CYP1B1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3PM0

Ідентифікатори

Символи

CYP1B1, CP1B, CYPIB1, GLC3A, P4501B1, cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1, ASGD6

Зовнішні ІД

OMIM: 601771 MGI: 88590 HomoloGene: 68035 GeneCards: CYP1B1

Пов'язані генетичні захворювання

anterior segment dysgenesis 6, juvenile glaucoma^[1]

Реагує на сполуку

chrysin^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• iron ion binding • oxygen binding • зв'язування з іоном металу • heme binding • GO:0050602 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen • oxidoreductase activity • aromatase activity • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen • monooxygenase activity
Клітинна компонента	• organelle membrane • endoplasmic reticulum membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія
Біологічний процес	• toxin metabolic process • steroid metabolic process • retina vasculature development in camera-type eye • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • epoxygenase P450 pathway • endothelial cell-cell adhesion • omega-hydroxylase P450 pathway • Ангіогенез • cellular aromatic compound metabolic process • sterol metabolic process • response to toxic substance • зір • blood vessel morphogenesis • trabecular meshwork development • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process • retinal metabolic process • endothelial cell migration • nitric oxide biosynthetic process • retinol metabolic process • адгезія клітин • negative regulation of cell population proliferation • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • negative regulation of cell adhesion mediated by integrin • xenobiotic metabolic process • cellular response to hydrogen peroxide • membrane lipid catabolic process • retinal blood vessel morphogenesis • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of vascular endothelial growth factor production • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to oxidative stress • arachidonic acid metabolic process • negative regulation of cell migration • estrogen metabolic process • collagen fibril organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1545


13078

Ensembl


ENSG00000138061


ENSMUSG00000024087

UniProt


Q16678


Q64429

RefSeq (мРНК)


NM_000104


NM_009994 NM_001364889

RefSeq (білок)


NP_000095


NP_034124 NP_001351818

Локус (UCSC)

Хр. 2: 38.07 – 38.11 Mb

Хр. 17: 80.01 – 80.02 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CYP1B1 (англ. Cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 543 амінокислот, а молекулярна маса — 60 846^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTSLSPNDP	WPLNPLSIQQ	TTLLLLLSVL	ATVHVGQRLL	RQRRRQLRSA
PPGPFAWPLI	GNAAAVGQAA	HLSFARLARR	YGDVFQIRLG	SCPIVVLNGE
RAIHQALVQQ	GSAFADRPAF	ASFRVVSGGR	SMAFGHYSEH	WKVQRRAAHS
MMRNFFTRQP	RSRQVLEGHV	LSEARELVAL	LVRGSADGAF	LDPRPLTVVA
VANVMSAVCF	GCRYSHDDPE	FRELLSHNEE	FGRTVGAGSL	VDVMPWLQYF
PNPVRTVFRE	FEQLNRNFSN	FILDKFLRHC	ESLRPGAAPR	DMMDAFILSA
EKKAAGDSHG	GGARLDLENV	PATITDIFGA	SQDTLSTALQ	WLLLLFTRYP
DVQTRVQAEL	DQVVGRDRLP	CMGDQPNLPY	VLAFLYEAMR	FSSFVPVTIP
HATTANTSVL	GYHIPKDTVV	FVNQWSVNHD	PLKWPNPENF	DPARFLDKDG
LINKDLTSRV	MIFSVGKRRC	IGEELSKMQL	FLFISILAHQ	CDFRANPNEP
AKMNFSYGLT	IKPKSFKVNV	TLRESMELLD	SAVQNLQAKE	TCQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом. Локалізований у мембрані, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Choudhary D., Jansson I., Stoilov I., Sarfarazi M., Schenkman J.B. (2004). Metabolism of retinoids and arachidonic acid by human and mouse cytochrome P450 1b1. Drug Metab. Dispos. 32: 840—847. PMID 15258110 DOI:10.1124/dmd.32.8.840
Nishida C.R., Everett S., Ortiz de Montellano P.R. (2013). Specificity determinants of CYP1B1 estradiol hydroxylation. Mol. Pharmacol. 84: 451—458. PMID 23821647 DOI:10.1124/mol.113.087700
Wang A., Savas U., Stout C.D., Johnson E.F. (2011). Structural characterization of the complex between alpha-naphthoflavone and human cytochrome P450 1B1. J. Biol. Chem. 286: 5736—5743. PMID 21147782 DOI:10.1074/jbc.M110.204420
Ohtake Y., Kubota R., Tanino T., Miyata H., Mashima Y. (2000). Novel compound heterozygous mutations in the cytochrome P4501B1 gene (CYP1B1) in a Japanese patient with primary congenital glaucoma. Ophthalmic Genet. 21: 191—193. PMID 11184479 DOI:10.1076/1381-6810(200009)2131-ZFT191
Chakrabarti S., Komatireddy S., Mandal A.K., Balasubramanian D. (2003). Gene symbol: CYP1B1. Disease: glaucoma, primary congenital. Hum. Genet. 113: 556—558. PMID 14640114 DOI:10.1007/s00439-003-1035-0

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CYP1B1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2597 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q16678 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.