CNOT10

Ідентифікатори

Символи

CNOT10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10

Зовнішні ІД

MGI: 1926143 HomoloGene: 41040 GeneCards: CNOT10

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • CCR4-NOT complex • гіалоплазма • мембрана • клітинне ядро
Біологічний процес	• nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • Сайленсинг генів • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of translation • transcription, DNA-templated • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • mRNA catabolic process • negative regulation of translation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


25904


78893

Ensembl


ENSG00000182973


ENSMUSG00000056167

UniProt


Q9H9A5


Q8BH15

RefSeq (мРНК)

NM_001256741 NM_001256742 NM_015442 NM_001393366 NM_001393367
NM_001393368 NM_001393369


NM_153585

RefSeq (білок)


NP_001243670 NP_001243671 NP_056257


NP_705813

Локус (UCSC)

Хр. 3: 32.69 – 32.77 Mb

Хр. 9: 114.59 – 114.64 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CNOT10 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 744 амінокислот, а молекулярна маса — 82 310^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAADKPADQG	AEKHEGTGQS	SGITDQEKEL	STNAFQAFTS	GNYDACLQHL
ACLQDINKDD	YKIILNTAVA	EFFKSNQTTT	DNLRQTLNQL	KNQVHSAVEE
MDGLDDVENS	MLYYNQAVIL	YHLRQYTEAI	SVGEKLYQFI	EPFEEKFAQA
VCFLLVDLYI	LTYQAEKALH	LLAVLEKMIS	QGNNNKNGKN	ETGNNNNKDG
SNHKAESGAL	IEAAKSKIHQ	YKVRAYIQMK	SLKACKREIK	SVMNTAGNSA
PSLFLKSNFE	YLRGNYRKAV	KLLNSSNIAE	HPGFMKTGEC	LRCMFWNNLG
CIHFAMSKHN	LGIFYFKKAL	QENDNVCAQL	SAGSTDPGKK	FSGRPMCTLL
TNKRYELLYN	CGIQLLHIGR	PLAAFECLIE	AVQVYHANPR	LWLRLAECCI
AANKGTSEQE	TKGLPSKKGI	VQSIVGQGYH	RKIVLASQSI	QNTVYNDGQS
SAIPVASMEF	AAICLRNALL	LLPEEQQDPK	QENGAKNSNQ	LGGNTESSES
SETCSSKSHD	GDKFIPAPPS	SPLRKQELEN	LKCSILACSA	YVALALGDNL
MALNHADKLL	QQPKLSGSLK	FLGHLYAAEA	LISLDRISDA	ITHLNPENVT
DVSLGISSNE	QDQGSDKGEN	EAMESSGKRA	PQCYPSSVNS	ARTVMLFNLG
SAYCLRSEYD	KARKCLHQAA	SMIHPKEVPP	EAILLAVYLE	LQNGNTQLAL
QIIKRNQLLP	AVKTHSEVRK	KPVFQPVHPI	QPIQMPAFTT	VQRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mauxion F., Preve B., Seraphin B. (2013). C2ORF29/CNOT11 and CNOT10 form a new module of the CCR4-NOT complex. RNA Biol. 10: 267—276. PMID 23232451 DOI:10.4161/rna.23065
Farber V., Erben E., Sharma S., Stoecklin G., Clayton C. (2013). Trypanosome CNOT10 is essential for the integrity of the NOT deadenylase complex and for degradation of many mRNAs. Nucleic Acids Res. 41: 1211—1222. PMID 23221646 DOI:10.1093/nar/gks1133
Bawankar P., Loh B., Wohlbold L., Schmidt S., Izaurralde E. (2013). NOT10 and C2orf29/NOT11 form a conserved module of the CCR4-NOT complex that docks onto the NOT1 N-terminal domain. RNA Biol. 10: 228—244. PMID 23303381 DOI:10.4161/rna.23018

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23817 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H9A5 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.