H3F3B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4H9O, 5BNX, 3JVK, 5DWQ, 4L58, 4TMP, 5DX0, 4H9S, 4W5A, 3AV2, 3WTP, 4HGA, 4GUS, 4GY5, 3MUK, 3QLC, 4H9Q, 4N4I, 4GU0, 4GNE, 5BNV, 2L43, 3MUL, 4H9P, 3QLA, 4QQ4, 4GNF, 4U7T, 3ASK, 4O62, 4GNG, 4GUR, 4H9N, 4H9R, 3ASL, 3QL9, 5AY8, 5JA4

Ідентифікатори

Символи

H3-3B, H3.3B, H3 histone, family 3B (H3.3B), H3 histone family member 3B, H3.3 histone B, H3F3B, H3-3A, BRYLIB2

Зовнішні ІД

OMIM: 601058 MGI: 1097686 HomoloGene: 134170 GeneCards: H3-3B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0031493 histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • nucleosomal DNA binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • хромосома • extracellular region • nuclear chromosome • екзосома • Тільце Барра • Нуклеосома • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• telomere organization • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • зсідання крові • positive regulation of cell growth • rDNA heterochromatin assembly • negative regulation of gene expression, epigenetic • male gonad development • multicellular organism growth • single fertilization • проліферація • embryo implantation • negative regulation of chromosome condensation • spermatid development • nucleus organization • osteoblast differentiation • pericentric heterochromatin assembly • Оогенез • subtelomeric heterochromatin assembly • Сперматогенез • GO:1903097, GO:1903098, GO:1903099 regulation of centromere complex assembly • muscle cell differentiation • nucleosome assembly • brain development • response to hormone • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of megakaryocyte differentiation • regulation of hematopoietic stem cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3021


15078

Ensembl


ENSG00000132475


ENSMUSG00000060743

UniProt


P84243


P84244

RefSeq (мРНК)


NM_005324


NM_008210

RefSeq (білок)


NP_005315


NP_032236 NP_032237

Локус (UCSC)

Хр. 17: 75.78 – 75.79 Mb

Хр. 1: 180.63 – 180.64 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

H3F3B (англ. H3 histone family member 3B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 136 амінокислот, а молекулярна маса — 15 328^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARTKQTARK	STGGKAPRKQ	LATKAARKSA	PSTGGVKKPH	RYRPGTVALR
EIRRYQKSTE	LLIRKLPFQR	LVREIAQDFK	TDLRFQSAAI	GALQEASEAY
LVGLFEDTNL	CAIHAKRVTI	MPKDIQLARR	IRGERA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Wells D., Kedes L. (1985). Structure of a human histone cDNA: evidence that basally expressed histone genes have intervening sequences and encode polyadenylylated mRNAs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82: 2834—2838. PMID 2859593 DOI:10.1073/pnas.82.9.2834
Wells D., Hoffman D., Kedes L. (1987). Unusual structure, evolutionary conservation of non-coding sequences and numerous pseudogenes characterize the human H3.3 histone multigene family. Nucleic Acids Res. 15: 2871—2889. PMID 3031613 DOI:10.1093/nar/15.7.2871
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lachner M., O'Carroll D., Rea S., Mechtler K., Jenuwein T. (2001). Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins. Nature. 410: 116—120. PMID 11242053 DOI:10.1038/35065132
Goto H., Yasui Y., Nigg E.A., Inagaki M. (2002). Aurora-B phosphorylates Histone H3 at serine28 with regard to the mitotic chromosome condensation. Genes Cells. 7: 11—17. PMID 11856369 DOI:10.1046/j.1356-9597.2001.00498.x
Preuss U., Landsberg G., Scheidtmann K.H. (2003). Novel mitosis-specific phosphorylation of histone H3 at Thr11 mediated by Dlk/ZIP kinase. Nucleic Acids Res. 31: 878—885. PMID 12560483 DOI:10.1093/nar/gkg176

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4764 (англ.) . Архів оригіналу за 19 липня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P84243 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.