NEIL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1TDH, 4NRV, 5ITY, 5ITQ, 5ITU, 5ITX, 5ITR, 5ITT

Ідентифікатори

Символи

NEIL1, FPG1, NEI1, hFPG1, nei like DNA glycosylase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608844 MGI: 1920024 HomoloGene: 11616 GeneCards: NEIL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • zinc ion binding • hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds • damaged DNA binding • protein C-terminus binding • каталітична активність • lyase activity • nucleic acid binding • hydrolase activity • DNA N-glycosylase activity • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • хромосома • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• nucleotide-excision repair • GO:0001306 response to oxidative stress • cellular response to DNA damage stimulus • depyrimidination • negative regulation of nuclease activity • обмін речовин • GO:0100026 Репарація ДНК • base-excision repair
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79661


72774

Ensembl


ENSG00000140398


ENSMUSG00000032298

UniProt


Q96FI4


Q8K4Q6

RefSeq (мРНК)


NM_001256552 NM_024608 NM_001352519 NM_001352520


NM_028347 NM_001357409

RefSeq (білок)


NP_001243481 NP_078884 NP_001339448 NP_001339449


NP_082623 NP_001344338

Локус (UCSC)

Хр. 15: 75.35 – 75.36 Mb

Хр. 9: 57.05 – 57.06 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NEIL1 (англ. Nei like DNA glycosylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 43 684^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPEGPELHLA	SQFVNEACRA	LVFGGCVEKS	SVSRNPEVPF	ESSAYRISAS
ARGKELRLIL	SPLPGAQPQQ	EPLALVFRFG	MSGSFQLVPR	EELPRHAHLR
FYTAPPGPRL	ALCFVDIRRF	GRWDLGGKWQ	PGRGPCVLQE	YQQFRENVLR
NLADKAFDRP	ICEALLDQRF	FNGIGNYLRA	EILYRLKIPP	FEKARSVLEA
LQQHRPSPEL	TLSQKIRTKL	QNPDLLELCH	SVPKEVVQLG	GKGYGSESGE
EDFAAFRAWL	RCYGMPGMSS	LQDRHGRTIW	FQGDPGPLAP	KGRKSRKKKS
KATQLSPEDR	VEDALPPSKA	PSRTRRAKRD	LPKRTATQRP	EGTSLQQDPE
APTVPKKGRR	KGRQAASGHC	RPRKVKADIP	SLEPEGTSAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, глікозидаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bandaru V., Sunkara S., Wallace S.S., Bond J.P. (2002). A novel human DNA glycosylase that removes oxidative DNA damage and is homologous to Escherichia coli endonuclease VIII. DNA Repair. 1: 517—529. PMID 12509226 DOI:10.1016/S1568-7864(02)00036-8
Dou H., Mitra S., Hazra T.K. (2003). Repair of oxidized bases in DNA bubble structures by human DNA glycosylases NEIL1 and NEIL2. J. Biol. Chem. 278: 49679—49684. PMID 14522990 DOI:10.1074/jbc.M308658200
Hildrestrand G.A., Rolseth V., Bjoras M., Luna L. (2007). Human NEIL1 localizes with the centrosomes and condensed chromosomes during mitosis. DNA Repair. 6: 1425—1433. PMID 17556049 DOI:10.1016/j.dnarep.2007.04.008
Yeo J., Goodman R.A., Schirle N.T., David S.S., Beal P.A. (2010). RNA editing changes the lesion specificity for the DNA repair enzyme NEIL1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 20715—20719. PMID 21068368 DOI:10.1073/pnas.1009231107
Doublie S., Bandaru V., Bond J.P., Wallace S.S. (2004). The crystal structure of human endonuclease VIII-like 1 (NEIL1) reveals a zincless finger motif required for glycosylase activity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 10284—10289. PMID 15232006 DOI:10.1073/pnas.0402051101

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18448 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96FI4 (англ.) . Архів оригіналу за 17 листопада 2016. Процитовано 11 вересня 2017.