LRAT

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4Q95

Ідентифікатори

Символи

LRAT, LCA14, lecithin retinol acyltransferase (phosphatidylcholine--retinol O-acyltransferase), lecithin retinol acyltransferase

Зовнішні ІД

OMIM: 604863 MGI: 1891259 HomoloGene: 3483 GeneCards: LRAT

Пов'язані генетичні захворювання

Leber congenital amaurosis 14^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• acyltransferase activity • retinol binding • O-acyltransferase activity • transferase activity • retinoic acid binding • lecithin:11-cis retinol acyltransferase activity • O-palmitoyltransferase activity • phosphatidylcholine-retinol O-acyltransferase activity
Клітинна компонента	• ендоплазматичний ретикулум • цитоплазма • ендосома • integral component of membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • endoplasmic reticulum membrane • multivesicular body • rough endoplasmic reticulum • perinuclear region of cytoplasm
Біологічний процес	• vitamin A metabolic process • зір • retinoid metabolic process • відповідь на стимул • positive regulation of lipid transport • cellular response to leukemia inhibitory factor • retinol metabolic process • response to retinoic acid • response to vitamin A • response to bacterium
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9227


79235

Ensembl


ENSG00000121207


ENSMUSG00000028003

UniProt


O95237


Q9JI60

RefSeq (мРНК)


NM_001301645 NM_004744


NM_023624

RefSeq (білок)


NP_001288574 NP_004735


NP_076113

Локус (UCSC)

Хр. 4: 154.63 – 154.75 Mb

Хр. 3: 82.8 – 82.81 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LRAT (англ. Lecithin retinol acyltransferase (phosphatidylcholine--retinol O-acyltransferase)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 230 амінокислот, а молекулярна маса — 25 703^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKNPMLEVVS	LLLEKLLLIS	NFTLFSSGAA	GEDKGRNSFY	ETSSFHRGDV
LEVPRTHLTH	YGIYLGDNRV	AHMMPDILLA	LTDDMGRTQK	VVSNKRLILG
VIVKVASIRV	DTVEDFAYGA	NILVNHLDES	LQKKALLNEE	VARRAEKLLG
FTPYSLLWNN	CEHFVTYCRY	GTPISPQSDK	FCETVKIIIR	DQRSVLASAV
LGLASIVCTG	LVSYTTLPAI	FIPFFLWMAG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ацилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, ендосомах.

Література

Zolfaghari R., Ross A.C. (2004). Cloning, gene organization and identification of an alternative splicing process in lecithin:retinol acyltransferase cDNA from human liver. Gene. 341: 181—188. PMID 15474300 DOI:10.1016/j.gene.2004.06.043
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mondal M.S., Ruiz A., Bok D., Rando R.R. (2000). Lecithin retinol acyltransferase contains cysteine residues essential for catalysis. Biochemistry. 39: 5215—5220. PMID 10819989 DOI:10.1021/bi9929554

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LRAT переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6685 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O95237 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.