GBP1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1DG3, 1F5N, 2B8W, 2B92, 2BC9, 2D4H | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | GBP1, guanylate binding protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600411 HomoloGene: 133759 GeneCards: GBP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • Hsp90 protein binding • spectrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding • actin binding • hydrolase activity • GO:0019974 cytokine binding • GO:0006184 GTPase activity • GTP binding • GDP binding • protein homodimerization activity |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • extracellular region • цитоплазма • комплекс Ґольджі • vesicle membrane • actin cytoskeleton • GO:0016023 cytoplasmic vesicle |
---|
Біологічний процес | • процес імунної системи • interferon-gamma-mediated signaling pathway • negative regulation of T cell receptor signaling pathway • negative regulation of protein localization to plasma membrane • defense response to virus • regulation of calcium-mediated signaling • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • negative regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • regulation of protein localization to plasma membrane • protein homooligomerization • cellular response to interferon-gamma • cellular response to interleukin-1 • cellular response to tumor necrosis factor • protein localization to vacuole |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | XM_006224278 XM_006233425 XM_008761538 XM_017591353 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 89.05 – 89.07 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GBP1 (англ. Guanylate binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 592 амінокислот, а молекулярна маса — 67 931[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASEIHMTGP | | MCLIENTNGR | | LMANPEALKI | | LSAITQPMVV | | VAIVGLYRTG |
KSYLMNKLAG | | KKKGFSLGST | | VQSHTKGIWM | | WCVPHPKKPG | | HILVLLDTEG |
LGDVEKGDNQ | | NDSWIFALAV | | LLSSTFVYNS | | IGTINQQAMD | | QLYYVTELTH |
RIRSKSSPDE | | NENEVEDSAD | | FVSFFPDFVW | | TLRDFSLDLE | | ADGQPLTPDE |
YLTYSLKLKK | | GTSQKDETFN | | LPRLCIRKFF | | PKKKCFVFDR | | PVHRRKLAQL |
EKLQDEELDP | | EFVQQVADFC | | SYIFSNSKTK | | TLSGGIQVNG | | PRLESLVLTY |
VNAISSGDLP | | CMENAVLALA | | QIENSAAVQK | | AIAHYEQQMG | | QKVQLPTETL |
QELLDLHRDS | | EREAIEVFIR | | SSFKDVDHLF | | QKELAAQLEK | | KRDDFCKQNQ |
EASSDRCSAL | | LQVIFSPLEE | | EVKAGIYSKP | | GGYRLFVQKL | | QDLKKKYYEE |
PRKGIQAEEI | | LQTYLKSKES | | MTDAILQTDQ | | TLTEKEKEIE | | VERVKAESAQ |
ASAKMLQEMQ | | RKNEQMMEQK | | ERSYQEHLKQ | | LTEKMENDRV | | QLLKEQERTL |
ALKLQEQEQL | | LKEGFQKESR | | IMKNEIQDLQ | | TKMRRRKACT | | IS |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, антивірусний захист, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі. Також секретований назовні.
Література
- Cheng Y.-S.E., Patterson C.E., Staeheli P. (1991). Interferon-induced guanylate-binding proteins lack an N(T)KXD consensus motif and bind GMP in addition to GDP and GTP. Mol. Cell. Biol. 11: 4717—4725. PMID 1715024 DOI:10.1128/MCB.11.9.4717
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Modiano N., Lu Y.E., Cresswell P. (2005). Golgi targeting of human guanylate-binding protein-1 requires nucleotide binding, isoprenylation, and an IFN-gamma-inducible cofactor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 8680—8685. PMID 15937107 DOI:10.1073/pnas.0503227102
- Nordmann A., Wixler L., Boergeling Y., Wixler V., Ludwig S. (2012). A new splice variant of the human guanylate-binding protein 3 mediates anti-influenza activity through inhibition of viral transcription and replication. FASEB J. 26: 1290—1300. PMID 22106366 DOI:10.1096/fj.11-189886
- Prakash B., Praefcke G.J.K., Renault L., Wittinghofer A., Herrmann C. (2000). Structure of human guanylate-binding protein 1 representing a unique class of GTP-binding proteins. Nature. 403: 567—571. PMID 10676968 DOI:10.1038/35000617
- Prakash B., Renault L., Praefcke G.J., Herrmann C., Wittinghofer A. (2000). Triphosphate structure of guanylate-binding protein 1 and implications for nucleotide binding and GTPase mechanism. EMBO J. 19: 4555—4564. PMID 10970849 DOI:10.1093/emboj/19.17.4555
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4182 (англ.) . Архів оригіналу за 31 травня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P32455 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |