ITGA5

ITGA5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3VI3, 3VI4, 4WJK, 4WK0, 4WK2, 4WK4

Ідентифікатори
Символи ITGA5, CD49e, FNRA, VLA5A, VLA-5, integrin subunit alpha 5
Зовнішні ІД OMIM: 135620 MGI: 96604 HomoloGene: 20508 GeneCards: ITGA5
Онтологія гена
Молекулярна функція

vascular endothelial growth factor receptor 2 binding
virus receptor activity
epidermal growth factor receptor binding
зв'язування з іоном металу
platelet-derived growth factor receptor binding
integrin binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
cell adhesion molecule binding

Клітинна компонента

цитоплазма
integral component of membrane
комплекс Ґольджі
alphav-beta3 integrin-vitronectin complex
мембрана
cell-cell junction
ruffle
клітинна мембрана
синапс
ruffle membrane
cell surface
integrin complex
ендоплазматичний ретикулум
GO:0016023 cytoplasmic vesicle
external side of plasma membrane
focal adhesion
міжклітинні контакти

Біологічний процес

leukocyte cell-cell adhesion
positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway
heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
endodermal cell differentiation
positive regulation of cell migration
heterotypic cell-cell adhesion
wound healing, spreading of epidermal cells
extracellular matrix organization
пам'ять
cell-cell adhesion mediated by integrin
positive regulation of sprouting angiogenesis
cell-substrate adhesion
адгезія клітин
Ангіогенез
positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
cell-substrate junction assembly
integrin-mediated signaling pathway
viral entry into host cell
GO:0022415 viral process
negative regulation of anoikis
leukocyte migration
positive regulation of cell-substrate adhesion
regulation of angiogenesis
cell adhesion mediated by integrin
жіноча вагітність

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3678
16402
Ensembl
ENSG00000161638
ENSMUSG00000000555
UniProt
P08648
P11688
RefSeq (мРНК)
NM_002205
NM_010577
NM_001314041
RefSeq (білок)
NP_002196
NP_001300970
NP_034707
Локус (UCSC) Хр. 12: 54.4 – 54.42 Mb Хр. 15: 103.25 – 103.28 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITGA5 (англ. Integrin subunit alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 049 амінокислот, а молекулярна маса — 114 536[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGSRTPESPLHAVQLRWGPRRRPPLLPLLLLLLPPPPRVGGFNLDAEAPA
VLSGPPGSFFGFSVEFYRPGTDGVSVLVGAPKANTSQPGVLQGGAVYLCP
WGASPTQCTPIEFDSKGSRLLESSLSSSEGEEPVEYKSLQWFGATVRAHG
SSILACAPLYSWRTEKEPLSDPVGTCYLSTDNFTRILEYAPCRSDFSWAA
GQGYCQGGFSAEFTKTGRVVLGGPGSYFWQGQILSATQEQIAESYYPEYL
INLVQGQLQTRQASSIYDDSYLGYSVAVGEFSGDDTEDFVAGVPKGNLTY
GYVTILNGSDIRSLYNFSGEQMASYFGYAVAATDVNGDGLDDLLVGAPLL
MDRTPDGRPQEVGRVYVYLQHPAGIEPTPTLTLTGHDEFGRFGSSLTPLG
DLDQDGYNDVAIGAPFGGETQQGVVFVFPGGPGGLGSKPSQVLQPLWAAS
HTPDFFGSALRGGRDLDGNGYPDLIVGSFGVDKAVVYRGRPIVSASASLT
IFPAMFNPEERSCSLEGNPVACINLSFCLNASGKHVADSIGFTVELQLDW
QKQKGGVRRALFLASRQATLTQTLLIQNGAREDCREMKIYLRNESEFRDK
LSPIHIALNFSLDPQAPVDSHGLRPALHYQSKSRIEDKAQILLDCGEDNI
CVPDLQLEVFGEQNHVYLGDKNALNLTFHAQNVGEGGAYEAELRVTAPPE
AEYSGLVRHPGNFSSLSCDYFAVNQSRLLVCDLGNPMKAGASLWGGLRFT
VPHLRDTKKTIQFDFQILSKNLNNSQSDVVSFRLSVEAQAQVTLNGVSKP
EAVLFPVSDWHPRDQPQKEEDLGPAVHHVYELINQGPSSISQGVLELSCP
QALEGQQLLYVTRVTGLNCTTNHPINPKGLELDPEGSLHHQQKREAPSRS
SASSGPQILKCPEAECFRLRCELGPLHQQESQSLQLHFRVWAKTFLQREH
QPFSLQCEAVYKALKMPYRILPRQLPQKERQVATAVQWTKAEGSYGVPLW
IIILAILFGLLLLGLLIYILYKLGFFKRSLPYGTAMEKAQLKPPATSDA

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Takada Y., Strominger J.L., Hemler M.E. (1987). The very late antigen family of heterodimers is part of a superfamily of molecules involved in adhesion and embryogenesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 3239—3243. PMID 3033641 DOI:10.1073/pnas.84.10.3239
  • Sano H., Liu S.C.H., Lane W.S., Piletz J.E., Lienhard G.E. (2002). Insulin receptor substrate 4 associates with the protein IRAS. J. Biol. Chem. 277: 19439—19447. PMID 11912194 DOI:10.1074/jbc.M111838200
  • Weigel-Kelley K.A., Yoder M.C., Srivastava A. (2003). Alpha5beta1 integrin as a cellular coreceptor for human parvovirus B19: requirement of functional activation of beta1 integrin for viral entry. Blood. 102: 3927—3933. PMID 12907437 DOI:10.1182/blood-2003-05-1522
  • Chen F.-H., Thomas A.O., Hecht J.T., Goldring M.B., Lawler J. (2005). Cartilage oligomeric matrix protein/thrombospondin 5 supports chondrocyte attachment through interaction with integrins. J. Biol. Chem. 280: 32655—32661. PMID 16051604 DOI:10.1074/jbc.M504778200
  • Paule S., Aljofan M., Simon C., Rombauts L.J., Nie G. (2012). Cleavage of endometrial alpha-integrins into their functional forms is mediated by proprotein convertase 5/6. Hum. Reprod. 27: 2766—2774. PMID 22740495 DOI:10.1093/humrep/des203

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6141 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.
  4. UniProt, P08648 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350