NLRC3

Ідентифікатори

Символи

NLRC3, CLR16.2, NOD3, NLR family, CARD domain containing 3, NLR family CARD domain containing 3

Зовнішні ІД

OMIM: 615648 MGI: 2444070 HomoloGene: 18720 GeneCards: NLRC3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • ATP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit binding • молекулярна функція
Клітинна компонента	• цитоплазма • центр організації мікротрубочок • гіалоплазма • perinuclear region of cytoplasm
Біологічний процес	• negative regulation of interleukin-6 production • negative regulation of tumor necrosis factor production • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • T cell activation • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • negative regulation of interferon-alpha production • negative regulation of interferon-beta production • negative regulation of innate immune response • negative regulation of fibroblast proliferation • negative regulation of epithelial cell proliferation • negative regulation of inflammatory response • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response • negative regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly • negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling • GO:0007243 intracellular signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


197358


268857

Ensembl


ENSG00000167984


ENSMUSG00000049871

UniProt


Q7RTR2


Q5DU56

RefSeq (мРНК)


NM_178844


NM_001081280 NM_175547

RefSeq (білок)


NP_849172


NP_001074749 NP_780756

Локус (UCSC)

Хр. 16: 3.54 – 3.58 Mb

Хр. 16: 3.76 – 3.79 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NLRC3 (англ. NLR family CARD domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 065 амінокислот, а молекулярна маса — 114 658^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRKQEVRTGR	EAGQGHGTGS	PAEQVKALMD	LLAGKGSQGS	QAPQALDRTP
DAPLGPCSND	SRIQRHRKAL	LSKVGGGPEL	GGPWHRLASL	LLVEGLTDLQ
LREHDFTQVE	ATRGGGHPAR	TVALDRLFLP	LSRVSVPPRV	SITIGVAGMG
KTTLVRHFVR	LWAHGQVGKD	FSLVLPLTFR	DLNTHEKLCA	DRLICSVFPH
VGEPSLAVAV	PARALLILDG	LDECRTPLDF	SNTVACTDPK	KEIPVDHLIT
NIIRGNLFPE	VSIWITSRPS	ASGQIPGGLV	DRMTEIRGFN	EEEIKVCLEQ
MFPEDQALLG	WMLSQVQADR	ALYLMCTVPA	FCRLTGMALG	HLWRSRTGPQ
DAELWPPRTL	CELYSWYFRM	ALSGEGQEKG	KASPRIEQVA	HGGRKMVGTL
GRLAFHGLLK	KKYVFYEQDM	KAFGVDLALL	QGAPCSCFLQ	REETLASSVA
YCFTHLSLQE	FVAAAYYYGA	SRRAIFDLFT	ESGVSWPRLG	FLTHFRSAAQ
RAMQAEDGRL	DVFLRFLSGL	LSPRVNALLA	GSLLAQGEHQ	AYRTQVAELL
QGCLRPDAAV	CARAINVLHC	LHELQHTELA	RSVEEAMESG	ALARLTGPAH
RAALAYLLQV	SDACAQEANL	SLSLSQGVLQ	SLLPQLLYCR	KLRLDTNQFQ
DPVMELLGSV	LSGKDCRIQK	ISLAENQISN	KGAKALARSL	LVNRSLTSLD
LRGNSIGPQG	AKALADALKI	NRTLTSLSLQ	GNTVRDDGAR	SMAEALASNR
TLSMLHLQKN	SIGPMGAQRM	ADALKQNRSL	KELMFSSNSI	GDGGAKALAE
ALKVNQGLES	LDLQSNSISD	AGVAALMGAL	CTNQTLLSLS	LRENSISPEG
AQAIAHALCA	NSTLKNLDLT	ANLLHDQGAR	AIAVAVRENR	TLTSLHLQWN
FIQAGAAQAL	GQALQLNRSL	TSLDLQENAI	GDDGACAVAR	ALKVNTALTA
LYLQVASIGA	SGAQVLGEAL	AVNRTLEILD	LRGNAIGVAG	AKALANALKV
NSSLRRLNLQ	ENSLGMDGAI	CIATALSGNH	RLQHINLQGN	HIGDSGARMI
SEAIKTNAPT	CTVEM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Inohara N., Nunez G. (2003). NODs: intracellular proteins involved in inflammation and apoptosis. Nat. Rev. Immunol. 3: 371—382. PMID 12766759 DOI:10.1038/nri1086
Gueltekin Y., Eren E., Oezoeren N. (2015). Overexpressed NLRC3 acts as an anti-inflammatory cytosolic protein. J. Innate Immun. 7: 25—36. PMID 25277106 DOI:10.1159/000363602

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29889 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q7RTR2 (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.