EEF1A1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1SYW, 3C5J | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EEF1A1, CCS-3, CCS3, EE1A1, EEF-1, EEF1A, EF-Tu, EF1A, GRAF-1EF, HNGC:16303, LENG7, PTI1, eEF1A-1, eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1, EF1A1, EF1alpha1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 130590 MGI: 1096881 HomoloGene: 100799 GeneCards: EEF1A1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • tRNA binding • GTP binding • translation elongation factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity • protein kinase binding • RNA binding • calmodulin binding • kinase binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • cytoplasmic side of lysosomal membrane • ruffle membrane • ядерце • cortical actin cytoskeleton • екзосома • клітинне ядро • eukaryotic translation elongation factor 1 complex • extracellular region • міжклітинний простір • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • клітинна мембрана • мембрана • myelin sheath |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • translational elongation • transcription, DNA-templated • cellular response to epidermal growth factor stimulus • regulation of chaperone-mediated autophagy • Біосинтез білків • Метилювання білків • neutrophil degranulation • regulation of D-erythro-sphingosine kinase activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 73.49 – 73.53 Mb | Хр. 9: 78.39 – 78.4 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EEF1A1 (англ. Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 462 амінокислот, а молекулярна маса — 50 141[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGKEKTHINI | | VVIGHVDSGK | | STTTGHLIYK | | CGGIDKRTIE | | KFEKEAAEMG |
KGSFKYAWVL | | DKLKAERERG | | ITIDISLWKF | | ETSKYYVTII | | DAPGHRDFIK |
NMITGTSQAD | | CAVLIVAAGV | | GEFEAGISKN | | GQTREHALLA | | YTLGVKQLIV |
GVNKMDSTEP | | PYSQKRYEEI | | VKEVSTYIKK | | IGYNPDTVAF | | VPISGWNGDN |
MLEPSANMPW | | FKGWKVTRKD | | GNASGTTLLE | | ALDCILPPTR | | PTDKPLRLPL |
QDVYKIGGIG | | TVPVGRVETG | | VLKPGMVVTF | | APVNVTTEVK | | SVEMHHEALS |
EALPGDNVGF | | NVKNVSVKDV | | RRGNVAGDSK | | NDPPMEAAGF | | TAQVIILNHP |
GQISAGYAPV | | LDCHTAHIAC | | KFAELKEKID | | RRSGKKLEDG | | PKFLKSGDAA |
IVDMVPGKPM | | CVESFSDYPP | | LGRFAVRDMR | | QTVAVGVIKA | | VDKKAAGAGK |
VTKSAQKAQK | | AK |
Кодований геном білок за функцією належить до факторів елонгації. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Brands J.H.G.M., Maassen J.A., van Hemert F.J., Amons R., Moeller W. (1986). The primary structure of the alpha subunit of human elongation factor 1. Structural aspects of guanine-nucleotide-binding sites. Eur. J. Biochem. 155: 167—171. PMID 3512269 DOI:10.1111/j.1432-1033.1986.tb09472.x
- Madsen H.O., Poulsen K., Dahl O., Clark B.F.C., Hjorth J.P. (1990). Retropseudogenes constitute the major part of the human elongation factor 1 alpha gene family. Nucleic Acids Res. 18: 1513—1516. PMID 2183196 DOI:10.1093/nar/18.6.1513
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rao T.R., Slobin L.I. (1986). Structure of the amino-terminal end of mammalian elongation factor Tu. Nucleic Acids Res. 14: 2409—2409. PMID 3960725 DOI:10.1093/nar/14.5.2409
- Maruyama T., Nara K., Yoshikawa H., Suzuki N. (2007). Txk, a member of the non-receptor tyrosine kinase of the Tec family, forms a complex with poly(ADP-ribose) polymerase 1 and elongation factor 1alpha and regulates interferon-gamma gene transcription in Th1 cells. Clin. Exp. Immunol. 147: 164—175. PMID 17177976 DOI:10.1111/j.1365-2249.2006.03249.x
- Chacko G., Ling Q., Hajjar K.A. (1998). Induction of acute translational response genes by homocysteine. Elongation factors-1alpha, -beta, and -delta. J. Biol. Chem. 273: 19840—19846. PMID 9677419 DOI:10.1074/jbc.273.31.19840
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3189 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P68104 (англ.) . Архів оригіналу за 21 грудня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Білки | Фактори ініціації трансляції | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори ініціації трансляції археїв | |
---|
Фактори ініціації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори елонгації трансляції | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори елонгації трансляції археїв | |
---|
Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
---|
Рибосомні білки | Цитоплазмові | підрозділ 60S | |
---|
підрозділ 40S | |
---|
|
---|
Мітохондріальні | підрозділ 39S | |
---|
підрозділ 28S | |
---|
|
---|
|
---|
|
---|
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |