DBNL

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1X67

Ідентифікатори

Символи

DBNL, ABP1, HIP-55, HIP55, SH3P7, Drebrin-like, drebrin like

Зовнішні ІД

OMIM: 610106 MGI: 700006 HomoloGene: 8468 GeneCards: DBNL

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0010577 enzyme activator activity • actin filament binding • actin binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• ендосома • комплекс Ґольджі • cell projection • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • синапс • внутрішньоклітинний • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • early endosome • clathrin-coated vesicle membrane • екзосома • цитоскелет • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • podosome • lamellipodium • цитоплазма • ruffle • cell cortex • гіалоплазма • extracellular region • secretory granule lumen • tertiary granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen
Біологічний процес	• ендоцитоз • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • synapse assembly • neuron projection morphogenesis • podosome assembly • Rac protein signal transduction • neutrophil degranulation • рецептор-опосередкований ендоцитоз • ruffle assembly • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


28988


13169

Ensembl


ENSG00000136279


ENSMUSG00000020476

UniProt


Q9UJU6


Q62418

RefSeq (мРНК)

NM_001014436 NM_001122956 NM_001284313 NM_001284315 NM_014063
NM_001362723


NM_001146308 NM_001146309 NM_013810

RefSeq (білок)

NP_001014436 NP_001116428 NP_001271242 NP_001271244 NP_054782
NP_001349652


NP_001139780 NP_001139781 NP_038838

Локус (UCSC)

Хр. 7: 44.04 – 44.07 Mb

Хр. 11: 5.74 – 5.75 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DBNL (англ. Drebrin like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 430 амінокислот, а молекулярна маса — 48 207^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAANLSRNGP	ALQEAYVRVV	TEKSPTDWAL	FTYEGNSNDI	RVAGTGEGGL
EEMVEELNSG	KVMYAFCRVK	DPNSGLPKFV	LINWTGEGVN	DVRKGACASH
VSTMASFLKG	AHVTINARAE	EDVEPECIME	KVAKASGANY	SFHKESGRFQ
DVGPQAPVGS	VYQKTNAVSE	IKRVGKDSFW	AKAEKEEENR	RLEEKRRAEE
AQRQLEQERR	ERELREAARR	EQRYQEQGGE	ASPQRTWEQQ	QEVVSRNRNE
QESAVHPREI	FKQKERAMST	TSISSPQPGK	LRSPFLQKQL	TQPETHFGRE
PAAAISRPRA	DLPAEEPAPS	TPPCLVQAEE	EAVYEEPPEQ	ETFYEQPPLV
QQQGAGSEHI	DHHIQGQGLS	GQGLCARALY	DYQAADDTEI	SFDPENLITG
IEVIDEGWWR	GYGPDGHFGM	FPANYVELIE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, транспорт, ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, синапсах, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Larbolette O., Wollscheid B., Schweikert J., Nielsen P.J., Wienands J. (1999). SH3P7 is a cytoskeleton adapter protein and is coupled to signal transduction from lymphocyte antigen receptors. Mol. Cell. Biol. 19: 1539—1546. PMID 9891087 DOI:10.1128/MCB.19.2.1539
Chen Y.-R., Kori R., John B., Tan T.-H. (2001). Caspase-mediated cleavage of actin-binding and SH3-domain-containing proteins cortactin, HS1, and HIP-55 during apoptosis. Biochem. Biophys. Res. Commun. 288: 981—989. PMID 11689006 DOI:10.1006/bbrc.2001.5862
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2696 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UJU6 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.