IGF2BP2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | IGF2BP2, IMP-2, IMP2, VICKZ2, insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608289 MGI: 1890358 HomoloGene: 4774 GeneCards: IGF2BP2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
цукровий діабет 2-го типу, Гестаційний цукровий діабет[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • mRNA 5'-UTR binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • translation regulator activity • mRNA 3'-UTR binding • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • цитоскелет • клітинне ядро • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • anatomical structure morphogenesis • negative regulation of translation • mRNA transport • regulation of translation • regulation of mRNA stability • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001007225 NM_001291869 NM_001291872 NM_001291873 NM_001291874
| NM_001291875 NM_006548 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001007226 NP_001278798 NP_001278801 NP_001278802 NP_001278803
| NP_001278804 NP_006539 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 185.64 – 185.83 Mb | Хр. 16: 21.88 – 21.98 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
IGF2BP2 (англ. Insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 599 амінокислот, а молекулярна маса — 66 121[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MMNKLYIGNL | | SPAVTADDLR | | QLFGDRKLPL | | AGQVLLKSGY | | AFVDYPDQNW |
AIRAIETLSG | | KVELHGKIME | | VDYSVSKKLR | | SRKIQIRNIP | | PHLQWEVLDG |
LLAQYGTVEN | | VEQVNTDTET | | AVVNVTYATR | | EEAKIAMEKL | | SGHQFENYSF |
KISYIPDEEV | | SSPSPPQRAQ | | RGDHSSREQG | | HAPGGTSQAR | | QIDFPLRILV |
PTQFVGAIIG | | KEGLTIKNIT | | KQTQSRVDIH | | RKENSGAAEK | | PVTIHATPEG |
TSEACRMILE | | IMQKEADETK | | LAEEIPLKIL | | AHNGLVGRLI | | GKEGRNLKKI |
EHETGTKITI | | SSLQDLSIYN | | PERTITVKGT | | VEACASAEIE | | IMKKLREAFE |
NDMLAVNQQA | | NLIPGLNLSA | | LGIFSTGLSV | | LSPPAGPRGA | | PPAAPYHPFT |
THSGYFSSLY | | PHHQFGPFPH | | HHSYPEQEIV | | NLFIPTQAVG | | AIIGKKGAHI |
KQLARFAGAS | | IKIAPAEGPD | | VSERMVIITG | | PPEAQFKAQG | | RIFGKLKEEN |
FFNPKEEVKL | | EAHIRVPSST | | AGRVIGKGGK | | TVNELQNLTS | | AEVIVPRDQT |
PDENEEVIVR | | IIGHFFASQT | | AQRKIREIVQ | | QVKQQEQKYP | | QGVASQRSK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, транспорт, транспорт мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Zhang J.-Y., Chan E.K.L., Peng X.-X., Tan E.M. (1999). A novel cytoplasmic protein with RNA-binding motifs is an autoantigen in human hepatocellular carcinoma. J. Exp. Med. 189: 1101—1110. PMID 10190901 DOI:10.1084/jem.189.7.1101
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Moraes K.C., Quaresma A.J., Maehnss K., Kobarg J. (2003). Identification and characterization of proteins that selectively interact with isoforms of the mRNA binding protein AUF1 (hnRNP D). Biol. Chem. 384: 25—37. PMID 12674497 DOI:10.1515/BC.2003.004
- Yisraeli J.K. (2005). VICKZ proteins: a multi-talented family of regulatory RNA-binding proteins. Biol. Cell. 97: 87—96. PMID 15601260 DOI:10.1042/BC20040151
- Le H.T., Sorrell A.M., Siddle K. (2012). Two isoforms of the mRNA binding protein IGF2BP2 are generated by alternative translational initiation. PLoS ONE. 7: E33140—E33140. PMID 22427968 DOI:10.1371/journal.pone.0033140
- Wachter K., Kohn M., Stohr N., Huttelmaier S. (2013). Subcellular localization and RNP formation of IGF2BPs (IGF2 mRNA-binding proteins) is modulated by distinct RNA-binding domains. Biol. Chem. 394: 1077—1090. PMID 23640942 DOI:10.1515/hsz-2013-0111
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з IGF2BP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28867 (англ.) . Архів оригіналу за 16 травня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y6M1 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |