIKPT	CTPGWQGWNN	RIEYEPGTGA	LAVFPNIHLE	TCDEPVASVQ
ATVELETSHI	GKGCDRDTYS	EKSLHRLCGA	AAGTAELLPS	PSGSLNWTMG
LPTDNGHDSD	QVFEFNGTQA	VRIPDGVVSV	SPKEPFTISV	WMRHGPFGRK
KETILCSSDK	TDMNRHHYSL	YVHGCRLIFL	FRQDPSEEKK	YRPAEFHWKL
NQVCDEEWHH	YVLNVEFPSV	TLYVDGTSHE	PFSVTEDYPL	HPSKIETQLV
VGACWQEFSG	VENDNETEPV	TVASAGGDLH	MTQFFRGNLA	GLTLRSGKLA
DKKVIDCLYT	CKEGLDLQVL	EDSGRGVQIQ	AHPSQLVLTL	EGEDLGELDK
AMQHISYLNS	RQFPTPGIRR	LKITSTIKCF	NEATCISVPP	VDGYVMVLQP
EEPKISLSGV	HHFARAASEF	ESSEGVFLFP	ELRIISTITR	EVEPEGDGAE
DPTVQESLVS	EEIVHDLDTC	EVTVEGEELN	HEQESLEVDM	ARLQQKGIEV
SSSELGMTFT	GVDTMASYEE	VLHLLRYRNW	HARSLLDRKF	KLICSELNGR
YISNEFKVEV	NVIHTANPME	HANHMAAQPQ	FVHPEHRSFV	DLSGHNLANP
HPFAVVPSTA	TVVIVVCVSF	LVFMIILGVF	RIRAAHRRTM	RDQDTGKENE
MDWDDSALTI	TVNPMETYED	QHSSEEEEEE	EEEEESEDGE	EEDDITSAES
ESSEEEEGEQ	GDPQNATRQQ	QLEWDDSTLS	Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, апараті гольджі, синапсах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17447 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O94985 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.