DCK

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1P5Z, 1P60, 1P61, 1P62, 2A2Z, 2A30, 2A7Q, 2NO0, 2NO1, 2NO6, 2NO7, 2NO9, 2NOA, 2QRN, 2QRO, 2ZI3, 2ZI4, 2ZI5, 2ZI6, 2ZI7, 2ZI9, 2ZIA, 3HP1, 3IPX, 3IPY, 3KFX, 3MJR, 3QEJ, 3QEN, 3QEO, 4JLJ, 4JLK, 4JLM, 4JLN, 4KCG, 4L5B, 4Q18, 4Q19, 4Q1A, 4Q1B, 4Q1C, 4Q1D, 4Q1E, 4Q1F

Ідентифікатори

Символи

DCK, entrez:1633, deoxycytidine kinase

Зовнішні ІД

OMIM: 125450 MGI: 102726 HomoloGene: 616 GeneCards: DCK

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • nucleoside kinase activity • deoxycytidine kinase activity • ATP binding • protein homodimerization activity • kinase activity • deoxynucleoside kinase activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес	• pyrimidine nucleoside salvage • pyrimidine nucleotide metabolic process • purine-containing compound salvage • nucleobase-containing compound metabolic process • фосфорилювання • deoxyribonucleoside monophosphate biosynthetic process • nucleotide biosynthetic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1633


13178

Ensembl


ENSG00000156136


ENSMUSG00000029366

UniProt


P27707


P43346

RefSeq (мРНК)


NM_000788


NM_007832

RefSeq (білок)


NP_000779


NP_031858

Локус (UCSC)

Хр. 4: 70.99 – 71.03 Mb

Хр. 5: 88.91 – 88.93 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DCK (англ. Deoxycytidine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 260 амінокислот, а молекулярна маса — 30 519^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATPPKRSCP	SFSASSEGTR	IKKISIEGNI	AAGKSTFVNI	LKQLCEDWEV
VPEPVARWCN	VQSTQDEFEE	LTMSQKNGGN	VLQMMYEKPE	RWSFTFQTYA
CLSRIRAQLA	SLNGKLKDAE	KPVLFFERSV	YSDRYIFASN	LYESECMNET
EWTIYQDWHD	WMNNQFGQSL	ELDGIIYLQA	TPETCLHRIY	LRGRNEEQGI
PLEYLEKLHY	KHESWLLHRT	LKTNFDYLQE	VPILTLDVNE	DFKDKYESLV
EKVKEFLSTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Eriksson S., Cederlund E., Bergman T., Joernvall H., Bohman C. (1991). Characterization of human deoxycytidine kinase. Correlation with cDNA sequences. FEBS Lett. 280: 363—366. PMID 2013338 DOI:10.1016/0014-5793(91)80332-W
Johansson M., Brismar S., Karlsson A. (1997). Human deoxycytidine kinase is located in the cell nucleus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 11941—11945. PMID 9342341 DOI:10.1073/pnas.94.22.11941
Sabini E., Ort S., Monnerjahn C., Konrad M., Lavie A. (2003). Structure of human dCK suggests strategies to improve anticancer and antiviral therapy. Nat. Struct. Biol. 10: 513—519. PMID 12808445 DOI:10.1038/nsb942
Zhang Y., Secrist J.A. III, Ealick S.E. (2006). The structure of human deoxycytidine kinase in complex with clofarabine reveals key interactions for prodrug activation. Acta Crystallogr. D. 62: 133—139. PMID 16421443 DOI:10.1107/S0907444905034293
Sabini E., Hazra S., Konrad M., Lavie A. (2007). Nonenantioselectivity property of human deoxycytidine kinase explained by structures of the enzyme in complex with L- and D-nucleosides. J. Med. Chem. 50: 3004—3014. PMID 17530837 DOI:10.1021/jm0700215

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2704 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P27707 (англ.) . Архів оригіналу за 27 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.