LRRTM1

Ідентифікатори

Символи

LRRTM1, entrez:347730, leucine rich repeat transmembrane neuronal 1

Зовнішні ІД

OMIM: 610867 MGI: 2389173 HomoloGene: 41763 GeneCards: LRRTM1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase inhibitor activity • молекулярна функція
Клітинна компонента	• integral component of membrane • postsynaptic membrane • мембрана • growth cone • клітинна мембрана • синапс • excitatory synapse • cell surface • аксон • міжклітинні контакти • ендоплазматичний ретикулум • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • integral component of postsynaptic specialization membrane
Біологічний процес	• locomotory behavior • negative regulation of protein kinase activity • cytokine-mediated signaling pathway • negative regulation of receptor internalization • synapse organization • exploration behavior • protein localization to synapse • довготривала потенціація • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • positive regulation of synapse assembly • GO:0022610 життєдіяльність • regulation of postsynaptic density assembly • regulation of presynapse assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


347730


74342

Ensembl


ENSG00000162951


ENSMUSG00000060780

UniProt


Q86UE6


Q8K377

RefSeq (мРНК)


NM_178839


NM_028880 NM_001362109

RefSeq (білок)


NP_849161


NP_083156 NP_001349038

Локус (UCSC)

Хр. 2: 80.29 – 80.3 Mb

Хр. 6: 77.22 – 77.23 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LRRTM1 (англ. Leucine rich repeat transmembrane neuronal 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 58 641^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDFLLLGLCL	YWLLRRPSGV	VLCLLGACFQ	MLPAAPSGCP	QLCRCEGRLL
YCEALNLTEA	PHNLSGLLGL	SLRYNSLSEL	RAGQFTGLMQ	LTWLYLDHNH
ICSVQGDAFQ	KLRRVKELTL	SSNQITQLPN	TTFRPMPNLR	SVDLSYNKLQ
ALAPDLFHGL	RKLTTLHMRA	NAIQFVPVRI	FQDCRSLKFL	DIGYNQLKSL
ARNSFAGLFK	LTELHLEHND	LVKVNFAHFP	RLISLHSLCL	RRNKVAIVVS
SLDWVWNLEK	MDLSGNEIEY	MEPHVFETVP	HLQSLQLDSN	RLTYIEPRIL
NSWKSLTSIT	LAGNLWDCGR	NVCALASWLN	NFQGRYDGNL	QCASPEYAQG
EDVLDAVYAF	HLCEDGAEPT	SGHLLSAVTN	RSDLGPPASS	ATTLADGGEG
QHDGTFEPAT	VALPGGEHAE	NAVQIHKVVT	GTMALIFSFL	IVVLVLYVSW
KCFPASLRQL	RQCFVTQRRK	QKQKQTMHQM	AAMSAQEYYV	DYKPNHIEGA
LVIINEYGSC	TCHQQPAREC	EV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Lauren J., Airaksinen M.S., Saarma M., Timmusk T.T. (2003). A novel gene family encoding leucine-rich repeat transmembrane proteins differentially expressed in the nervous system. Genomics. 81: 411—421. PMID 12676565 DOI:10.1016/S0888-7543(03)00030-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19408 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q86UE6 (англ.) . Архів оригіналу за 11 лютого 2017. Процитовано 28 серпня 2017.