NLRP1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4f/PDB_1pn5_EBI.jpg/250px-PDB_1pn5_EBI.jpg) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1PN5, 3KAT, 4IFP, 4IM6 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NLRP1, CARD7, CIDED, CLR17.1, DEFCAP, DEFCAP-L/S, NAC, NALP1, PP1044, SLEV1, VAMAS1, NLR family, pyrin domain containing 1, NLR family pyrin domain containing 1, MSPC, AIADK, JRRP |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606636 MGI: 3582959 HomoloGene: 19080 GeneCards: NLRP1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
corneal intraepithelial dyskeratosis-palmoplantar hyperkeratosis-laryngeal dyskeratosis syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein domain specific binding • nucleotide binding • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process • ATP binding • enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • inflammasome complex • клітинне ядро • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • гіалоплазма • NLRP1 inflammasome complex |
---|
Біологічний процес | • neuron apoptotic process • regulation of apoptotic process • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • response to muramyl dipeptide • GO:0097285 апоптоз • defense response to bacterium • regulation of inflammatory response • процес імунної системи • inflammatory response • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • NLRP1 inflammasome complex assembly • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0a/PBB_GE_NLRP1_210113_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_NLRP1_210113_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/66/PBB_GE_NLRP1_211824_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_NLRP1_211824_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c1/PBB_GE_NLRP1_211822_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_NLRP1_211822_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_033007 NM_001033053 NM_014922 NM_033004 NM_033006 |
| | NM_001039680 NM_001040696 NM_001162414 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001028225 NP_055737 NP_127497 NP_127499 NP_127500 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 5.5 – 5.62 Mb | Хр. 11: 71.04 – 71.12 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NLRP1 (англ. NLR family pyrin domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 473 амінокислот, а молекулярна маса — 165 866[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAGGAWGRLA | | CYLEFLKKEE | | LKEFQLLLAN | | KAHSRSSSGE | | TPAQPEKTSG |
MEVASYLVAQ | | YGEQRAWDLA | | LHTWEQMGLR | | SLCAQAQEGA | | GHSPSFPYSP |
SEPHLGSPSQ | | PTSTAVLMPW | | IHELPAGCTQ | | GSERRVLRQL | | PDTSGRRWRE |
ISASLLYQAL | | PSSPDHESPS | | QESPNAPTST | | AVLGSWGSPP | | QPSLAPREQE |
APGTQWPLDE | | TSGIYYTEIR | | EREREKSEKG | | RPPWAAVVGT | | PPQAHTSLQP |
HHHPWEPSVR | | ESLCSTWPWK | | NEDFNQKFTQ | | LLLLQRPHPR | | SQDPLVKRSW |
PDYVEENRGH | | LIEIRDLFGP | | GLDTQEPRIV | | ILQGAAGIGK | | STLARQVKEA |
WGRGQLYGDR | | FQHVFYFSCR | | ELAQSKVVSL | | AELIGKDGTA | | TPAPIRQILS |
RPERLLFILD | | GVDEPGWVLQ | | EPSSELCLHW | | SQPQPADALL | | GSLLGKTILP |
EASFLITART | | TALQNLIPSL | | EQARWVEVLG | | FSESSRKEYF | | YRYFTDERQA |
IRAFRLVKSN | | KELWALCLVP | | WVSWLACTCL | | MQQMKRKEKL | | TLTSKTTTTL |
CLHYLAQALQ | | AQPLGPQLRD | | LCSLAAEGIW | | QKKTLFSPDD | | LRKHGLDGAI |
ISTFLKMGIL | | QEHPIPLSYS | | FIHLCFQEFF | | AAMSYVLEDE | | KGRGKHSNCI |
IDLEKTLEAY | | GIHGLFGAST | | TRFLLGLLSD | | EGEREMENIF | | HCRLSQGRNL |
MQWVPSLQLL | | LQPHSLESLH | | CLYETRNKTF | | LTQVMAHFEE | | MGMCVETDME |
LLVCTFCIKF | | SRHVKKLQLI | | EGRQHRSTWS | | PTMVVLFRWV | | PVTDAYWQIL |
FSVLKVTRNL | | KELDLSGNSL | | SHSAVKSLCK | | TLRRPRCLLE | | TLRLAGCGLT |
AEDCKDLAFG | | LRANQTLTEL | | DLSFNVLTDA | | GAKHLCQRLR | | QPSCKLQRLQ |
LVSCGLTSDC | | CQDLASVLSA | | SPSLKELDLQ | | QNNLDDVGVR | | LLCEGLRHPA |
CKLIRLGLDQ | | TTLSDEMRQE | | LRALEQEKPQ | | LLIFSRRKPS | | VMTPTEGLDT |
GEMSNSTSSL | | KRQRLGSERA | | ASHVAQANLK | | LLDVSKIFPI | | AEIAEESSPE |
VVPVELLCVP | | SPASQGDLHT | | KPLGTDDDFW | | GPTGPVATEV | | VDKEKNLYRV |
HFPVAGSYRW | | PNTGLCFVMR | | EAVTVEIEFC | | VWDQFLGEIN | | PQHSWMVAGP |
LLDIKAEPGA | | VEAVHLPHFV | | ALQGGHVDTS | | LFQMAHFKEE | | GMLLEKPARV |
ELHHIVLENP | | SFSPLGVLLK | | MIHNALRFIP | | VTSVVLLYHR | | VHPEEVTFHL |
YLIPSDCSIR | | KAIDDLEMKF | | QFVRIHKPPP | | LTPLYMGCRY | | TVSGSGSGML |
EILPKELELC | | YRSPGEDQLF | | SEFYVGHLGS | | GIRLQVKDKK | | DETLVWEALV |
KPGDLMPATT | | LIPPARIAVP | | SPLDAPQLLH | | FVDQYREQLI | | ARVTSVEVVL |
DKLHGQVLSQ | | EQYERVLAEN | | TRPSQMRKLF | | SLSQSWDRKC | | KDGLYQALKE |
THPHLIMELW | | EKGSKKGLLP | | LSS |
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Bertin J., DiStefano P.S. (2000). The PYRIN domain: a novel motif found in apoptosis and inflammation proteins. Cell Death Differ. 7: 1273—1274. PMID 11270363 DOI:10.1038/sj.cdd.4400774
- Martinon F., Hofmann K., Tschopp J. (2001). The pyrin domain: a possible member of the death domain-fold family implicated in apoptosis and inflammation. Curr. Biol. 11: R118—R120. PMID 11250163 DOI:10.1016/S0960-9822(01)00056-2
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Martinon F., Burns K., Tschopp J. (2002). The inflammasome: a molecular platform triggering activation of inflammatory caspases and processing of proIL-beta. Mol. Cell. 10: 417—426. PMID 12191486 DOI:10.1016/S1097-2765(02)00599-3
- Liao K.C., Mogridge J. (2009). Expression of Nlrp1b inflammasome components in human fibroblasts confers susceptibility to anthrax lethal toxin. Infect. Immun. 77: 4455—4462. PMID 19651869 DOI:10.1128/IAI.00276-09
- Postigo A., Cross J.R., Downward J., Way M. (2006). Interaction of F1L with the BH3 domain of Bak is responsible for inhibiting vaccinia-induced apoptosis. Cell Death Differ. 13: 1651—1662. PMID 16439990 DOI:10.1038/sj.cdd.4401853
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з NLRP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14374 (англ.) . Архів оригіналу за 3 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9C000 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |