HNRNPA3

Ідентифікатори

Символи

HNRNPA3, 2610510D13Rik, D10S102, FBRNP, HNRPA3, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3

Зовнішні ІД

OMIM: 605372 MGI: 1917171 GeneCards: HNRNPA3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA transmembrane transporter activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • messenger ribonucleoprotein complex • neuron projection • ribonucleoprotein granule • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • mRNA transport • Сплайсинг РНК • RNA metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


220988


229279

Ensembl


ENSG00000170144


ENSMUSG00000059005

UniProt


P51991


Q8BG05

RefSeq (мРНК)

NM_001330247 NM_001330248 NM_001330249 NM_001330250 NM_001330251
NM_194247 NM_001395170


NM_053263 NM_146130 NM_198090 NM_001359971

RefSeq (білок)

NP_001317176 NP_001317177 NP_001317178 NP_001317179 NP_001317180
NP_919223


NP_444493 NP_666242 NP_932758 NP_001346900

Локус (UCSC)

Хр. 2: 177.21 – 177.22 Mb

Хр. 2: 75.49 – 75.5 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HNRNPA3 (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 378 амінокислот, а молекулярна маса — 39 595^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVKPPPGRP	QPDSGRRRRR	RGEEGHDPKE	PEQLRKLFIG	GLSFETTDDS
LREHFEKWGT	LTDCVVMRDP	QTKRSRGFGF	VTYSCVEEVD	AAMCARPHKV
DGRVVEPKRA	VSREDSVKPG	AHLTVKKIFV	GGIKEDTEEY	NLRDYFEKYG
KIETIEVMED	RQSGKKRGFA	FVTFDDHDTV	DKIVVQKYHT	INGHNCEVKK
ALSKQEMQSA	GSQRGRGGGS	GNFMGRGGNF	GGGGGNFGRG	GNFGGRGGYG
GGGGGSRGSY	GGGDGGYNGF	GGDGGNYGGG	PGYSSRGGYG	GGGPGYGNQG
GGYGGGGGYD	GYNEGGNFGG	GNYGGGGNYN	DFGNYSGQQQ	SNYGPMKGGS
FGGRSSGSPY	GGGYGSGGGS	GGYGSRRF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24941 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P51991 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.