GNB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4KFM, 4PNK, 3KRX, 3KRW, 1GG2, 1OMW, 1GP2, 3AH8, 1XHM, 1TBG, 3PSC, 3PVU, 3UZS, 3CIK, 3PVW, 3V5W, 5HE2, 5HE0, 5HE3, 5HE1

Ідентифікатори

Символи

GNB1, G protein subunit beta 1, MRD42, MDS, HG2A

Зовнішні ІД

OMIM: 139380 MGI: 95781 HomoloGene: 55532 GeneCards: GNB1

Пов'язані генетичні захворювання

autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 42, global developmental delay-neuro-ophthalmological abnormalities-seizures-intellectual disability syndrome^[1]

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• spectrin binding • type 1 angiotensin receptor binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • signal transducer activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity • GTPase binding • G protein-coupled receptor binding • alkylglycerophosphoethanolamine phosphodiesterase activity
Клітинна компонента	• extracellular vesicle • cell body • мембрана • photoreceptor inner segment • myelin sheath • клітинна мембрана • photoreceptor outer segment • внутрішньоклітинний • lysosomal membrane • дендрит (нейробіологія) • photoreceptor disc membrane • heterotrimeric G-protein complex • photoreceptor outer segment membrane • екзосома • гіалоплазма
Біологічний процес	• cellular response to catecholamine stimulus • G protein-coupled acetylcholine receptor signaling pathway • adenylate cyclase-activating dopamine receptor signaling pathway • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • cellular response to glucagon stimulus • cellular response to prostaglandin E stimulus • platelet activation • cardiac muscle cell apoptotic process • phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • retina development in camera-type eye • Ras protein signal transduction • проліферація • cellular response to hypoxia • sensory perception of taste • GO:0072468 сигнальна трансдукція • rhodopsin mediated signaling pathway • protein heterotrimerization • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway • згортання білків • G protein-coupled receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2782


14688

Ensembl


ENSG00000078369


ENSMUSG00000029064

UniProt


P62873


P62874

RefSeq (мРНК)


NM_002074 NM_001282538 NM_001282539


NM_001160016 NM_001160017 NM_008142

RefSeq (білок)


NP_001269467 NP_001269468 NP_002065


NP_001153488 NP_001153489 NP_032168

Локус (UCSC)

Хр. 1: 1.79 – 1.89 Mb

Хр. 4: 155.58 – 155.64 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GNB1 (англ. G protein subunit beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 340 амінокислот, а молекулярна маса — 37 377^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSELDQLRQE	AEQLKNQIRD	ARKACADATL	SQITNNIDPV	GRIQMRTRRT
LRGHLAKIYA	MHWGTDSRLL	VSASQDGKLI	IWDSYTTNKV	HAIPLRSSWV
MTCAYAPSGN	YVACGGLDNI	CSIYNLKTRE	GNVRVSRELA	GHTGYLSCCR
FLDDNQIVTS	SGDTTCALWD	IETGQQTTTF	TGHTGDVMSL	SLAPDTRLFV
SGACDASAKL	WDVREGMCRQ	TFTGHESDIN	AICFFPNGNA	FATGSDDATC
RLFDLRADQE	LMTYSHDNII	CGITSVSFSK	SGRLLLAGYD	DFNCNVWDAL
KADRAGVLAG	HDNRVSCLGV	TDDGMAVATG	SWDSFLKIWN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків внутрішньоклітинного сигналінгу.

Література

Codina J., Stengel D., Woo S.L.C., Birnbaumer L. (1986). Beta-subunits of the human liver Gs/Gi signal-transducing proteins and those of bovine retinal rod cell transducin are identical. FEBS Lett. 207: 187—192. PMID 3095147 DOI:10.1016/0014-5793(86)81486-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Niu J., Profirovic J., Pan H., Vaiskunaite R., Voyno-Yasenetskaya T. (2003). G Protein betagamma subunits stimulate p114RhoGEF, a guanine nucleotide exchange factor for RhoA and Rac1: regulation of cell shape and reactive oxygen species production. Circ. Res. 93: 848—856. PMID 14512443 DOI:10.1161/01.RES.0000097607.14733.0C
Hill C., Goddard A., Ladds G., Davey J. (2009). The cationic region of Rhes mediates its interactions with specific Gbeta subunits. Cell. Physiol. Biochem. 23: 1—8. PMID 19255495 DOI:10.1159/000204075
Johnston C.A., Kimple A.J., Giguere P.M., Siderovski D.P. (2008). Structure of the parathyroid hormone receptor C terminus bound to the G-protein dimer Gbeta1gamma2. Structure. 16: 1086—1094. PMID 18611381 DOI:10.1016/j.str.2008.04.010
Johnston C.A., Kimple A.J., Giguere P.M., Siderovski D.P. (2011). Structure. 19: 1200—1200. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 21827955 DOI:10.1016/j.str.2011.07.010

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з GNB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з G protein subunit beta 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4396 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
↑ UniProt, P62873 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.