CTBP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2OME, 4LCJ

Ідентифікатори

Символи

CTBP2, C-terminal binding protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 602619 MGI: 1201686 HomoloGene: 75187 GeneCards: CTBP2

Пов'язані генетичні захворювання

рак простати^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0050229 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor • NAD binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • oxidoreductase activity • hydroxypyruvate reductase activity • protein kinase binding • glyoxylate reductase (NADP+) activity • protein homodimerization activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • chromatin binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • retinoic acid receptor binding • structural constituent of presynaptic active zone
Клітинна компонента	• синапс • міжклітинні контакти • клітинне ядро • гіалоплазма • transcription repressor complex • ribbon synapse • presynaptic active zone cytoplasmic component • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • presynaptic cytosol • photoreceptor ribbon synapse
Біологічний процес	• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • viral genome replication • transcription, DNA-templated • обмін речовин • GO:0022415 viral process • negative regulation of cell population proliferation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of retinoic acid receptor signaling pathway • white fat cell differentiation • positive regulation of chromatin binding • cellular response to leukemia inhibitory factor • synaptic vesicle docking • maintenance of presynaptic active zone structure
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1488


13017

Ensembl


ENSG00000175029


ENSMUSG00000030970

UniProt


P56545


P56546

RefSeq (мРНК)

NM_001083914 NM_001290214 NM_001290215 NM_001329 NM_022802
NM_001321012 NM_001321013 NM_001321014 NM_001363508


NM_001170744 NM_009980 NM_001347623

RefSeq (білок)

NP_001077383 NP_001277143 NP_001277144 NP_001307941 NP_001307942
NP_001307943 NP_001320 NP_073713 NP_001350437


NP_001164215 NP_001334552 NP_034110

Локус (UCSC)

Хр. 10: 124.98 – 125.16 Mb

Хр. 7: 132.99 – 133.12 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CTBP2 (англ. C-terminal binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 445 амінокислот, а молекулярна маса — 48 945^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALVDKHKVK	RQRLDRICEG	IRPQIMNGPL	HPRPLVALLD	GRDCTVEMPI
LKDLATVAFC	DAQSTQEIHE	KVLNEAVGAM	MYHTITLTRE	DLEKFKALRV
IVRIGSGYDN	VDIKAAGELG	IAVCNIPSAA	VEETADSTIC	HILNLYRRNT
WLYQALREGT	RVQSVEQIRE	VASGAARIRG	ETLGLIGFGR	TGQAVAVRAK
AFGFSVIFYD	PYLQDGIERS	LGVQRVYTLQ	DLLYQSDCVS	LHCNLNEHNH
HLINDFTIKQ	MRQGAFLVNA	ARGGLVDEKA	LAQALKEGRI	RGAALDVHES
EPFSFAQGPL	KDAPNLICTP	HTAWYSEQAS	LEMREAAATE	IRRAITGRIP
ESLRNCVNKE	FFVTSAPWSV	IDQQAIHPEL	NGATYRYPPG	IVGVAPGGLP
AAMEGIIPGG	IPVTHNLPTV	AHPSQAPSPN	QPTKHGDNRE	HPNEQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у ядрі, клітинних контактах, синапсах.

Література

Katsanis N., Fisher E.M.C. (1998). A novel C-terminal binding protein (CTBP2) is closely related to CTBP1, an adenovirus E1A-binding protein, and maps to human chromosome 21q21.3. Genomics. 47: 294—299. PMID 9479502 DOI:10.1006/geno.1997.5115
Schmitz F., Koenigstorfer A., Suedhof T.C. (2000). RIBEYE, a component of synaptic ribbons: a protein's journey through evolution provides insight into synaptic ribbon function. Neuron. 28: 857—872. PMID 11163272 DOI:10.1016/S0896-6273(00)00159-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ueda J., Tachibana M., Ikura T., Shinkai Y. (2006). Zinc finger protein Wiz links G9a/GLP histone methyltransferases to the co-repressor molecule CtBP. J. Biol. Chem. 281: 20120—20128. PMID 16702210 DOI:10.1074/jbc.M603087200
Subramanian T., Zhao L.J., Chinnadurai G. (2013). Interaction of CtBP with adenovirus E1A suppresses immortalization of primary epithelial cells and enhances virus replication during productive infection. Virology. 443: 313—320. PMID 23747199 DOI:10.1016/j.virol.2013.05.018

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CTBP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2495 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P56545 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.