EXOSC2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EXOSC2, RRP4, Rrp4p, hRrp4p, p7, Exosome component 2, SHRF |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602238 MGI: 2385133 HomoloGene: 6095 GeneCards: EXOSC2 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • 3'-5'-exoribonuclease activity • exoribonuclease activity • 7S RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • Екзосома • nuclear exosome (RNase complex) • cytoplasmic exosome (RNase complex) • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце |
---|
Біологічний процес | • nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process • nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process • regulation of mRNA stability • exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5' • CUT catabolic process • positive regulation of cell growth • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • rRNA processing • U4 snRNA 3'-end processing • polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001282708 NM_001282709 NM_014285 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001269637 NP_001269638 NP_055100 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 130.69 – 130.71 Mb | Хр. 2: 31.56 – 31.57 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EXOSC2 (англ. Exosome component 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 32 789[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAMEMRLPVA | | RKPLSERLGR | | DTKKHLVVPG | | DTITTDTGFM | | RGHGTYMGEE |
KLIASVAGSV | | ERVNKLICVK | | ALKTRYIGEV | | GDIVVGRITE | | VQQKRWKVET |
NSRLDSVLLL | | SSMNLPGGEL | | RRRSAEDELA | | MRGFLQEGDL | | ISAEVQAVFS |
DGAVSLHTRS | | LKYGKLGQGV | | LVQVSPSLVK | | RQKTHFHDLP | | CGASVILGNN |
GFIWIYPTPE | | HKEEEAGGFI | | ANLEPVSLAD | | REVISRLRNC | | IISLVTQRMM |
LYDTSILYCY | | EASLPHQIKD | | ILKPEIMEEI | | VMETRQRLLE | | QEG |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.
Література
- Mitchell P., Petfalski E., Shevchenko A., Mann M., Tollervey D. (1997). The exosome: a conserved eukaryotic RNA processing complex containing multiple 3'-->5' exoribonucleases. Cell. 91: 457—466. PMID 9390555 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80432-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mitchell P., Petfalski E., Tollervey D. (1996). The 3' end of yeast 5.8S rRNA is generated by an exonuclease processing mechanism. Genes Dev. 10: 502—513. PMID 8600032 DOI:10.1101/gad.10.4.502
- Lykke-Andersen J., Wagner E. (2005). Recruitment and activation of mRNA decay enzymes by two ARE-mediated decay activation domains in the proteins TTP and BRF-1. Genes Dev. 19: 351—361. PMID 15687258 DOI:10.1101/gad.1282305
- van Dijk E.L., Schilders G., Pruijn G.J. (2007). Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome, which is involved in various mRNA decay pathways. RNA. 13: 1027—1035. PMID 17545563 DOI:10.1261/rna.575107
- Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Exosome component 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17097 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q13868 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |