L-пластин

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2D85

Ідентифікатори

Символи

LCP1, CP64, HEL-S-37, L-PLASTIN, LC64P, LPL, PLS2, lymphocyte cytosolic protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 153430 MGI: 104808 HomoloGene: 80174 GeneCards: LCP1

Пов'язані генетичні захворювання

fatty liver disease^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • actin filament binding • identical protein binding • GTPase binding • actin binding • integrin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • cell projection • мембрана • focal adhesion • Філоподія • ruffle • клітинна мембрана • stress fiber • ruffle membrane • мікрофіламент • actin cytoskeleton • actin filament bundle • podosome • phagocytic cup • екзосома • цитоскелет • міжклітинний простір • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm
Біологічний процес	• extracellular matrix disassembly • positive regulation of podosome assembly • actin filament bundle assembly • regulation of intracellular protein transport • animal organ regeneration • protein kinase A signaling • cell migration • wound healing, spreading of cells • T cell activation involved in immune response • actin filament network formation • actin crosslink formation • interleukin-12-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3936


18826

Ensembl


ENSG00000136167


ENSMUSG00000021998

UniProt


P13796


Q61233

RefSeq (мРНК)


NM_002298


NM_001247984 NM_008879

RefSeq (білок)


NP_002289 NP_002289.2


NP_001234913 NP_032905

Локус (UCSC)

Хр. 13: 46.13 – 46.21 Mb

Хр. 14: 75.37 – 75.47 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

L-пластин (англ. Lymphocyte cytosolic protein 1) – білок, який кодується геном LCP1, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 627 амінокислот, а молекулярна маса — 70 288^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARGSVSDEE	MMELREAFAK	VDTDGNGYIS	FNELNDLFKA	ACLPLPGYRV
REITENLMAT	GDLDQDGRIS	FDEFIKIFHG	LKSTDVAKTF	RKAINKKEGI
CAIGGTSEQS	SVGTQHSYSE	EEKYAFVNWI	NKALENDPDC	RHVIPMNPNT
NDLFNAVGDG	IVLCKMINLS	VPDTIDERTI	NKKKLTPFTI	QENLNLALNS
ASAIGCHVVN	IGAEDLKEGK	PYLVLGLLWQ	VIKIGLFADI	ELSRNEALIA
LLREGESLED	LMKLSPEELL	LRWANYHLEN	AGCNKIGNFS	TDIKDSKAYY
HLLEQVAPKG	DEEGVPAVVI	DMSGLREKDD	IQRAECMLQQ	AERLGCRQFV
TATDVVRGNP	KLNLAFIANL	FNRYPALHKP	ENQDIDWGAL	EGETREERTF
RNWMNSLGVN	PRVNHLYSDL	SDALVIFQLY	EKIKVPVDWN	RVNKPPYPKL
GGNMKKLENC	NYAVELGKNQ	AKFSLVGIGG	QDLNEGNRTL	TLALIWQLMR
RYTLNILEEI	GGGQKVNDDI	IVNWVNETLR	EAKKSSSISS	FKDPKISTSL
PVLDLIDAIQ	PGSINYDLLK	TENLNDDEKL	NNAKYAISMA	RKIGARVYAL
PEDLVEVNPK	MVMTVFACLM	GKGMKRV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lin C.-S., Aebersold R.H., Kent S.B., Varma M., Leavitt J. (1988). Molecular cloning and characterization of plastin, a human leukocyte protein expressed in transformed human fibroblasts. Mol. Cell. Biol. 8: 4659—4668. PMID 3211125 DOI:10.1128/MCB.8.11.4659
Lin C.-S., Aebersold R.H., Leavitt J. (1990). Correction of the N-terminal sequences of the human plastin isoforms by using anchored polymerase chain reaction: identification of a potential calcium-binding domain. Mol. Cell. Biol. 10: 1818—1821. PMID 2378651 DOI:10.1128/MCB.10.4.1818
Matsushima K., Shiroo M., Kung H.F., Copeland T.D. (1988). Purification and characterization of a cytosolic 65-kilodalton phosphoprotein in human leukocytes whose phosphorylation is augmented by stimulation with interleukin 1. Biochemistry. 27: 3765—3770. PMID 3261603 DOI:10.1021/bi00410a037
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Lin C.-S., Park T., Chen Z.P., Leavitt J. (1993). Human plastin genes. Comparative gene structure, chromosome location, and differential expression in normal and neoplastic cells. J. Biol. Chem. 268: 2781—2792. PMID 8428952

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з L-пластин переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6528 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 30 січня 2017.
↑ UniProt, P13796 (англ.) . Архів оригіналу за 24 січня 2017. Процитовано 30 січня 2017.