LDB2

Ідентифікатори

Символи

LDB2, CLIM1, LDB1, LDB-2, LIM domain binding 2

Зовнішні ІД

OMIM: 603450 MGI: 894670 HomoloGene: 989 GeneCards: LDB2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• enzyme binding • LIM domain binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • transcription regulator complex • cell leading edge • ядерце • клітинна мембрана
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • hair follicle development • positive regulation of cellular component biogenesis • epithelial structure maintenance • somatic stem cell population maintenance • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of kinase activity • regulation of cell migration • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9079


16826

Ensembl


ENSG00000169744


ENSMUSG00000039706

UniProt


O43679


O55203

RefSeq (мРНК)


NM_001130834 NM_001290 NM_001304434 NM_001304435

NM_001077398 NM_001286348 NM_010698 NM_001347349 NM_001359070
NM_001359071

RefSeq (білок)


NP_001124306 NP_001281 NP_001291363 NP_001291364

NP_001070866 NP_001273277 NP_001334278 NP_034828 NP_001345999
NP_001346000

Локус (UCSC)

Хр. 4: 16.5 – 16.9 Mb

Хр. 5: 44.63 – 44.96 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LDB2 (англ. LIM domain binding 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 373 амінокислот, а молекулярна маса — 42 793^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSTPHDPFY	SSPFGPFYRR	HTPYMVQPEY	RIYEMNKRLQ	SRTEDSDNLW
WDAFATEFFE	DDATLTLSFC	LEDGPKRYTI	GRTLIPRYFS	TVFEGGVTDL
YYILKHSKES	YHNSSITVDC	DQCTMVTQHG	KPMFTKVCTE	GRLILEFTFD
DLMRIKTWHF	TIRQYRELVP	RSILAMHAQD	PQVLDQLSKN	ITRMGLTNFT
LNYLRLCVIL	EPMQELMSRH	KTYNLSPRDC	LKTCLFQKWQ	RMVAPPAEPT
RQPTTKRRKR	KNSTSSTSNS	SAGNNANSTG	SKKKTTAANL	SLSSQVPDVM
VVGEPTLMGG	EFGDEDERLI	TRLENTQYDA	ANGMDDEEDF	NNSPALGNNS
PWNSKPPATQ	ETKSENPPPQ	ASQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Semina E.V., Altherr M.R., Murray J.C. (1998). Cloning and chromosomal localization of two novel human genes encoding LIM-domain binding factors CLIM1 and CLIM2/LDB1/NLI. Mamm. Genome. 9: 921—924. PMID 9799849 DOI:10.1007/s003359900899
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6533 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O43679 (англ.) . Архів оригіналу за 8 листопада 2016. Процитовано 30 серпня 2017.