HIST2H3A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2IIJ, 2X4W, 2X4X, 2X4Y, 3AV1, 3DB3, 3MO8, 3R93, 4MZF, 4MZG, 4MZH, 4OUC, 5BO0, 2HIO, 5B0Z, 2ARO, 1EQZ, 1HQ3, 4KGC, 1TZY, 4UUZ, 2F8N, 5B0Y, 4LD9, 5B40, 5CIU

Ідентифікатори

Символи

H3C15, H3/n, H3/o, histone cluster 2, H3a, histone cluster 2 H3 family member a, HIST2H3A, H3 clustered histone 15, H3C14, H3C13

Зовнішні ІД

MGI: 2448329 HomoloGene: 133885 GeneCards: H3C15

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein heterodimerization activity • DNA binding • GO:0031493 histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding • nucleosomal DNA binding
Клітинна компонента	• екзосома • extracellular region • нуклеоплазма • хромосома • Нуклеосома • клітинне ядро • Хроматин
Біологічний процес	• epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • зсідання крові • rDNA heterochromatin assembly • nucleosome assembly • negative regulation of gene expression, epigenetic • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • interleukin-7-mediated signaling pathway • regulation of megakaryocyte differentiation • regulation of hematopoietic stem cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


333932


260423

Ensembl


ENSG00000203852


ENSMUSG00000100210

UniProt


Q71DI3


P84228

RefSeq (мРНК)


NM_001005464


NM_013548

RefSeq (білок)


NP_066403 NP_001116847

NP_473386 NP_835734 NP_783584 NP_835510 NP_835587
NP_038576 NP_835511 NP_835512

Локус (UCSC)

Хр. 1: 149.85 – 149.85 Mb

Хр. 13: 23.73 – 23.73 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HIST2H3A (англ. Histone cluster 2 H3 family member c) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 136 амінокислот, а молекулярна маса — 15 388^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARTKQTARK	STGGKAPRKQ	LATKAARKSA	PATGGVKKPH	RYRPGTVALR
EIRRYQKSTE	LLIRKLPFQR	LVREIAQDFK	TDLRFQSSAV	MALQEASEAY
LVGLFEDTNL	CAIHAKRVTI	MPKDIQLARR	IRGERA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
Braastad C.D., Hovhannisyan H., van Wijnen A.J., Stein J.L., Stein G.S. (2004). Functional characterization of a human histone gene cluster duplication. Gene. 342: 35—40. PMID 15527963 DOI:10.1016/j.gene.2004.07.036
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lachner M., O'Carroll D., Rea S., Mechtler K., Jenuwein T. (2001). Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins. Nature. 410: 116—120. PMID 11242053 DOI:10.1038/35065132
Goto H., Yasui Y., Nigg E.A., Inagaki M. (2002). Aurora-B phosphorylates Histone H3 at serine28 with regard to the mitotic chromosome condensation. Genes Cells. 7: 11—17. PMID 11856369 DOI:10.1046/j.1356-9597.2001.00498.x
Preuss U., Landsberg G., Scheidtmann K.H. (2003). Novel mitosis-specific phosphorylation of histone H3 at Thr11 mediated by Dlk/ZIP kinase. Nucleic Acids Res. 31: 878—885. PMID 12560483 DOI:10.1093/nar/gkg176

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20505 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
↑ UniProt, Q71DI3 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.