HNRNPR

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DK2

Ідентифікатори

Символи

HNRNPR, HNRPR, hnRNP-R, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R

Зовнішні ІД

OMIM: 607201 MGI: 1891692 HomoloGene: 4251 GeneCards: HNRNPR

Онтологія гена
Молекулярна функція	• mRNA 3'-UTR binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • mRNA binding
Клітинна компонента	• ядерце • цитоплазма • axon terminus • growth cone • клітинне ядро • внутрішньоклітинна мембранна органела • дендрит (нейробіологія) • ендоплазматичний ретикулум • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • нуклеоплазма • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• циркадний ритм • positive regulation of mRNA catabolic process • mRNA destabilization • GO:0048553 negative regulation of catalytic activity • mRNA processing • mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК • RNA metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10236


74326

Ensembl


ENSG00000282958 ENSG00000125944


ENSMUSG00000066037

UniProt


O43390


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001102397 NM_001102398 NM_001102399 NM_001297620 NM_001297621
NM_001297622 NM_005826


NM_001277121 NM_001277122 NM_001277123 NM_028871 NM_001355182

RefSeq (білок)

NP_001095867 NP_001095868 NP_001095869 NP_001284549 NP_001284550
NP_001284551 NP_005817


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 1: 23.3 – 23.34 Mb

Хр. 4: 136.04 – 136.09 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HNRNPR (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 633 амінокислот, а молекулярна маса — 70 943^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MANQVNGNAV	QLKEEEEPMD	TSSVTHTEHY	KTLIEAGLPQ	KVAERLDEIF
QTGLVAYVDL	DERAIDALRE	FNEEGALSVL	QQFKESDLSH	VQNKSAFLCG
VMKTYRQREK	QGSKVQESTK	GPDEAKIKAL	LERTGYTLDV	TTGQRKYGGP
PPDSVYSGVQ	PGIGTEVFVG	KIPRDLYEDE	LVPLFEKAGP	IWDLRLMMDP
LSGQNRGYAF	ITFCGKEAAQ	EAVKLCDSYE	IRPGKHLGVC	ISVANNRLFV
GSIPKNKTKE	NILEEFSKVT	EGLVDVILYH	QPDDKKKNRG	FCFLEYEDHK
SAAQARRRLM	SGKVKVWGNV	VTVEWADPVE	EPDPEVMAKV	KVLFVRNLAT
TVTEEILEKS	FSEFGKLERV	KKLKDYAFVH	FEDRGAAVKA	MDEMNGKEIE
GEEIEIVLAK	PPDKKRKERQ	AARQASRSTA	YEDYYYHPPP	RMPPPIRGRG
RGGGRGGYGY	PPDYYGYEDY	YDDYYGYDYH	DYRGGYEDPY	YGYDDGYAVR
GRGGGRGGRG	APPPPRGRGA	PPPRGRAGYS	QRGAPLGPPR	GSRGGRGGPA
QQQRGRGSRG	SRGNRGGNVG	GKRKADGYNQ	PDSKRRQTNN	QQNWGSQPIA
QQPLQQGGDY	SGNYGYNNDN	QEFYQDTYGQ	QWK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

Huang J., Chen X.H., Wu K., Xu P. (2005). Cloning and expression of a novel isoform of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein-R. NeuroReport. 16: 727—730. PMID 15858414 DOI:10.1097/00001756-200505120-00014
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5047 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O43390 (англ.) . Архів оригіналу за 24 жовтня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.