XRCC5 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4a/Protein_XRCC5_PDB_1jeq.png/250px-Protein_XRCC5_PDB_1jeq.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1JEQ, 1JEY, 1Q2Z, 1RW2, 3RZ9 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | XRCC5, KARP-1, KARP1, KU80, KUB2, Ku86, NFIV, Ku80, X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5, X-ray repair cross complementing 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 194364 MGI: 104517 HomoloGene: 40681 GeneCards: XRCC5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • nucleotide binding • double-stranded telomeric DNA binding • telomeric DNA binding • GO:0008026 helicase activity • 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity • GO:0004003 DNA helicase activity • hydrolase activity, acting on acid anhydrides • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • ubiquitin protein ligase binding • double-stranded DNA binding • damaged DNA binding • RNA binding • GO:0010577 enzyme activator activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • DNA end binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear telomere cap complex • мембрана • клітинна мембрана • нуклеоплазма • хромосома • ядерце • nonhomologous end joining complex • клітинне ядро • extracellular region • secretory granule lumen • protein-DNA complex • Ku70:Ku80 complex • GO:0009327 protein-containing complex • site of DNA damage • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • DNA recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of smooth muscle cell proliferation • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • positive regulation of neurogenesis • hematopoietic stem cell differentiation • double-strand break repair • negative regulation of t-circle formation • establishment of integrated proviral latency • проліферація • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of type I interferon production • cellular hyperosmotic salinity response • GO:0100026 Репарація ДНК • DNA duplex unwinding • brain development • cellular response to fatty acid • double-strand break repair via nonhomologous end joining • neutrophil degranulation • cellular response to gamma radiation • cellular response to X-ray • telomere maintenance • regulation of telomere maintenance • positive regulation of telomere maintenance via telomerase • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • positive regulation of protein kinase activity • positive regulation of telomerase activity • protein localization to chromosome, telomeric region • cellular response to leukemia inhibitory factor • activation of innate immune response • процес імунної системи • вроджений імунітет |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/PBB_GE_XRCC5_208642_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_XRCC5_208642_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a5/PBB_GE_XRCC5_208643_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_XRCC5_208643_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_009533 NM_001357519 NM_001357520 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_033559 NP_001344448 NP_001344449 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 216.11 – 216.21 Mb | Хр. 1: 72.35 – 72.43 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
Ku80 (англ. X-ray repair cross complementing 5) – білок, який кодується геном XRCC5, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 732 амінокислот, а молекулярна маса — 82 705[4]. Разом з Ku70 формують Ku-гетеродимер
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVRSGNKAAV | | VLCMDVGFTM | | SNSIPGIESP | | FEQAKKVITM | | FVQRQVFAEN |
KDEIALVLFG | | TDGTDNPLSG | | GDQYQNITVH | | RHLMLPDFDL | | LEDIESKIQP |
GSQQADFLDA | | LIVSMDVIQH | | ETIGKKFEKR | | HIEIFTDLSS | | RFSKSQLDII |
IHSLKKCDIS | | LQFFLPFSLG | | KEDGSGDRGD | | GPFRLGGHGP | | SFPLKGITEQ |
QKEGLEIVKM | | VMISLEGEDG | | LDEIYSFSES | | LRKLCVFKKI | | ERHSIHWPCR |
LTIGSNLSIR | | IAAYKSILQE | | RVKKTWTVVD | | AKTLKKEDIQ | | KETVYCLNDD |
DETEVLKEDI | | IQGFRYGSDI | | VPFSKVDEEQ | | MKYKSEGKCF | | SVLGFCKSSQ |
VQRRFFMGNQ | | VLKVFAARDD | | EAAAVALSSL | | IHALDDLDMV | | AIVRYAYDKR |
ANPQVGVAFP | | HIKHNYECLV | | YVQLPFMEDL | | RQYMFSSLKN | | SKKYAPTEAQ |
LNAVDALIDS | | MSLAKKDEKT | | DTLEDLFPTT | | KIPNPRFQRL | | FQCLLHRALH |
PREPLPPIQQ | | HIWNMLNPPA | | EVTTKSQIPL | | SKIKTLFPLI | | EAKKKDQVTA |
QEIFQDNHED | | GPTAKKLKTE | | QGGAHFSVSS | | LAEGSVTSVG | | SVNPAENFRV |
LVKQKKASFE | | EASNQLINHI | | EQFLDTNETP | | YFMKSIDCIR | | AFREEAIKFS |
EEQRFNNFLK | | ALQEKVEIKQ | | LNHFWEIVVQ | | DGITLITKEE | | ASGSSVTAEE |
AKKFLAPKDK | | PSGDTAAVFE | | EGGDVDDLLD | | MI |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Oderwald H., Hughes M.J., Jost J.-P. (1996). Non-histone protein 1 (NHP1) is a member of the Ku protein family which is upregulated in differentiating mouse myoblasts and human promyelocytes. FEBS Lett. 382: 313—318. PMID 8605992 DOI:10.1016/0014-5793(96)00189-5
- Stuiver M.H., Coenjaerts F.E.J., van der Vlied P.C. (1990). The autoantigen Ku is indistinguishable from NF IV, a protein forming multimeric protein-DNA complexes. J. Exp. Med. 172: 1049—1054. PMID 2212941 DOI:10.1084/jem.172.4.1049
- Cao Q.P., Pitt S., Leszyk J., Baril E.F. (1994). DNA-dependent ATPase from HeLa cells is related to human Ku autoantigen. Biochemistry. 33: 8548—8557. PMID 8031790 DOI:10.1021/bi00194a021
- Chan D.W., Ye R., Veillette C.J., Lees-Miller S.P. (1999). DNA-dependent protein kinase phosphorylation sites in Ku 70/80 heterodimer. Biochemistry. 38: 1819—1828. PMID 10026262 DOI:10.1021/bi982584b
- Wang H., Fang R., Cho J.-Y., Libermann T.A., Oettgen P. (2004). Positive and negative modulation of the transcriptional activity of the ETS factor ESE-1 through interaction with p300, CREB-binding protein, and Ku 70/86. J. Biol. Chem. 279: 25241—25250. PMID 15075319 DOI:10.1074/jbc.M401356200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12833 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P13010 (англ.) . Архів оригіналу за 11 травня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |